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制膠過程中需要注意的細節(jié)及操作指南

瀏覽次數(shù):12301 發(fā)布日期:2013-10-10  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負

說到Western Blotting,估計所有技術員都會聯(lián)想到藍底上的黑色條帶,或者是儀器掃描的白底黑條圖片。經(jīng)過了漫長的實驗流程,得到的會是清晰的、符合實驗理論的完美結果,或者更多的是其他讓自己略感失望的結局。

比起其他分子生物學實驗,Western Blotting實驗似乎更加冗長、更加考驗技術,從實驗準備,到最后曝光結果,任何一個步驟的絲毫疏忽,結果可能就差之千里。

在這里,BioTNT我先放下之后繁瑣復雜的操作步驟,和大家聊聊Western Blotting實驗基礎中的基礎——制膠。

不要小看制膠這件小事哦!Western實驗是從電泳跑膠開始的(之前的樣本處理算在實驗準備里哈),因此電泳跑膠的質量直接影響到最終的實驗結果,其中,聚丙烯酰胺凝膠的質量起到了決定性的作用。

要是在制膠時出現(xiàn)了瑕疵,會有怎樣的結果呢?

好不容易配好的分離膠在凝固時居然只剩下了一半!沒法用了,只能重制!那你一定是個新手,漏膠什么的最容易出現(xiàn)了。

曝光結束,發(fā)現(xiàn)條帶不在同一水平線上,原本應在同一kDa值的條帶卻上上下下如同波浪線一般,好吧,那這塊兒膠在配制的時候一定不勻。悲劇,從頭開始吧!

還是在曝光結束,發(fā)現(xiàn)在垂直方向上有那么一小條出現(xiàn)了空白(或者說是黑色曝光細斑),不巧的,影響到了目的條帶。嗯,那就是你在制膠的時候混了那么一點兒小氣泡進去,蛋白們在跑膠時碰到氣泡都繞道啦!

繼續(xù)的,曝光結束,發(fā)現(xiàn)目的條帶和非特異條帶擠作一團,難舍難分,沒法作為數(shù)據(jù),這種情況比較復雜,可能原因是電泳時間不夠,抗體質量不佳,樣本中的蛋白過量,etc. 但是,你有沒有想過,可能是你選錯了膠的濃度?

還有諸如膠不凝、曝光條帶大小不均、拔泳梳時壞膠、上樣電泳時樣本溢出等等問題,可能都與你制膠的小細節(jié)有問題哦!

怎么樣,小瞧了制膠,吃大虧了吧!還是好好的、嚴肅的來看待制膠這個問題吧!

說到這個制膠,很多的少年們還不知道制的是什么膠吧(啊喂,前面說了,是聚丙烯酰胺凝膠啦。,在分子生物學實驗中,常用的電泳膠有兩種:瓊脂糖凝膠以及聚丙烯酰胺凝膠。這兩個凝膠有什么區(qū)別呢?咳咳,本質區(qū)別啊!瓊脂糖凝膠電泳是用瓊脂糖作支持介質的一種電泳方法。其分析原理與其他支持物電泳最主要區(qū)別是:它兼有“分子篩”和“電泳”的雙重作用。其孔徑相當大,現(xiàn)廣泛應用于核酸的研究中。也就是說,瓊脂糖凝膠,可以區(qū)分的是電荷量,以及大分子量的物質。

著重介紹一下我們的聚丙烯酰胺凝膠,他是聚丙烯酰胺聚合交聯(lián)向成的具有網(wǎng)狀立體結構的凝膠,并以此為支持物進行電泳。在電泳前,通過向樣品加入還原劑(打開蛋白質的二硫鍵)和過量SDS(陰離子去垢劑),使蛋白質變性解聚,并與蛋白質結合成帶強負電荷的復合物,掩蓋掉蛋白質之間原有電荷的差異,使各種蛋白質的電荷/質量比值都相同,因而在聚丙烯酰胺凝膠中電泳時遷移率主要取決于蛋白質分子大小。也就是說,聚丙烯酰胺凝膠,可以區(qū)分的是分子量相對較小的物質。

那么,聚丙烯酰胺凝膠里到底有些什么成分呢?

