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代謝組學(xué)在關(guān)于兩種單菌種發(fā)酵的豆瓣醬代謝組學(xué)方面差異研究中的應(yīng)用

瀏覽次數(shù):1004 發(fā)布日期:2022-12-28  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

生活離不開柴米油鹽醬醋茶,其中醬油是中國傳統(tǒng)的調(diào)味品,主要是由大豆經(jīng)過發(fā)酵釀造而成。醬油由醬演變而來,早在三千多年前,中國就有制作醬的記載了。

本期百趣代謝組學(xué)文獻(xiàn)分享為大家分享的文獻(xiàn)是百趣生物協(xié)助客戶發(fā)表的關(guān)于兩種單菌種發(fā)酵的豆瓣醬代謝組方面差異研究(IF=5.399 中科院工程2區(qū)),下面我們來看看具體研究內(nèi)容吧。

 

1.代謝組學(xué)分享-研究背景
許多真菌已從一些天然發(fā)酵的豆瓣醬中分離并培養(yǎng)出來,如曲霉菌、青霉菌等。其中一些真菌在發(fā)酵過程中會產(chǎn)生各種酶等有機(jī)物,并分解大豆蛋白,使豆瓣醬營養(yǎng)豐富,口感獨特,易于消化吸收。百趣代謝組學(xué)分享,發(fā)酵過程產(chǎn)生的氨基酸態(tài)氮(AAN)又稱氨基氮,是測定發(fā)酵能力的重要指標(biāo)。AAN是醬油質(zhì)量的重要指標(biāo),AAN含量的高低可作為衡量鮮味程度的指標(biāo),也與醬油風(fēng)味的形成密切相關(guān)。

目前大多數(shù)研究都是在工廠大規(guī);旌习l(fā)酵的豆瓣醬樣品,而對單一菌種發(fā)酵豆瓣醬的代謝系統(tǒng)和途徑的研究較少。代謝組學(xué)分享,在作者之前的研究中,從中國東北遼寧省的自制豆瓣醬樣品中分離到具有蛋白酶活性的光滑青霉(Penicillium glabrum)GQ1-3米曲霉(Aspergillus oryzae)HGPA20。本研究利用這兩種菌株對大豆進(jìn)行發(fā)酵,以測定發(fā)酵過程中AAN的含量。利用代謝組檢測發(fā)酵系統(tǒng)中的代謝物,以確定兩株菌株發(fā)酵過程中代謝物的差異。

2.代謝組學(xué)分享-研究方法

實驗分組P. glabrum GQ1-3、A. oryzae HGPA20

檢測方法:GC-TOF-MS

數(shù)據(jù)分析:PCA、OPLS-DA、KEGG分析、通路分析(MetaboAnalys)

3.代謝組學(xué)分享-研究結(jié)果

(1)AAN含量隨發(fā)酵時間的變化

從圖1可以看出,隨著發(fā)酵時間的增加,初始AAN含量穩(wěn)步增加,且在發(fā)酵第40天達(dá)到最大值。隨后,兩種真菌的AAN含量逐漸下降。代謝組學(xué)分享,發(fā)酵開始時,HGPA20體系的AAN含量高于GQ1-3,但在發(fā)酵第40天同時達(dá)到最大值,GQ1-3的豆瓣醬發(fā)酵速度要快于HGPA20。兩種真菌的AAN含量是動態(tài)變化的。因此選擇AAN達(dá)到最大值的第40天發(fā)酵樣品進(jìn)行代謝組學(xué)分析。
 

圖1 發(fā)酵豆瓣醬中氨基氮含量隨時間的變化


(2)差異代謝物分析
從兩組的PCA模型和OPLS-DA模型中,發(fā)現(xiàn)兩組之間的差異顯著,且樣本均在置信區(qū)間內(nèi)(圖2a,2b)。

圖2 PCA模型得分圖(a)和OPLS-DA模型得分圖(b)
 

