什么是多重PCR?
多重PCR(multiplex Polymerase Chain Reaction,mPCR)也稱復(fù)合PCR,它是在同一PCR反應(yīng)體系中加入一對以上引物,各對引物分別結(jié)合在模板相對應(yīng)位置,最終擴增出一條以上目的DNA片段(圖1),其反應(yīng)原理、反應(yīng)試劑和操作過程與一般PCR相同。
▲ 圖1:多重PCR反應(yīng)示意圖(圖源網(wǎng)絡(luò),侵刪)
熒光定量PCR可以實現(xiàn)多重PCR嗎?
當(dāng)然是可以的,熒光定量PCR除了常規(guī)的單基因定量外,也是可以實現(xiàn)多個基因的同時檢測。單基因檢測我們一般使用染料法,通過染料分子與雙鏈DNA的結(jié)合來進(jìn)行PCR反應(yīng)的實時監(jiān)測,但是這種結(jié)合是非特異的,我們無法區(qū)分同一個PCR反應(yīng)體系中的多個目的DNA片段,因此需要采用另一種方式來同時進(jìn)行多基因的檢測,也就是探針法。
▲ 圖2:染料法和探針法的檢測原理(圖源網(wǎng)絡(luò),侵刪)
探針法通過與模板特異性結(jié)合的探針解決了特異性的問題,同時不同的探針可以標(biāo)記不同的熒光基團(tuán),通過對不同探針之間的識別,從而實現(xiàn)對多個基因的同時檢測和定量。但是這又帶來一個問題,就是在針對不同基因設(shè)計探針時該如何選擇熒光基團(tuán)呢?
在選擇熒光基團(tuán)時首先要考慮一個問題,您要使用的儀器所配置的熒光通道是怎樣的,這里就以Azure Cielo™ 6實時熒光定量PCR系統(tǒng)和Stilla naica® 6色微滴芯片式數(shù)字PCR系統(tǒng)為例來進(jìn)行說明。
▲ 圖:多重檢測示意圖(圖源網(wǎng)絡(luò),侵刪)
Azure Cielo™ 6實時熒光定量PCR系統(tǒng)共有6個熒光通道,最多可同時檢測6個基因。為什么能同時檢測這么多基因呢,這里就要科普一個小知識了,那就是熒光是怎么產(chǎn)生的。當(dāng)激發(fā)光照射到熒光基團(tuán)上時,熒光基團(tuán)就會發(fā)出發(fā)射光,也就是我們需要的熒光信號,對于不同的熒光基團(tuán),其接收的激發(fā)光和發(fā)射的發(fā)射光波長都是不一樣的,因此需要根據(jù)機器的特性進(jìn)行選擇。對于Azure Cielo™ 6實時熒光定量PCR系統(tǒng),只要使用的熒光基團(tuán)在6個通道的激發(fā)和發(fā)射波長的范圍內(nèi),都支持使用。其次,Azure Cielo™ 6實時熒光定量PCR系統(tǒng)的熒光檢測通道的設(shè)計之初,就是要覆蓋市面上大多數(shù)的熒光基團(tuán)類型,所以基本不需要擔(dān)心探針適配性問題。
▲ 圖4:Azure Cielo™ 6實時熒光定量PCR系統(tǒng)的熒光檢測通道
naica® 6色微滴芯片式數(shù)字PCR系統(tǒng)熒光探針的選擇與Azure Cielo™ 6相似,對于naica® 6色微滴芯片式數(shù)字PCR系統(tǒng)而言,其同樣配置有6個熒光檢測通道,6個通道的波長范圍也基本覆蓋了市面上大部分的熒光基團(tuán),無需擔(dān)心適配性和選擇問題。
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法國Stilla Technologies公司naica®六通道微滴芯片數(shù)字PCR系統(tǒng),源于Crystal微滴芯片式數(shù)字PCR技術(shù),自動化微滴生成和擴增,每個樣本孔可實現(xiàn)6熒光通道的檢測,智能化識別微滴并進(jìn)行質(zhì)控,3小時內(nèi)即可獲得至少6個靶標(biāo)基因的絕對拷貝數(shù)濃度。