導(dǎo)讀
乳腺癌是女性中最常見的癌癥之一，其發(fā)病機制復(fù)雜，涉及多種基因突變和信號通路的改變。其中，ESR1突變是已知的乳腺癌激素治療耐藥的重要機制。檢測ESR1突變狀態(tài)有助于選擇更合適的治療方案。并且，針對ESR1突變的靶向治療藥物，如Elacestrant（ORSERDUTM），已被FDA和EMA批準用于治療ESR1突變陽性，ER+、HER-晚期或轉(zhuǎn)移性乳腺癌。綜上所述，ESR1突變檢測對于乳腺癌患者的治療決策、預(yù)后評估以及個性化治療策略的制定具有重要的臨床意義。

近日，雅典大學(xué)和雅典大都會綜合醫(yī)院的研究人員在The Journal of Liquid Biopsy發(fā)表了題為Multiplex detection of ten ESR1 mutations and AKT1 E17K in breast cancer using digital PCR 的文章。該研究開發(fā)并評估了一種新型多重數(shù)字PCR檢測方法（12plex ESR1-AKT 6 色 Crystal Digital PCR^® assay）的性能，用于檢測ER+乳腺癌患者的血漿cfDNA（cell free DNA）中的十種常見ESR1突變和AKT1 E17K突變。

 研究亮點：
▶  開發(fā)了一種新型的12plex ESR1-AKT 6 色 Crystal Digital PCR^® 檢測技術(shù)，能夠同時檢測10種ESR1突變和AKT1 E17K突變, 能夠節(jié)省成本和樣本量，同時提高了檢測的效率。
▶  該技術(shù)具有高靈敏度和高特異性的特點，可以在血漿cfDNA中檢測低豐度的突變，這些突變與內(nèi)分泌治療的抵抗性有關(guān)。
▶  該技術(shù)整個檢測流程可以在3小時內(nèi)完成，對于臨床決策和治療調(diào)整具有重要意義。

實驗結(jié)果：
本研究針對十種乳腺癌中常見ESR1突變位點、AKT1 E17K突變和TSN內(nèi)參基因的數(shù)字PCR多重檢測方法。這些突變與乳腺癌內(nèi)分泌治療的進展和耐藥性密切相關(guān)。每個突變位點設(shè)計相應(yīng)的引物和探針，其中ESR1的十種突變、AKT1 E17K突變和TSN在同一反應(yīng)體系中同時進行檢測。通過不同的熒光標記區(qū)分不同的突變位點，使得每個突變位點的信號可以獨立地進行定量檢測。

▲ESR1-AKT 6 色 Crystal Digital PCR^® assay：Crystal Miner（數(shù)據(jù)分析軟件） 2D 點圖上陽性和陰性群體位置示意圖。

為了評估多重檢測方法對ESR1和AKT1突變的檢測靈敏度，作者按照臨床和實驗室標準研究所（CLSI）EP17-A2標準確定了空白值（LoB）和檢測限（LoD），如下表所示。

該研究使用了來自9名接受激素治療的ER+乳腺癌并已確診轉(zhuǎn)移患者在5年隨訪期間不同時間點采集的35份血漿cfDNA樣本，以及10名健康捐獻者的樣本。這些樣本之前曾使用ESR1-NAPA（Normalized Allelic Prevalence Analysis）檢測法進行過ESR1突變的分析。

使用ESR1-AKT 6色Crystal Digital PCR^® assay方法在這些樣本中檢測到的AKT1 E17K突變的突變等位基因頻率（MAF%）范圍為1.1%到37.0%，而ESR1 D538G突變的MAF%范圍為1.6%到27.6%（見下表）。

作者進一步將多重ESR1-AKT 6色Crystal Digital PCR^® assay的結(jié)果與ESR1 NAPA檢測進行了比較（結(jié)果見下表）�；�于Cohen's kappa系數(shù)（k）的直接比較顯示，Crystal Digital PCR^® assay和ESR1 NAPA在檢測突變方面具有高度一致性。

 結(jié)論：

通過Crystal Digital數(shù)字PCR技術(shù)，研究人員成功開發(fā)高效、創(chuàng)新的高階多重檢測乳腺癌ESR1相關(guān)突變的方法，為乳腺癌的ESR1突變檢測提供了更精準的工具，也為個性化治療提供了支持。隨著數(shù)字PCR技術(shù)的進一步推廣和應(yīng)用，未來乳腺癌的早期篩查、精準診斷和個性化治療將邁向新高度。

參考文獻：
Smilkou, S., Ntzifa, A., Stergiopoulou, D., Georgoulias, V., & Lianidou, E. (2024). Multiplex detection of ten ESR1 mutations and AKT1 E17K in breast cancer using digital PCR. The Journal of Liquid Biopsy, 5, 100154. https://doi.org/10.1016/j.jlb.2024.100154

實體瘤突變檢測可用于患者全病程管理（基因分型、靶向藥檢測、療效和預(yù)后評估、復(fù)發(fā)監(jiān)測），艾普拜生物已開發(fā)測試針對多種樣本類型（體液、新鮮冰凍組織、FFPE）的常見突變數(shù)字PCR檢測試劑盒，詳情見下表。另，有多款數(shù)字PCR試劑盒可用于血液腫瘤全病程管理和病原微生物檢測。歡迎咨詢和訂購。