做Western Blot的小伙伴,你是不是還在那里熬夜趕實(shí)驗(yàn)?是不是還在糾結(jié)今天的結(jié)果怎么和昨天的差異這么大?是不是在為選擇哪種檢測(cè)方法而煩惱?在為實(shí)驗(yàn)的重復(fù)性而抓狂?今天小編就和大家聊一下Western Blot中遇到的問(wèn)題以及應(yīng)對(duì)方法。
歸一化問(wèn)題:
做Western Blot經(jīng)常需要對(duì)蛋白進(jìn)行歸一化,經(jīng)典的歸一化方法是看家蛋白歸一化,看家蛋白需要選擇在不同樣品間穩(wěn)定表達(dá)的蛋白;其次表達(dá)豐度也需要篩選,如果豐度過(guò)高,目的蛋白豐度與看家蛋白差異過(guò)大,那兩者檢測(cè)定量時(shí)就不在一個(gè)線性范圍。這樣的篩選過(guò)程非常耗時(shí)耗力。即使篩選到合適的看家蛋白,對(duì)其歸一化的過(guò)程也需要多次重復(fù)調(diào)節(jié)才可以。
檢測(cè)靈敏度問(wèn)題:
小編做Western Blot檢測(cè)時(shí),由于目的蛋白含量低經(jīng)常曝光不出來(lái),同時(shí)老儀器檢測(cè)靈敏度不夠高,只能不斷調(diào)整實(shí)驗(yàn),提高上樣量,再反復(fù)進(jìn)行摸索,做Western 做到懷疑人生。
蛋白定量重復(fù)性問(wèn)題:
Western Blot檢測(cè)時(shí),化學(xué)發(fā)光依賴酶活性和底物濃度,發(fā)光信號(hào)不穩(wěn)定,因此定量時(shí)容易出現(xiàn)誤差,重復(fù)性相對(duì)較差,也只能不斷實(shí)驗(yàn)來(lái)進(jìn)行調(diào)整和驗(yàn)證。
多個(gè)目的蛋白檢測(cè)問(wèn)題:
Western Blot檢測(cè)時(shí),有時(shí)需要對(duì)多個(gè)蛋白進(jìn)行檢測(cè),這時(shí)的實(shí)驗(yàn)就會(huì)變的繁瑣,需要對(duì)每一個(gè)蛋白進(jìn)行表達(dá)檢測(cè),剪膜,剝離膜經(jīng)常要做,但是經(jīng)過(guò)這些步驟又會(huì)影響定量的精準(zhǔn)性,小編也很為難。
那么上述問(wèn)題有沒(méi)有好的解決方法呢?這里悄悄告訴大家一個(gè)好消息,采用Sapphire雙模式多光譜成像系統(tǒng),可以很好的解決上述困擾,好文章也在向你招手。
Sapphire成像系統(tǒng)采用雙模式,既有掃描式又有CCD成像式;多達(dá)四激光激發(fā)用于熒光成像,每個(gè)通道配有自己獨(dú)立的檢測(cè)器,PMT檢測(cè)器用于藍(lán)光成像,3個(gè)APD檢測(cè)分別用于綠光、紅光和近紅外檢測(cè),高分辨率CCD用于化學(xué)發(fā)光檢測(cè),在全光譜范圍內(nèi)避免信號(hào)損失;動(dòng)態(tài)范圍可達(dá)6log;軟件操作簡(jiǎn)單,易于上手。
應(yīng)對(duì)均一化問(wèn)題,已有眾多期刊建議采用總蛋白均一化,總蛋白均一化能夠更加真實(shí)的反應(yīng)目的蛋白表達(dá)量的變化,同時(shí)也無(wú)需繁瑣的篩選看家蛋白、調(diào)整蛋白上樣,只需對(duì)總蛋白進(jìn)行染色和調(diào)整,Azure提供總蛋白歸一化試劑和相應(yīng)的AzureSpot分析軟件,輕松搞定蛋白均一化問(wèn)題 。
應(yīng)對(duì)低豐度蛋白檢測(cè)問(wèn)題,Sapphire雙模式多光譜成像系統(tǒng)可以加配610萬(wàn)像素,大光圈的優(yōu)質(zhì)CCD檢測(cè)器,其檢測(cè)靈敏度可以達(dá)到fg級(jí),動(dòng)態(tài)范圍是傳統(tǒng)膠片的4倍?梢赃M(jìn)行累積曝光,可以快速得到你需要的圖像,無(wú)需多次重復(fù)和改變上樣。
應(yīng)對(duì)重復(fù)性問(wèn)題,熒光檢測(cè)方法與傳統(tǒng)的化學(xué)發(fā)光不同,熒光檢測(cè)方法不依賴酶活性和底物,二抗標(biāo)記熒光基團(tuán),信號(hào)強(qiáng)度和上樣量成線性關(guān)系,信號(hào)持久,可以得到更好的重復(fù)性結(jié)果,實(shí)驗(yàn)可以快速完成。
應(yīng)對(duì)多種蛋白檢測(cè)問(wèn)題,熒光檢測(cè)的一個(gè)好處是,無(wú)需剝離和重孵育,即可在一張印跡膜上進(jìn)行多種蛋白的檢測(cè),減少蛋白變化的誤差,實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)定量。
Azure Sapphire雙模式成像系統(tǒng)
無(wú)需再為Western實(shí)驗(yàn)所累