做western blot印跡膜時(shí),較大的蛋白質(zhì)眾所周知是難以處理的。 特別是,您可能很難實(shí)現(xiàn)良好的轉(zhuǎn)印效率。 在某些方面,蛋白質(zhì)難以朝著你想要的方向前進(jìn)。
我們將給5點(diǎn)建議,幫助膠上大分子量蛋白的轉(zhuǎn)印。
01
犧牲膠的韌性來提高效率
低濃度的丙烯酰胺凝膠可能難以操作。一旦手指觸摸它就會(huì)撕裂? 但是,與高濃度的凝膠相比,大蛋白將更有效地從較低濃度的凝膠中移出(分辨率更好)。因此,提高你的靈活性和耐心,嘗試6-7.5%的凝膠。 或者可以嘗試使用梯度凝膠,可以同時(shí)分辨小分子量和大分子量蛋白質(zhì)。
02
去除去垢劑
較大的蛋白質(zhì)可能在凝膠中沉淀,抑制轉(zhuǎn)印。 在SDS-PAGE期間添加的SDS通常會(huì)解決這個(gè)問題,但較大的蛋白質(zhì)可能需要更多的SDS。 您可以在轉(zhuǎn)印緩沖液中添加最多0.1%的SDS以阻止沉淀的產(chǎn)生。因?yàn)镾DS抑制蛋白質(zhì)與膜的結(jié)合,因此請(qǐng)嘗試從低濃度的SDS開始(例如0.0375%),然后逐步提高。
如果確實(shí)在轉(zhuǎn)印緩沖液中添加了SDS,則需要重新優(yōu)化其他轉(zhuǎn)印條件,如轉(zhuǎn)印時(shí)間和電流,以防止蛋白透過膜。
03
降低甲醇濃度
甲醇與SDS具有相反的作用。 雖然甲醇增加蛋白與膜的結(jié)合,但它從蛋白質(zhì)中剝離SDS。 因此,降低轉(zhuǎn)印緩沖液中的甲醇濃度也有助于防止蛋白沉淀。 您可以將濃度降低到10%或更低。 如果您使用的是PVDF膜,則可以完全省去甲醇。 在使用之前,不要忘記用甲醇將膜激活!
甲醇也會(huì)導(dǎo)致凝膠收縮,所以如果減少甲醇,你的凝膠會(huì)膨脹得更多。 這也有助于轉(zhuǎn)移大分子量蛋白。 但您可能需要使用比正常情況稍大的濾紙和膜。
04
慢速轉(zhuǎn)印大分子量蛋白
大分子量蛋白想要獲得良好的轉(zhuǎn)移效率可能需要更多時(shí)間。 快速移動(dòng)那些大分子可能很困難。 嘗試以較低的電壓過夜轉(zhuǎn)印。 只是不要忘記保持轉(zhuǎn)印要在低溫環(huán)境!
05
使用濕轉(zhuǎn)
雖然半干轉(zhuǎn)印可能更適合設(shè)置并且需要較少的緩沖液,但它確實(shí)有其缺點(diǎn)。 半干轉(zhuǎn)印通常比濕轉(zhuǎn)移效率低,并且不能增加轉(zhuǎn)印時(shí)間以適應(yīng)更大的蛋白。 轉(zhuǎn)移大蛋白時(shí)最好堅(jiān)持使用濕轉(zhuǎn)。