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Sapphire與生命活動大事件-錯配修復

瀏覽次數(shù):1631 發(fā)布日期:2019-12-20  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負
【導讀】
錯配修復(mismatch repair,MMR):在含有錯配堿基的DNA分子中,使正常核苷酸序列恢復的修復方式;主要用來糾正DNA雙螺旋上錯配的堿基對。錯配修復的過程需要區(qū)分母鏈和子鏈,做到只切除子鏈上錯誤的核苷酸,而不會切除母鏈上本來就正常的核苷酸,屬于復制時修復。

【背景知識】
原核生物比如大腸桿菌的錯配修復系統(tǒng)是由Mut基因編碼的Mut S,Mut H和Mut L蛋白構成,其中Mut S和Mut L會形成四聚體Mut SL,在DNA上滑動,如果遇到堿基對錯配引起的隆起,就會停留,開始把兩邊的DNA雙鏈拉扯,成環(huán),直到識別到GATC序列,如果A的N6發(fā)生甲基化,說明是母鏈,不切除,而如果GATC的A沒有甲基化,說明是子鏈,Mut H就會結合在Mut SL上。Mut H有核酸內切酶活性,在GATC序列的5’端,也就是G的左邊切開,再由DNase I發(fā)揮外切酶活性,把Mut SL四聚體擰出的環(huán)全部切除,再由DNA POL III和DNA連接酶重新填補。
歷史重構研究指出大腸桿菌使用EcMutS,EcMutL,EcMutH,EcUvrD,EcSSB和四個ssDNA核酸外切酶之一來實現(xiàn)切除。最近,中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所有了新的發(fā)現(xiàn)。
研究指出,最近的單分子圖像揭示了EcMutS和EcMutL在錯配的DNA上形成了級聯(lián)的滑動夾,共同協(xié)助EcMutH在遠程的新復制的GATC位點引入ssDNA斷裂。研究人員已經(jīng)成功可視化了完整的鏈特異性切除過程,并發(fā)現(xiàn)長壽命的EcMutL滑動夾在ssDNA斷裂附近捕獲了EcUvrD解旋酶,從而顯著提高了其解鏈能力。在這一過程中,EcSSB調節(jié)EcMutL-EcUvrD解旋,并且這一過程很少伴隨著廣泛的ssDNA外切酶消化。這一結果與一種依賴于EcMut- EcUvrD解旋酶驅動的ssDNA片段在鄰近EcMut-GATC切口之間的移位,并且與外切酶無關的MMR鏈切除機制一致。
在這一研究中,科研人員通過美國Azure公司的SapphireTM雙模式多光譜激光成像系統(tǒng)對核酸外切酶的活性進行了研究。
對于大多數(shù)成像系統(tǒng)、需要在應用的靈活性和圖像質量之間做選擇。作為新一代實驗室成像平臺 ,SapphireTM Biomolecular Imager是新一代激光掃描成像系統(tǒng),兩者兼顧,具有無與倫比的靈活性、出色的靈敏度和圖像質量。無論使用哪種應用,SapphireTM Biomolecular Imager和SapphireTM 采集軟件都能夠提供高質量的數(shù)據(jù)。
產(chǎn)品優(yōu)勢:
◐ 多達四個固態(tài)激光器(488nm,520nm,658nm或685nm可選,785nm),提供極高的激發(fā)靈敏度。
◐ 藍光檢測和磷屏成像用PMT,近紅外熒光檢測使用APDs,可見光和化學發(fā)光用CCD 。
◐ 超寬動態(tài)范圍,同時成像和定量低豐度和高豐度樣品 。
◐ 圖像分辨率可達10微米,實現(xiàn)高質量圖像分析 。
◐ Sapphire Capture和AzureSpot軟件,實現(xiàn)完美的成像和準確的分析。
 
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