復雜基因組測序
復雜基因組主要包括以下幾類:雜合基因組,主要指雜合率高于0.8%的二倍體基因組,如大部分水產類和昆蟲等;高重復基因組,主要指重復序列比例高于50%的二倍體基因組,如大部分林木等;超大基因組,基因組大小大于3G,甚至是10G以上的物種,如兩棲類和部分林木;多倍體基因組,如四倍體、六倍體植物等。
基因組組裝的難易程度是由基因組本身的結構決定的,主要包括基因組重復序列的長度及數量、基因組雜合程度、基因組大小、基因組GC含量等因素。目前主流的測序手段還不能很好的處理復雜基因組的測序,而采用第一代、第二代與第三代測序技術相結合的策略,可以很好的解決這一問題。
技術優(yōu)勢
最高的N50組裝指標
最少的contig數量
極大提高復雜基因組的組裝質量
可以獲得超高精度的基因組圖譜
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武漢菲沙基因信息有限公司位于武漢國家生物產業(yè)基地——光谷生物城,是一家集三維基因組學技術服務、第二代和第三代基因測序、生物信息軟件開發(fā)、生物信息分析、基因組數據庫搭建、分子標記開發(fā)、基因檢測技術研發(fā)等生物信息上下游產業(yè)于一體的高新技術企業(yè)。菲沙基因聯(lián)合國內外著名高校和科研機構,擁有一批國際知名的基因組學和生物信息學專家,致力于提供全球領先的生物信息技術服務。
依托國際先進的第二代和第三代高通量測序平臺,以及20萬億次的高性能計算平臺,菲沙基因可以針對人類健康、疾病防治、環(huán)境保護、動植物研究、微生物應用等不同領域的基因組學問題展開研究,能夠為不同需求的合作伙伴提供包括實驗設計、樣品選取、測序策略,以及后續(xù)定制化信息分析在內的一站式、個性化整體解決方案。
隨著科學技術的發(fā)展,即將到來的基因組學第三次浪潮——三維基因組研究,已經成為全球生物學界的科研焦點。菲沙基因在提供3C、4C、5C、Hi-C等三維基因組構象技術服務的基礎上,在國內率先引進最新的染色質遠程交互測序技術(ChIA-PET),為進一步研究基因組三維空間結構與功能提供了完整解決方案,能夠協(xié)助合作伙伴在下一輪基因組研究浪潮中搶占學科發(fā)展的有利先機。
憑借全球領先的生物信息分析能力,菲沙基因已經以多種形式先后與國內外著名高校和科研機構展開了深度合作,合作伙伴包括杰克森實驗室、西蒙菲沙大學、中國科學院、中國農科院、清華大學、上海交通大學、復旦大學、華中農業(yè)大學、第二軍醫(yī)大學、同濟醫(yī)院、上海東方肝膽外科醫(yī)院等。
“以生物信息學助推生命科學的研究,以基因組醫(yī)學促進人類健康的發(fā)展”是菲沙基因的使命;“成為生物信息學領域的引領者”是菲沙基因的愿景。我們期望與各領域的專家合作,制定最優(yōu)的解決方案,提供快速、準確、專業(yè)的服務,共同迎接生命科學研究中的挑戰(zhàn)。