首先要說明的是,電泳時的聚丙烯酰胺凝膠其實是由兩塊(或者以上)不同濃度的聚丙烯酰胺凝膠組合而成的,他們分別稱為濃縮膠及分離膠,濃縮膠是4%聚丙烯酰胺凝膠,主要作用是將樣本在上樣時的高度差縮小,使得所有的蛋白能夠處在同一起跑線上,進而得到更美觀、更科學的數(shù)據(jù)。在部分實驗室,并不用濃縮膠,這一做法不值得提倡哦!分離膠是真正的分子篩,通過聚丙烯酰胺形成的立體孔道,對不同分子量大小的蛋白進行分離。在一些實驗室,分離膠選用的是梯度膠,即為使用不同濃度的膠依次疊加,所得到的膠分離效果更佳,不過,制膠的步驟多了,失敗的可能性也大大增加哦!對于新手來說絕不推薦!

分離膠和濃縮膠中的成分基本相同,都是由以下這些組成:超純水、聚丙烯酰胺、Tris鹽酸、SDSAP、TEMED。分別來說說它們的作用吧!

超純水:…不說了

聚丙烯酰胺:由丙烯酰胺(簡稱Acr)和交聯(lián)劑N,N’一亞甲基雙丙烯酰胺(簡稱Bis)按一定比例混合而成,分子篩作用,分離不同分子量大小的蛋白。順便一提哦,丙烯酰胺是劇神經(jīng)毒哦!操作時候可要特別當心!聚丙烯酰胺毒性相對較小,但是還是注意些吧!

Tris鹽酸:緩沖液,保證膠的pH值正常。

SDS十二烷基硫酸鈉,陰離子去垢劑,打斷蛋白質的氫鍵和疏水鍵,并按一定的比例和蛋白質分子結合成復合物,使蛋白質帶負電荷的量遠遠超過其本身原有的電荷,掩蓋各種蛋白分子間天然的電荷差。

AP過硫酸銨,催化劑,加速聚丙烯酰胺形成立體結構,即加速凝膠。

TEMEDN,N,N’,N’四甲基乙二胺,催化劑,加速聚丙烯酰胺形成立體結構,即加速凝膠。

在了解了這么多基本知識之后,我們終于可以制膠了吧!嘿,不!慢著!先想想,我們要制多少濃度的膠呢?不同的聚丙烯酰胺濃度所產(chǎn)生的分子篩作用不同,對之后的實驗也會產(chǎn)生影響。常見的聚丙烯酰胺凝膠濃度有:8%10%、12%(什么?梯度膠,咳咳,這里就不說了哈),視具體情況而定。

不同濃度的分離膠對相同范圍分子量大小的蛋白有不同的分離作用,由此可得出對不同分子量蛋白所適用的相應濃度的分離膠。經(jīng)過我們大量的實驗數(shù)據(jù)得到,8%聚丙烯酰胺凝膠對35kDa以上蛋白的分離效果較好,對35kDa以下蛋白的分離效果較差;10%聚丙烯酰胺凝膠對15-170kDa蛋白的分離效果普通,對15kDa以下蛋白分離效果較差;12%聚丙烯酰胺凝膠對45kDa以下蛋白分離效果較好,對45kDa以上蛋白分離效果較差。

Western實驗中,絕大部分蛋白的分子量在20-100kDa,因此在沒有特殊要求的情況下使用10%的聚丙烯酰胺凝膠,可以基本保證不同分子量蛋白的分離以及對電泳蛋白的最高利用。

好了好了,我們還是制膠吧!

制膠這事兒其實真是個手藝活兒,需要一定的熟練程度。剛開始制膠,制出了一兩塊兒廢膠,大家大可不必放在心上,想當年,BioTNT可足足制了一天,才制出能夠進行實驗的凝膠喲!

