本系列產(chǎn)品適用于人，動物，植物的新鮮，凍存及FFPE組織樣本的細(xì)胞核分離提取。通過裂解細(xì)胞膜，釋放細(xì)胞核的同時保持細(xì)胞核膜的穩(wěn)定。優(yōu)化的細(xì)胞核重懸液能夠有效維持細(xì)胞核膜的完整和染色質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)穩(wěn)定。
 

產(chǎn)品應(yīng)用：
制備的細(xì)胞核懸液可用于：
·表觀遺傳學(xué)研究（如scATAC- seq/bulk ATAC- seq，CUT&Tag）；
·核轉(zhuǎn)錄組測序（snRNA-seq/bulk RNA-seq）等相關(guān)實驗。

應(yīng)用范圍：
伯優(yōu)^®細(xì)胞核分離試劑盒-柱提法已被測試用于多種哺乳動物新鮮及冰凍組織的細(xì)胞核提取，如小鼠肺、腎、腦、肝臟、心臟、淋巴結(jié)、延髓等，人肝臟（癌和癌旁）、肺、 腦、肝、腎、宮頸組織等。

伯優(yōu)^®植物樣本細(xì)胞核分離試劑盒已被測試用于多種植物組織的細(xì)胞核提取，如小麥、玉米、洋蔥的根、莖、葉，油菜、菜豆葉，百合雌 蕊，橘子果實，紅豆杉莖等。

伯優(yōu)^®FFPE樣本細(xì)胞核分離試劑盒已被測試用于多種哺乳動物FFPE組織的細(xì)胞核提取，如小鼠肝、腎、腦，人肝、淋巴、宮頸等。

產(chǎn)品列表：

基于單核RNA測序數(shù)據(jù)解析囊腺瘤和肝囊腫的微環(huán)境
期刊：Computers in Biology and Medicine
影響因子：7
發(fā)表時間：2024.6
應(yīng)用組織類型：肝囊腫，囊腺瘤

研究思路：通過單核RNA測序（single nucleus RNA-sequencing, snRNA-seq）數(shù)據(jù)，深入解析囊腺瘤和肝囊腫組織的微環(huán)境，進而了解這些病變組織中的不同細(xì)胞類型、細(xì)胞狀態(tài)及其相互作用，從而揭示病變形成和發(fā)展的機制。

研究結(jié)果：單細(xì)胞核測序分析展現(xiàn)了病變組織中囊腺瘤和肝囊腫細(xì)胞的腫瘤內(nèi)異質(zhì)性及其腫瘤微環(huán)境，闡明了囊腺瘤和肝臟囊腫微環(huán)境之間的差異。而在囊腺瘤和肝囊腫病變中，也鑒定出不同細(xì)胞類型的不同簇和亞簇，并確定了它們相應(yīng)的分子特征。拷貝數(shù)變異顯示囊腺瘤和肝囊腫中肝星狀細(xì)胞的惡性程度不同。囊腺瘤和肝囊腫的肝細(xì)胞分化模式也通過單細(xì)胞核測序數(shù)據(jù)分析得出。此外，T細(xì)胞的組成及其性質(zhì)表明，囊腺瘤具有更高的免疫浸潤性和更復(fù)雜的免疫調(diào)節(jié)機制。這項研究為囊腺瘤和肝囊腫提供了初步的細(xì)胞圖譜，并為后續(xù)分子水平研究奠定了基礎(chǔ)。

空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)結(jié)合單核RNA測序揭示人類脊髓中神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞的異質(zhì)性
期刊：NEURAL REGENETRATION RESEARCH
影響因子：5.9
發(fā)表時間：2024.6
應(yīng)用組織類型：脊髓

研究思路：通過空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)（spatial transcriptomics）和snRNA-seq這兩種先進的技術(shù)，來揭示人類脊髓中神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞（glial cells）的異質(zhì)性，并可同時獲得細(xì)胞的空間位置信息和基因表達譜，從而更全面地理解神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞在脊髓中的分布和功能多樣性。

研究結(jié)果：通過snRNA-seq的結(jié)果，發(fā)現(xiàn)在人類脊髓中，星形膠質(zhì)細(xì)胞、小膠質(zhì)細(xì)胞和少突膠質(zhì)細(xì)胞各分為六個不同的轉(zhuǎn)錄亞群。在小鼠脊髓中，星形膠質(zhì)細(xì)胞、小膠質(zhì)細(xì)胞和少突膠質(zhì)細(xì)胞分別分為五個、四個和五個不同的轉(zhuǎn)錄亞群。這說明人類和小鼠之間神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞類型的異質(zhì)性。此外，還檢測到人類脊髓神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞基因表達的性別差異。具體而言，在所有星形膠質(zhì)細(xì)胞亞型中，男性的NEAT1和CHI3L1水平高于女性，而男性的CST3水平低于女性。在所有小膠質(zhì)細(xì)胞亞型中，所有差異表達的基因都位于性染色體上。除了性別特異性基因差異外，所有脊髓少突膠質(zhì)細(xì)胞亞型中MT-ND4、MT2A、MT-ATP6、MT-CO3、MT-ND2、MT-ND3和MT-CO2的水平在女性中均高于男性�？偟膩碚f，本研究揭示了神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞的異質(zhì)性，并為探索包括慢性疼痛、肌萎縮側(cè)索硬化癥和多發(fā)性硬化癥在內(nèi)的脊髓相關(guān)疾病的細(xì)胞基礎(chǔ)提供了寶貴的數(shù)據(jù)資源。
 

