Western Blotting技術(shù)已經(jīng)問世四十多年了,依然是蛋白分析中最常用和主流的方法。但近些年Western Blotting數(shù)據(jù)重現(xiàn)性,穩(wěn)定性,定量準(zhǔn)確性等問題,也使這項技術(shù)被推到了風(fēng)口浪尖,同時也有很多文章因為Western Blotting數(shù)據(jù)的問題而撤稿,而為了盡可能提高Western Blottig數(shù)據(jù)的可靠性和準(zhǔn)確性,期刊雜志對于接收涉及Western Blotting技術(shù)數(shù)據(jù)的文章也提出了新的要求。
接下來我們看看都要哪些要求:
1.不建議跑平行膠,因為平行膠和剝離膜孵育體系,操作條件的不一致,影響定量的準(zhǔn)確性,因此最好內(nèi)參和目的蛋白要在同一張印跡膜上
2.選擇寬態(tài)范圍的方法,確認(rèn)信號強度與所上樣量之間的線性關(guān)系,例如用膠片做化學(xué)發(fā)光方法的動態(tài)范圍就很窄,不建議使用:
數(shù)字成像相比膠片動態(tài)范圍更寬、定量更準(zhǔn)確
3.強烈推薦使用總蛋白進(jìn)行歸一化,因為看家蛋白容易受處理條件影響而發(fā)生變化,影響定量的結(jié)果,使用總蛋白定量更真實地反映目標(biāo)蛋白表達(dá)量的變化
4.提交原始數(shù)據(jù),例如:JBC,PLOS和CELL等雜志都要求要提供原始數(shù)據(jù)
聊完了期刊雜志的一些要求,那Azure Sapphire雙模式多光譜激光成像系統(tǒng)是如何幫助您獲得滿足期刊雜志W(wǎng)estern Blotting要求的數(shù)據(jù):
★ Sapphire是多熒光檢測系統(tǒng),可多達(dá)4個激光光源,同時進(jìn)行4通道熒光檢測,獲得更快的工作流程和更可靠的定量數(shù)據(jù)
熒光Western Blotting使用熒光基團(tuán)標(biāo)記的二抗進(jìn)行檢測,膜上的靶標(biāo)蛋白濃度與可見熒光信號強度呈線性關(guān)系,實現(xiàn)真實可靠的定量分析。熒光染料發(fā)射光譜不同,因此在一張印跡膜上可實現(xiàn)多個蛋白檢測。這樣目標(biāo)蛋白和內(nèi)參蛋白在同一張膜上,就可以避免數(shù)據(jù)造假的情況發(fā)生,更容易被期刊雜志接收。
圖1:通過使用四種光譜不同熒光基團(tuán)標(biāo)記的二抗,可以同時檢測多達(dá)四種不同的蛋白。HeLa細(xì)胞裂解物上樣,anti-tubulin (550nm, 綠色), anti -actin (700nm紅色), anti-GAPDH (800nm, 灰色),和anti-transferrin (490nm, 藍(lán)色)這四種蛋白同時成像,沒有交叉。
★ Sapphire配合AzureRed總蛋白熒光染色劑可以做總蛋白歸一化和定量三個靶標(biāo)蛋白,生成可以信賴的定量Western Blotting數(shù)據(jù)
使用總蛋白歸一化,以校正泳道和樣品之間的差異。傳統(tǒng)的方法無法準(zhǔn)確知道條帶灰度值和強度的變化是由于樣品的生物學(xué)變化引起的,還是由于上樣或樣品的不一致性或樣品制備的差異引起的?偟鞍讱w一化優(yōu)勢如下:
☑ 總蛋白比看家基因等內(nèi)參的線性檢測范圍更寬。
☑ 在整個實驗和系統(tǒng)中更加穩(wěn)定。
☑ 能有效排除實驗條件和體系對結(jié)果的影響。
☑ 更真實地反映目標(biāo)蛋白表達(dá)量的變化。
圖2.總蛋白歸一化和定量三個靶標(biāo)蛋白. Tubulin 紅色通道, Actin 藍(lán)色通道,GAPDH綠色通道, AzureRed/total protein 用灰色表示
圖3.使用總蛋白對Tubulin信號進(jìn)行歸一化,糾正上樣誤差
★ Sapphire配有獨特的三種檢測器設(shè)計,最大限度地提高儀器的檢測動態(tài)范圍,保證結(jié)果的準(zhǔn)確性
PMT檢測器用于藍(lán)光檢測和磷屏成像。
APD檢測器用于NIR,紅色和綠色熒光的檢測。
CCD檢測器用于高靈敏化學(xué)發(fā)光的檢測。
(*專利技術(shù))
★ Sapphire提供原始數(shù)據(jù)16bit的tiff圖給到期刊,這里的tiff原始數(shù)據(jù)是指未經(jīng)裁剪,像素修改,對比度調(diào)整等任何操作的圖,保證結(jié)果的真實性和可靠性
Sapphire除了進(jìn)行熒光印跡膜,化學(xué)發(fā)光印跡膜檢測外,還可以進(jìn)行In cell western孔板成像、In-Gel膠,2D和2D DIGE、切片掃描、組織成像和動植物成像、同位素標(biāo)記樣品磷屏成像等。
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