漏膠往往是每位技術員朋友最先遇到的問題,雖然制膠的制膠槽按照購買公司的不同也有所差別,但是總的來說大同小異,掌握手上的力度最為重要。對于制膠的新手,個人建議先別急著制膠,先把制膠器組裝起來,往玻璃槽中加水,等過25分鐘(即為膠凝固的時間),直到漏水現(xiàn)象基本解決后,就可以著手制膠了,一般來說,不漏水了,漏膠的可能就基本消除啦。在組裝制膠器的過程中,要經(jīng)常注意玻璃板底是否和制膠槽底是否平整,一旦不平整,漏膠的可能性就很大了喲。怎樣才能平整呢?這就是力度問題啦,用力不能太輕,同樣也不能過猛,太輕封不住,太猛就容易造成形變,這個度嘛,最后還是要自己找啊!BioTNT的同事也告訴我呀,有條件的實驗室,可以在制作聚丙烯酰胺凝膠前,先往玻璃槽里加一些瓊脂糖凝膠封個底,個人覺得也是不錯的建議喲!

你以為不漏膠了,就算成功了?no,nono!你還差得遠呢!不要忘了,你剛剛到制膠這一步哦!

接下來,我就提幾個需要注意的點,剩下的大家就自己加油吧!

首先,在制備液態(tài)膠的時候,需要格外小心,不要加錯或者漏加什么東西哦,配制的母液也盡量是新鮮配制,不要使用已經(jīng)保存很多時間的。配制好的液態(tài)膠需要充分的混勻,推薦的方式是上下溫和顛倒。之前介紹過,AP以及TEMED是聚丙烯酰胺的助凝劑,要是一不小心沒加,那你的膠可就凝不起來了喲(據(jù)說沒有這兩個東西凝膠要等個把星期哦,反正BioTNT是沒等過)!

其次,在加膠時,注意盡量不要加入氣泡。SDS是去垢劑,在混勻過程容易產(chǎn)生氣泡,而在膠中混入氣泡可是非常致命的喲!當在混勻時,手法要溫和,混勻完后,將液態(tài)膠靜置15秒左右再進行加膠,以使液態(tài)膠中的微小氣泡上浮。另外,加膠時可以使用兩檔吸一檔打的方式,防止在打完膠后打入空氣,同時也應該注意槍頭是否有氣泡。

第三,壓膠時滴加壓膠液應均勻、緩慢。壓膠是制膠時不可缺少的一步,平整的分離膠有助于得到平整的條帶。常見的壓膠液是異丙醇,也可以用超純水替代。壓膠不慎不僅不能壓平分離膠,反而會使分離膠凹凸不平,甚至直接溶入分離膠,造成膠的不勻。在滴加壓膠液時,應貼住玻璃板,由左至右緩慢滴加,控制每一滴壓膠液的體積。

第四,應注意掌握凝膠的時間及溫度。凝膠是一個化學反應,與溫度、時間有一定關系。一般來說,當室溫在10-25℃時,凝膠需要25分鐘,室溫較高時可酌情減少時間,相反的,室溫較低時需適當增加。凝膠時間不足會造成膠不凝,而時間過長會使得拔泳道變得困難。

最后,在制作泳道時,要保持泳梳的垂直上下。在插泳梳時,將泳梳斜插會使得拔出困難,甚至造成壞膠(可能很大喲)。在拔泳梳時,斜拔會撬開玻璃板,這樣上樣可能會漏樣哦!其次,泳道要保持一定的高度,即加入的液態(tài)分離膠一定要足量,否則上樣時樣本溢出可就是板上釘釘啦!對了對了,拔梳子的時候不要忘記加電泳緩沖液哦!

嗯?成功了?恭喜你啦!那么治好的膠可以長時間存放么?可以,但不是那么的長哦,強烈建議當日使用,要是必須延時存放,需加入足量(可以沒過膠體)的電泳緩沖液,放入4℃冰箱,注意!DO NOT FREEZEN!要是在使用的時候發(fā)現(xiàn)你的電泳緩沖液結冰了,你可就中招了,重新融化后的膠在上樣時非常容易漏樣哦!也就是說,在大冬天時,不但不應該冷藏,反而應該保溫!同時,建議的保存期不應超過1周,每天都應補充電泳緩沖液保持膠體濕潤。

制完了膠,也就終于邁出了萬里長征的第一步,接下來,才是正式的Western實驗哦,不過,好的開始是成功的一半,有了一塊好膠,成功的實驗也就有了良好的基礎,祝各位實驗順利,得到自己希望的結果吧!

來源:BioTNT(冠泰生物)
聯(lián)系電話:021-51692391
E-mail:sales@biotnt.com

標簽: Western Blotting
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