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實驗技巧:血管生成實驗的結(jié)果進(jìn)行數(shù)據(jù)分析步驟詳解

瀏覽次數(shù):1100 發(fā)布日期:2024-8-20  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

血管生成實驗作為一種簡約而高效的體外研究方法,旨在篩選具備抑制或促進(jìn)血管形成潛力的物質(zhì)。這些效應(yīng)可通過精確量化的參數(shù)進(jìn)行評估,諸如新生血管的長度,以及在基質(zhì)膠基質(zhì)上形成的血管環(huán)的數(shù)量等客觀指標(biāo)。

為確保血管生成實驗?zāi)墚a(chǎn)出準(zhǔn)確且可重復(fù)的結(jié)果,必須在實驗設(shè)計、執(zhí)行及后續(xù)分析的全過程中,審慎考慮多個關(guān)鍵方面。本應(yīng)用指南旨在為從血管生成實驗中采集的數(shù)據(jù)提供系統(tǒng)化分析框架,并深入解析這些數(shù)據(jù)背后的生物學(xué)意義。為進(jìn)一步優(yōu)化您的分析流程,請遵循以下應(yīng)用指南中的相關(guān)指引:
 

血管生成實驗流程

ibidi為血管生成實驗提供各種解決方案:

相關(guān)說明文件:

ibidi血管生成實驗| 可節(jié)省90%基質(zhì)膠!消除凹液面的方法!

血管生成實驗解決方案,手把手教學(xué)!

血管生成實驗的關(guān)鍵分析指標(biāo);

 

術(shù)語「血管」用于描述在已形成的網(wǎng)絡(luò)中可見的細(xì)胞束,這并不代表這些細(xì)胞束具有內(nèi)部腔道。如圖 2,從血管網(wǎng)絡(luò)的相差顯微鏡鏡檢圖像中可提取出四個關(guān)鍵的量化分析指標(biāo):

  • 細(xì)胞覆蓋面積(單位:%,以藍(lán)色區(qū)域標(biāo)示)
  • 管長(單位:px,以紅線標(biāo)示)
  • 環(huán)路數(shù)(單位:個,以黃色數(shù)字標(biāo)示)
  • 分支點數(shù)(單位:個,以白點標(biāo)示)
  •  

在實驗過程中,上述關(guān)鍵指標(biāo)展現(xiàn)出顯著的相關(guān)性,因此,實驗者不妨僅從中選擇一個指標(biāo)作為分析基礎(chǔ)——在本應(yīng)用指南中,特選定管長作為衡量血管生成的關(guān)鍵指標(biāo),以簡化分析過程并保持科學(xué)嚴(yán)謹(jǐn)性。

相位對比圖像(A)和分析圖像(B)顯示了管形成分析的關(guān)鍵特征:細(xì)胞覆蓋面積(藍(lán)色),管(紅色),環(huán)(黃色)和分支點(白色)。

 

進(jìn)一步的價值,例如平均管長,總管長和環(huán)的平均面積,可以從這些參數(shù)中計算出來。

 

計算總管長度
可使用各種專用于管形分析的軟件進(jìn)行圖像分析。

自動化管形成分析的示例輸出示例。

數(shù)據(jù)解讀:

血管生成是一個錯綜復(fù)雜的生理過程,其中交織著多種生化反應(yīng)與信號通路。為確保統(tǒng)計分析的準(zhǔn)確性和代表性,強(qiáng)烈建議在每個處理條件下至少設(shè)置 3 個平行重復(fù)。

為了獲取可靠的數(shù)據(jù)及平均值,推薦實施多孔分析策略,即針對每種實驗條件進(jìn)行多次重復(fù)測量。具體而言,每個分析孔應(yīng)獨立記錄管長度值,隨后計算每種條件下所有測量值的平均值及標(biāo)準(zhǔn)差(standard deviation)。理想情況下,同一載玻片、相同條件下收集的數(shù)據(jù)點間標(biāo)準(zhǔn)差應(yīng)控制在 10% 以內(nèi)。若孔間差異顯著超出此范圍,建議參照以下應(yīng)用指南,對實驗條件進(jìn)行細(xì)致調(diào)整與優(yōu)化:血管生成實驗的實驗裝置優(yōu)化和數(shù)據(jù)分析

下面展示了在 Matrigel 基質(zhì)膠上,兩種不同條件(條件 1 與條件 2)下培養(yǎng)的 HUVEC 細(xì)胞的總管長變化。這些圖像通過搭載于相差顯微鏡上的 ibidi 載物臺上培養(yǎng)箱捕獲,針對每種條件,均在四個時間點(0 h、4 h、6 h 及24 h)對 8 個獨立孔進(jìn)行了成像記錄。

在 Matrigel 基質(zhì)膠上,兩種不同條件(條件 1 與條件 2)下培養(yǎng)的 HUVEC 細(xì)胞的總管長變化,以散點圖(左)以及箱線圖(右)兩種形式呈現(xiàn)。

隨后,將各個數(shù)據(jù)點整合并展示在箱線圖中,以便于直觀分析數(shù)據(jù)分布。對于統(tǒng)計分析,可采用諸如方差分析(ANOVA)或 t 檢驗等方法,這些方法能夠有效地檢驗不同條件下數(shù)據(jù)點之間的差異。具體而言,t 檢驗?zāi)軌蛟u估兩個獨立數(shù)據(jù)集(其差異遵循 t 分布)之間是否存在統(tǒng)計學(xué)上的顯著差異,從而為我們提供關(guān)于數(shù)據(jù)差異是否顯著的科學(xué)依據(jù)。

 

 

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