定量western blot 一定要有內(nèi)參質(zhì)控(上)
Western Blot是生物修煉的一大實驗,現(xiàn)在不做定量Western Blot,都不敢自詡學霸的了,暗暗擦汗的有沒有?
在討論如何從Western Blot中獲得定量數(shù)據(jù)之前,先定義一下我們所說的“定量”是什么意思是非常有用的,何為定量,必須符合下列準則:
♦ 使用一個定義的過程進行檢測,即Western Blot。
♦ 這個過程產(chǎn)生一個可重復(fù)的結(jié)果,即是精確度。
♦ 測量反映了一個“真實”的結(jié)果,即是準確度。
定量Western Blot除了需要進行蛋白抽提、蛋白定量、等量蛋白上樣電泳、轉(zhuǎn)膜、靶蛋白抗體孵育、顯色等步驟以外,是一定要檢測內(nèi)參的,也就是內(nèi)部參照(Internal Control),目的是校正蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)印和上樣過程中導致的實驗誤差,保證實驗結(jié)果的準確性。對于哺乳動物細胞表達來說,內(nèi)參通常指由管家基因編碼表達的蛋白(Housekeeping Proteins),它們在各組織和細胞中的表達相對恒定,在檢測蛋白的表達水平變化時常用其作為參照物。
在發(fā)表文章時,Western Blot實驗結(jié)果需內(nèi)參進行校正,但仍有一些科研人員在實驗中忽略內(nèi)參的使用,將蛋白濃度測定作為規(guī)范是比較各種樣品間上樣量等同的唯一方法。然而各種蛋白質(zhì)濃度定量方法,都存在局限性,例如BCA方法對還原性試劑兼容性差,Bradford方法對去垢劑兼容性差,A280方法影響因素比較多,不能完全準確的確定各種樣品的蛋白濃度。在Western Blot實驗時使用內(nèi)參,即可簡便地對轉(zhuǎn)印和上樣步驟產(chǎn)生的誤差進行校正。
誰能看出這是“GAPDH”
那么如何實現(xiàn)Western Blot實驗中內(nèi)參的檢測呢?簡單講就是在WB過程中,除加入靶標蛋白的抗體外,也加入內(nèi)參蛋白的抗體,同時實現(xiàn)靶標蛋白和內(nèi)參蛋白的檢測。通過歸一化,可以校正上樣誤差和轉(zhuǎn)印誤差,從而獲得比較準確的Western Blot結(jié)果。
使用熒光方法進行定量Western Blot檢測,可進行多重檢測,熒光信號穩(wěn)定,持久,影響因素少,不用剝離膜和剪膜,實驗條件一致,更容易獲得定量Western Blot的數(shù)據(jù)。Azure600可以同時進行4通道熒光成像,無需剝離和重孵育,靶標蛋白和內(nèi)參蛋白同時在一張印跡膜上成像,更容易被期刊雜志接收。
如果蛋白表達是高豐度的,可見熒光方法也可以嘗試,如果是3色RGB可見熒光,能夠同時檢測兩種靶標蛋白和一個內(nèi)參蛋白。
小編列出了常見蛋白質(zhì)內(nèi)參,供參考哈:
想了解更多關(guān)于內(nèi)參選擇的小伙伴敬請期待下期精彩內(nèi)容。