03 應(yīng)用文章

通過局部晚期宮頸鱗狀細(xì)胞癌的單核轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)鑒定出與放療療效相關(guān)的神經(jīng)樣祖細(xì)胞譜系
期刊：Advanced Science
影響因子：15.8
發(fā)表時間：2023.7
應(yīng)用組織類型：宮頸癌
研究思路：通過在放射治療之前和期間，進行snRNA-seq以構(gòu)建CSCC中各種細(xì)胞類型的高分辨率分子圖譜，從而更好地了解腫瘤微環(huán)境中與放射治療相關(guān)的分子反應(yīng)。

研究結(jié)果：通過snRNA-seq的結(jié)果可發(fā)現(xiàn)，腫瘤細(xì)胞中神經(jīng)樣祖細(xì)胞譜系（NRP）的表達水平在放療后顯著升高，并且在無反應(yīng)患者的腫瘤中富集。同時，通過群體RNA測序（bulk RNA-seq）分析獨立隊列的惡性細(xì)胞，驗證了無反應(yīng)患者腫瘤中NRP的富集情況。此外，對癌癥基因組圖譜（The Cancer Genome Atlas）數(shù)據(jù)集的分析表明，NRP表達與CSCC患者的預(yù)后不良相關(guān)。在CSCC細(xì)胞系的體外實驗中，發(fā)現(xiàn)下調(diào)NRP程序中的關(guān)鍵基因neuregulin 1（NRG1）與細(xì)胞生長減少和對放射線敏感性增加相關(guān)。免疫組織化學(xué)染色在第三隊列中驗證了關(guān)鍵基因NRG1和免疫調(diào)節(jié)程序中即時早期反應(yīng)基因3（immediate early response 3）作為放射敏感性調(diào)節(jié)因子的作用。這些發(fā)現(xiàn)揭示了NRP在CSCC中的表達可用于預(yù)測放療的療效。
 

04 應(yīng)用文章

預(yù)測黑色素瘤抗PD-1治療效果的新綜合性多細(xì)胞特異性模型
期刊：Theranostics
影響因子：12.4
發(fā)表時間：2024.3
應(yīng)用組織類型：黑色素瘤

研究思路：在這項針對晚期黑色素瘤的抗PD-1新輔助治療的臨床研究中，通過收集治療前后的腫瘤組織進行snRNA-seq，并通過多色免疫熒光染色和公開數(shù)據(jù)集，確認(rèn)晚期黑色素瘤的抗PD-1的新輔助治療的效果，并進行相關(guān)驗證。

研究結(jié)果：通過snRNA-seq的數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn)了與抗PD-1治療效果密切相關(guān)的四個細(xì)胞亞群，并揭示了四個細(xì)胞亞群間的相互作用有助于抗腫瘤免疫。此外，研究還基于這四個亞群，開發(fā)了的新的預(yù)測模型，該模型在評估抗PD-1治療效果方面具有顯著潛力。
 

05 應(yīng)用文章

通過snRNA-seq和scRNA-seq的互補數(shù)據(jù)更新的皮膚轉(zhuǎn)錄組圖譜
期刊：Journal of Dermatological Science
影響因子：3.68
發(fā)表時間：2024.6
應(yīng)用組織類型：皮膚

研究思路：對同一個皮膚樣本分別進行snRNA-seq和scRNA-seq，并結(jié)合了先前發(fā)表的scRNA-seq相關(guān)數(shù)據(jù)，從而分析比較出兩種方法在細(xì)胞比例和基因表達上的差異。同時，通過Slingshot分析對角蛋白細(xì)胞和成纖維細(xì)胞的分化軌跡進行分析。

研究結(jié)果：snRNA-seq對線粒體和核糖體RNA的污染較不敏感，且在檢測轉(zhuǎn)錄因子方面表現(xiàn)出更大的能力。snRNA-seq識別出了更多在空間和功能上相關(guān)的角蛋白細(xì)胞簇，這些細(xì)胞簇構(gòu)成了具有預(yù)期分化動態(tài)的細(xì)胞軌跡。同時，也發(fā)現(xiàn)了角蛋白細(xì)胞不同分化階段的新標(biāo)志物，例如LYPD3、EMP2和CSTB，并確定了NFIB和GRHL1是與角蛋白細(xì)胞增殖和功能分化相關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子。另一方面，scRNA-seq檢測到了更多的免疫細(xì)胞，并可檢測到激活狀態(tài)的成纖維細(xì)胞。
 

06 應(yīng)用文章