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染色體外DNA:癌基因竟然不存在于染色體上

瀏覽次數(shù):2360 發(fā)布日期:2019-11-22  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
 
昨日,Paul S.Mischel教授團(tuán)隊(duì)在Nature雜志上發(fā)表了名為Circular ecDNA promotes accessible chromatin and high oncogene expression的文章,該文章首次解析了ecDNA的結(jié)構(gòu)與功能。
那么什么是ecDNA呢?
研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn),其實(shí)大量的癌基因并不在染色體上,而是會(huì)從染色體上脫落下來(lái),變成一種小型的DNA,稱(chēng)為染色體外DNA(extrachromosomal DNA,簡(jiǎn)稱(chēng)ecDNA)
這種顛覆傳統(tǒng)認(rèn)知的發(fā)現(xiàn)到底意味著什么呢?文章指出ecDNA在腫瘤中普遍存在,同時(shí)由于缺乏著絲粒,導(dǎo)致其不遵照孟德?tīng)柖蛇M(jìn)行遺傳,是驅(qū)動(dòng)腫瘤異質(zhì)性的重要因素,也是導(dǎo)致腫瘤耐藥性的誘因。這將對(duì)腫瘤的治療帶來(lái)極大的挑戰(zhàn)。
我們知道,由于腫瘤存在異質(zhì)性,所以傳統(tǒng)的組織活檢已經(jīng)不能全面的解析腫瘤的真面目了。隨著技術(shù)的發(fā)展,液體活檢這一檢測(cè)方法逐漸成為檢測(cè)癌癥的新手段。液體活檢是指取患者的體液(血液、尿液、腦脊液等),通過(guò)測(cè)序或者數(shù)字PCR等方法對(duì)其中的腫瘤標(biāo)志物進(jìn)行檢測(cè),從而確定患者是否罹患疾病。
 
目前,在液體活檢方面做得較為出色的平臺(tái)要數(shù)來(lái)自法國(guó)stilla technologies公司的Naica全自動(dòng)微滴芯片式數(shù)字PCR系統(tǒng)了。
  
 
該系統(tǒng)是法國(guó)stilla公司開(kāi)發(fā)的下一代核酸絕對(duì)定量技術(shù)。使用cutting-edge微流體創(chuàng)新型芯片——Sapphire芯片作為數(shù)字PCR過(guò)程的唯一耗材。樣品通過(guò)毛細(xì)通道網(wǎng)格以30,000個(gè)微滴的形式進(jìn)入2D芯片中,可稱(chēng)作Crystal微滴。PCR擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)在芯片上實(shí)現(xiàn)。對(duì)微滴成像用以檢測(cè)包含擴(kuò)增片段的微滴。最后一步是對(duì)陽(yáng)性微滴計(jì)數(shù)從而得到精準(zhǔn)的核酸絕對(duì)數(shù)量。
 
該平臺(tái)擁有強(qiáng)大的圖像分析技術(shù)和直觀可視的檢測(cè)功能,從而達(dá)到了數(shù)字PCR定量卓越的置信水平,獲得的數(shù)據(jù)真實(shí)可信。并且該系統(tǒng)目前為市面上最簡(jiǎn)單的數(shù)字PCR系統(tǒng),可以實(shí)現(xiàn)3熒光通道檢測(cè)的數(shù)字PCR平臺(tái),快速建立多重實(shí)驗(yàn)。
 
此外我們還為大家提供了Gene-π數(shù)字PCR學(xué)堂(www.cycloudbio.com數(shù)字PCR學(xué)堂快速入口),您可以選擇感興趣的應(yīng)用教程,其中包含從實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)到數(shù)據(jù)分析的詳細(xì)工作流程。 您還可以通過(guò)搜索導(dǎo)航工具直接搜索特定的項(xiàng)目("dPCR的DNA準(zhǔn)備","熒光溢出"等),或點(diǎn)擊我們的"HOW TO" 選擇您需要的部分(設(shè)計(jì)、分析、報(bào)告)。
來(lái)源:艾普拜生物科技(蘇州)有限公司
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