2020年10月22日,由Wioletta Rut 、Katarzyna Groborz、Linlin Zhang和Xinyuanyuan Sun等在《nature chemical biology》期刊發(fā)表了《SARS-CoV-2 Mpro inhibitors and activity-based probes for patient-sample imaging》的文章。
SARS-CoV-2的主要蛋白酶(Mpro)是關(guān)鍵的抗病毒藥物靶標(biāo),作者首先獲得了該蛋白酶的熒光底物(HyCoSuL)靶向庫,并確定了P4-P2位點(diǎn)的底物特異性,比較了SARS-CoV和SARS-CoV-2主要蛋白酶的底物偏好性。其次,作者設(shè)計(jì)并合成了一種有效的SARS-CoV-2抑制劑(Ac-Abu-dTyr-Leu-Gln-VS)和兩種活性探針,其中一種探針與SARS-CoV-2 Mpro配合物的晶體結(jié)構(gòu)被確定。最后,作者觀察了SARS-CoV-2 Mpro在COVID-19感染患者鼻部咽上皮細(xì)胞中的活性。這些數(shù)據(jù)為COVID-19有效診斷和治療的化合物設(shè)計(jì)提供了支撐。
在本次研究中,作者使用美國Azure Biosystems Sapphire平臺(tái)檢測(cè)SARS-CoV-2 Mpro 探針的敏感性,其中抑制劑是Ac-QS5-VS(Ac-Abu-dTyr-Leu-Gln-VS),活性探針是Bodipy-QS5-VS(Bodipy-PEG(4)-Abu-dTyr-Leu-Gln-VS)。Sapphire以其超高的分辨率,更寬的動(dòng)態(tài)范圍和更高的檢測(cè)靈敏度助力此項(xiàng)研究。
▲ Sapphire雙模式多光譜激光成像系統(tǒng)
☑ 雙模式成像:掃描檢測(cè)和CCD成像雙模式。
☑ 4個(gè)固態(tài)激光器激光激發(fā):488nm(藍(lán)色)、520nm(綠色)、658nm(紅色) /685nm/638nm、784nm(NIR),給用戶更多熒光選擇。
☑ 唯一的3種檢測(cè)器設(shè)計(jì):PMT,APDs和CCD檢測(cè)器,PMT檢測(cè)器用于藍(lán)色熒光檢測(cè)和磷屏成像;3個(gè)獨(dú)立的APD檢測(cè)器用于綠色、紅色熒光檢測(cè)和雙近紅外熒光檢測(cè),高分辨CCD用于高靈敏化學(xué)發(fā)光檢測(cè)。
☑ 掃描方式:4通道同時(shí)掃描,掃描更快速。
☑ 分辨率更高:可達(dá)10微米的分辨率,成像更清晰。
☑ 動(dòng)態(tài)范圍更寬:同時(shí)定量低豐度蛋白和高豐度蛋白,定量更準(zhǔn)確 。