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天河二號超級計(jì)算機(jī)助力AlphaKnockout基因打靶系統(tǒng)

瀏覽次數(shù):5458 發(fā)布日期:2017-7-13  來源:本站 本站原創(chuàng),轉(zhuǎn)載請注明出處

如果說發(fā)生在2016年春天的人機(jī)大戰(zhàn)給圍棋界帶來的是一次不小的震動,那么2017年新年,圍棋界頂尖的人類棋手們算得上經(jīng)歷了一次“飛蛾撲火”般的悲壯。有人說阿爾法狗就像一臺永動機(jī),在擁有龐大計(jì)算能力的谷歌云端不停地練習(xí),永不停歇。這意味著它每一秒、每一天都在進(jìn)步。

同樣,對于天河二號超級計(jì)算機(jī),相信國人再熟悉不過了。連續(xù)6次蟬聯(lián)全球最快的超級計(jì)算機(jī)之后,天河二號與神舟、天宮一號、蛟龍?zhí)柍蔀閲壹壝。天河二號共?6000個運(yùn)算節(jié)點(diǎn),共312萬個計(jì)算核心,其雙精度浮點(diǎn)運(yùn)算峰值速度達(dá)到每秒5.49億億次。在高性能計(jì)算、云計(jì)算和大數(shù)據(jù)等方面,“天河二號”都有著大規(guī)模的應(yīng)用。

賽業(yè)生物非常榮幸地加入了天河二號不斷擴(kuò)充的用戶行列并取得重大突破。賽業(yè)生物研發(fā)的“阿爾法鼠”——AlphaKnockout基因打靶專家系統(tǒng)借鑒“阿爾法狗”永不停歇的深度學(xué)習(xí)機(jī)制,并借助強(qiáng)大的天河二號進(jìn)行大規(guī)模超強(qiáng)度運(yùn)算,將基因打靶技術(shù)制作基因工程鼠的方案設(shè)計(jì)過程人工智能化。

眾所周知,基因打靶方案的好壞會直接影響基因打靶的效果。以往一個非常熟練的方案設(shè)計(jì)專家出一份方案需要一到兩個小時,在這過程中,技術(shù)人員需要考慮幾十種因素,并且根據(jù)這些因素的重要程度進(jìn)行平衡。即使是經(jīng)驗(yàn)豐富的專家,疏漏也在所難免,而且什么方案最優(yōu),也基本靠經(jīng)驗(yàn)主觀判斷。而用計(jì)算機(jī)來實(shí)現(xiàn)上述人類的智慧活動則有很大優(yōu)勢。

賽業(yè)生物歷經(jīng)十一年發(fā)展,其獨(dú)特優(yōu)勢就是擁有一個由國際頂尖生物技術(shù)專家、生物信息學(xué)專家和IT技術(shù)專家組成的一流團(tuán)隊(duì),該團(tuán)隊(duì)已成功研發(fā)出全球首款基因載體智慧設(shè)計(jì)平臺VectorBuilder (www.vectorbuilder.com),且已服務(wù)全球數(shù)萬實(shí)驗(yàn)室。賽業(yè)生物的基因打靶專家為生物信息學(xué)團(tuán)隊(duì)提供幾十種需要考慮的因素,生物學(xué)信息團(tuán)隊(duì)將這幾十種因素當(dāng)做限制性條件設(shè)計(jì)計(jì)算規(guī)則,IT團(tuán)隊(duì)則借助天河二號的超級計(jì)算能力利用人工智能算法進(jìn)行計(jì)算,讓設(shè)計(jì)方案不斷從局部最優(yōu)向全局最優(yōu)逼近,從而得到最優(yōu)方案。更為可貴的是,賽業(yè)生物在過去幾年成功完成了數(shù)以千例的小鼠和大鼠基因打靶項(xiàng)目,積累了大量可靠的數(shù)據(jù)來訓(xùn)練我們的人工智能系統(tǒng),讓系統(tǒng)進(jìn)行深度學(xué)習(xí),以達(dá)到系統(tǒng)參數(shù)的最優(yōu)。這一點(diǎn)類似于阿爾法狗大量學(xué)習(xí)人類棋譜。

憑借豐富的生物技術(shù)領(lǐng)域的智能化軟件設(shè)計(jì)經(jīng)驗(yàn)和高效的團(tuán)隊(duì)合作,賽業(yè)生物的技術(shù)團(tuán)隊(duì)在短短半年間就成功研發(fā)出了人工智能的AlphaKnockout基因打靶專家系統(tǒng)。該系統(tǒng)免費(fèi)開放以來,已有數(shù)千用戶在上面便捷地獲取了基因打靶設(shè)計(jì)方案。并且,作為開發(fā)者的賽業(yè)生物承諾永久免費(fèi)開放使用。

現(xiàn)在,您只需登錄www.alphaknockout.com,輸入需要敲除的基因信息,即可得到設(shè)計(jì)完善的方案,并且系統(tǒng)會根據(jù)生物信息學(xué)算法,提供多至三個方案,并按優(yōu)先次序排序,排第一位的是默認(rèn)的最優(yōu)方案。在天河二號的強(qiáng)大運(yùn)算能力和賽業(yè)云端服務(wù)器的支持下,整個過程不超過半分鐘。

 

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