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實驗技巧:血管生成實驗的結果進行數(shù)據(jù)分析步驟詳解

瀏覽次數(shù):1099 發(fā)布日期:2024-8-20  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負

血管生成實驗作為一種簡約而高效的體外研究方法,旨在篩選具備抑制或促進血管形成潛力的物質。這些效應可通過精確量化的參數(shù)進行評估,諸如新生血管的長度,以及在基質膠基質上形成的血管環(huán)的數(shù)量等客觀指標。

為確保血管生成實驗能產出準確且可重復的結果,必須在實驗設計、執(zhí)行及后續(xù)分析的全過程中,審慎考慮多個關鍵方面。本應用指南旨在為從血管生成實驗中采集的數(shù)據(jù)提供系統(tǒng)化分析框架,并深入解析這些數(shù)據(jù)背后的生物學意義。為進一步優(yōu)化您的分析流程,請遵循以下應用指南中的相關指引:
 

血管生成實驗流程

ibidi為血管生成實驗提供各種解決方案:

相關說明文件:

ibidi血管生成實驗| 可節(jié)省90%基質膠!消除凹液面的方法!

血管生成實驗解決方案,手把手教學!

血管生成實驗的關鍵分析指標;

 

術語「血管」用于描述在已形成的網(wǎng)絡中可見的細胞束,這并不代表這些細胞束具有內部腔道。如圖 2,從血管網(wǎng)絡的相差顯微鏡鏡檢圖像中可提取出四個關鍵的量化分析指標:

  • 細胞覆蓋面積(單位:%,以藍色區(qū)域標示)
  • 管長(單位:px,以紅線標示)
  • 環(huán)路數(shù)(單位:個,以黃色數(shù)字標示)
  • 分支點數(shù)(單位:個,以白點標示)
  •  

在實驗過程中,上述關鍵指標展現(xiàn)出顯著的相關性,因此,實驗者不妨僅從中選擇一個指標作為分析基礎——在本應用指南中,特選定管長作為衡量血管生成的關鍵指標,以簡化分析過程并保持科學嚴謹性。

相位對比圖像(A)和分析圖像(B)顯示了管形成分析的關鍵特征:細胞覆蓋面積(藍色),管(紅色),環(huán)(黃色)和分支點(白色)。

 

進一步的價值,例如平均管長,總管長和環(huán)的平均面積,可以從這些參數(shù)中計算出來。

 

計算總管長度
可使用各種專用于管形分析的軟件進行圖像分析。

自動化管形成分析的示例輸出示例。

數(shù)據(jù)解讀:

血管生成是一個錯綜復雜的生理過程,其中交織著多種生化反應與信號通路。為確保統(tǒng)計分析的準確性和代表性,強烈建議在每個處理條件下至少設置 3 個平行重復。

為了獲取可靠的數(shù)據(jù)及平均值,推薦實施多孔分析策略,即針對每種實驗條件進行多次重復測量。具體而言,每個分析孔應獨立記錄管長度值,隨后計算每種條件下所有測量值的平均值及標準差(standard deviation)。理想情況下,同一載玻片、相同條件下收集的數(shù)據(jù)點間標準差應控制在 10% 以內。若孔間差異顯著超出此范圍,建議參照以下應用指南,對實驗條件進行細致調整與優(yōu)化:血管生成實驗的實驗裝置優(yōu)化和數(shù)據(jù)分析

下面展示了在 Matrigel 基質膠上,兩種不同條件(條件 1 與條件 2)下培養(yǎng)的 HUVEC 細胞的總管長變化。這些圖像通過搭載于相差顯微鏡上的 ibidi 載物臺上培養(yǎng)箱捕獲,針對每種條件,均在四個時間點(0 h、4 h、6 h 及24 h)對 8 個獨立孔進行了成像記錄。

在 Matrigel 基質膠上,兩種不同條件(條件 1 與條件 2)下培養(yǎng)的 HUVEC 細胞的總管長變化,以散點圖(左)以及箱線圖(右)兩種形式呈現(xiàn)。

隨后,將各個數(shù)據(jù)點整合并展示在箱線圖中,以便于直觀分析數(shù)據(jù)分布。對于統(tǒng)計分析,可采用諸如方差分析(ANOVA)或 t 檢驗等方法,這些方法能夠有效地檢驗不同條件下數(shù)據(jù)點之間的差異。具體而言,t 檢驗能夠評估兩個獨立數(shù)據(jù)集(其差異遵循 t 分布)之間是否存在統(tǒng)計學上的顯著差異,從而為我們提供關于數(shù)據(jù)差異是否顯著的科學依據(jù)。

 

 

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