LightBench分析系統(tǒng)在無創(chuàng)產(chǎn)前檢測中的應用
瀏覽次數(shù):3572 發(fā)布日期:2021-7-7
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為什么要做無創(chuàng)DNA產(chǎn)前檢測
我國為出生缺陷的高發(fā)國,在每年約1600萬的新生兒中,先天性致愚致殘缺陷兒占每年出生人口總數(shù)的4%-6%,總數(shù)高達120萬,占全世界每年500多萬出生缺陷兒童的五分之一。由此給社會造成了嚴重的經(jīng)濟負擔,對家庭造成的心理負擔和精神痛苦更是無法用金錢來衡量。無創(chuàng)DNA產(chǎn)前檢測技術的臨床應用會為我國出生缺陷兒的產(chǎn)前檢測做出極大貢獻。
什么是無創(chuàng)DNA產(chǎn)前檢測技術
無創(chuàng)DNA產(chǎn)前檢測,又稱為無創(chuàng)產(chǎn)前DNA檢測、無創(chuàng)胎兒染色體非整倍體檢測等。無創(chuàng)DNA產(chǎn)前檢測技術僅需采取孕婦靜脈血,利用新一代DNA測序技術對母體外周血漿中的游離DNA片段(包含胎兒游離DNA)進行測序,并將測序結(jié)果進行生物信息分析,可以從中得到胎兒的遺傳信息,從而檢測胎兒是否患三大染色體疾病。
無創(chuàng)DNA產(chǎn)前檢測面臨的困境
無創(chuàng)產(chǎn)前篩查(NIPT)為患者和醫(yī)療科研人員提供了一種高度敏感和特異的檢測染色體異常的方法。不過困難的是,從孕婦抽取的血液中天然胎兒DNA的水平較低,這意味著檢測成本的增加。原因是由于母親血液中只有一小部分DNA來自胎兒。這意味著大部分被測序的DNA來自母親而不是胎兒,這浪費了大量的時間、金錢和人力去進行DNA測序!除此之外,在游離細胞池中有些胎兒DNA含量異常低,這些準媽媽們可能會面臨不準確的檢測結(jié)果。
如何使用LightBench分析系統(tǒng)進行產(chǎn)前檢測
LightBench分析系統(tǒng)是市面上唯一的核酸三合一全自動分析系統(tǒng),各個功能之間可以獨立運行,也可以聯(lián)合使用。
獲得孕婦外周血血清后,從血清中提取DNA,再從總DNA中收集符合長度在100-200bp的片段,因為這個長度的游離DNA片段中,胎兒的DNA片段所占比例最高,有利于后續(xù)檢測。
LightBench分析系統(tǒng)可以直接將200-300bp的DNA目標片段分離純化,并進行精確定量和定性分析。
LightBench在無創(chuàng)產(chǎn)前檢測中的優(yōu)勢
使用LightBench通過片段長度的大小來選擇富集胎兒的DNA部分,為臨床醫(yī)生降低了測試成本和減少了無效測試數(shù)量。為您節(jié)省了時間和成本,并為患者提供更好的結(jié)果。
Ranger技術可以有效地從母體游離的DNA(cfDNA)中回收短的、富含胎兒的DNA片段。通過測序數(shù)據(jù)與參考基因組的比對確定插入片段大小。
允許您通過游離的DNA的大小來篩選胎兒DNA富集的部分,確保平均回收率超過70%。
可以將母體游離DNA中的胎兒部分,增加至正常水平的一倍。由于測序價格較高,這樣避免了在目標DNA之外測序上的花費。
為了評估Ranger技術的大小選擇精度,按100% -(2x CV%)計算,該圖顯示了30個cfDNA測序文庫的數(shù)據(jù),這些文庫的大小經(jīng)過選擇,用于回收305 bp以下的所有片段。測序數(shù)據(jù)顯示最終大小的標準偏差為3 bp,變異系數(shù)為1%,精度為98%。從而得出了Ranger技術可回收長達 300 個堿基對的片段,并具有至少 97% 的可重復性的精確度指標。
儀器參數(shù)
*全自動片段篩選回收
回收范圍廣:25bp-50kb
通量高:12個/run
速度快:300bp<20 min
準確度高:CV<5%
回收得率高:78%以上,成本低
*實時核酸片段分析
范圍:40bp-50kb
通量:24-96/run
分辨率:<10 bp
成本低
*快速定量分析
基于熒光,特異性強,準確度和Qubit類似
通量:96,384/run
速度快,成本低