對發(fā)酵第40天的樣品進(jìn)行代謝組學(xué)檢測,共檢測到350個代謝物,通過VIP>1&P<0.05篩選到的差異代謝物如圖3所示。在圖中可以觀察到明顯的代謝物分組差異。代謝組學(xué)分享,由圖3可知,GQ1-3體系中有12種相對含量較高的氨基酸及其衍生物,而HGPA20體系中只有7種相對含量較高的氨基酸。GQ1-3中相對含量較高的有機(jī)酸有7種,HGPA20中相對含量較高的有15種。在GQ1-3中檢測到4種相對含量較高的糖和醇,而在HGPA20中檢測到3種糖和醇。此外,在HGPA20樣品中還檢出了相對含量較高的吡啶、醛、酮和酚類物質(zhì)。且在兩菌株的發(fā)酵體系中發(fā)現(xiàn)了不同的醇類。說明,兩菌株在豆瓣醬發(fā)酵過程中的代謝產(chǎn)物豐富多樣,且兩組之間存在明顯差異。
 

圖3 GQ1-3和HGPA20層次聚類分析熱力圖


(3)通路分析
代謝途徑分析的結(jié)果顯示在氣泡圖中(圖4),從圖中可以看出,丙氨酸、天門冬氨酸和谷氨酸代謝與差異代謝產(chǎn)物和發(fā)酵過程的相關(guān)性最高。代謝組學(xué)分享,谷氨酸和天冬氨酸是食品中主要的兩種含鮮味的游離氨基酸,均屬于谷氨酸類鮮味物質(zhì),是豆瓣醬鮮味的重要來源。在兩株菌株的發(fā)酵體系中,檢測到的兩種氨基酸及其衍生物的相對含量差異很大。GQ1-3中谷氨酰胺的相對含量較高,而HGPA20中天冬氨酸和天冬酰胺的相對含量較高,說明兩株發(fā)酵的豆瓣醬中鮮味物質(zhì)的組成存在差異。另一個重要的代謝途徑是三羧酸循環(huán),該代謝途徑連接許多代謝過程。
 

圖4 GQ1-3和HGPA20的通路分析圖


另外,作者將兩菌株的一些代謝途徑及相關(guān)代謝產(chǎn)物進(jìn)行整合(圖5)。紅色差異代謝物表示在GQ1-3體系中相對含量較高,藍(lán)色差異代謝物表示在HGPA20體系中相對含量較高。如圖5所示,部分氨基酸合成以2-酮戊二酸為底物來合成谷氨酸、谷氨酰胺等。

生成的谷氨酸由轉(zhuǎn)乙酰酶等一系列酶合成鳥氨酸和瓜氨酸。GQ1-3中2-酮戊二酸、谷氨酰胺、鳥氨酸和瓜氨酸的相對含量明顯高于HGPA20。氨基酸合成的另一部分以草酰乙酸為底物合成天冬氨酸、天冬酰胺等物質(zhì)。

天冬氨酸是由一系列酶如天冬氨酸激酶合成的半醛,最終產(chǎn)生L-高絲氨酸。HGPA20體系中天冬氨酸、天冬酰胺和L-高絲氨酸的相對含量明顯高于GQ1-3。代謝組學(xué)分享,因此推測,兩株菌株中氨基酸的主要合成途徑不同,在GQ1-3中,α -酮戊二酸衍生型(谷氨酸型)的氨基酸合成占優(yōu)勢,而在HGPA20中草酰乙酸衍生型(天冬氨酸型)的占優(yōu)勢。

圖5 GQ1-3、HGPA20部分代謝通路及相關(guān)差異代謝物整合圖

代謝組學(xué)分享,綜上所述,反映了兩種真菌代謝行為的差異。單菌種P. glabrum及其代謝產(chǎn)物的研究尚屬首次報道,而A. oryzae作為一種廣泛應(yīng)用的發(fā)酵菌株,在醬油、米酒等相關(guān)發(fā)酵食品中已有報道。由于A.oryzae不同種類的發(fā)酵基質(zhì)、發(fā)酵過程和發(fā)酵菌株的不同,發(fā)酵過程產(chǎn)生的代謝物也存在差異。本研究結(jié)果有助于補充和豐富米曲霉的發(fā)酵潛力。

來源:上海百趣生物醫(yī)學(xué)科技有限公司
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