RNA提取主要用到的試劑以及相關(guān)原理介紹
瀏覽次數(shù):122 發(fā)布日期:2024-8-6
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RNA提取主要用到的試劑以及相關(guān)原理:
Trizol主要成分:苯酚和異硫氰酸胍;原理是裂解細(xì)胞,促使核蛋白體解離,使RNA與蛋白質(zhì)分離,并將RNA釋放到溶液中。
氯仿:分子量較大的有機(jī)溶劑,可抽提酸性苯酚;氯仿密度大,使有機(jī)相和水層分離。RNA提取過程中,苯酚與蛋白結(jié)合進(jìn)入有機(jī)相中,使蛋白與RNA脫離,RNA進(jìn)入水相。在EP管中會出現(xiàn)上層是RNA,中層白色的是DNA,下層是蛋白質(zhì)。
異丙醇:其-OH為親水基團(tuán),與水更好的結(jié)合從而使RNA脫水產(chǎn)生沉淀。
DEPC水:RNA酶抑制劑和RNA酶的活性基團(tuán)組氨酸的咪唑環(huán)結(jié)合使蛋白質(zhì)變性。
RNA提取步驟:
1. Trizol裂解細(xì)胞或組織,充分裂解;
2. 氯仿抽提,每管200ul氯仿,劇烈晃動(dòng)混勻,冰上靜置10min;
3. 12000rpm,4℃離心15min;
4. 小心吸取上清液(一般吸取400ul)至于新的EP管中,可看到溶液分三層,上層澄清透明的是含RNA的水相,中層白色絮狀物是DNA,下層粉紅色是含蛋白質(zhì)的有機(jī)相。
5. 加入等體積(400ul)的異丙醇進(jìn)行脫水,上下顛倒10~15次,輕柔的混勻,冰上靜置10~30min;
6. 12000rpm,4℃離心10min;
7. 離心后可看見管壁有白色沉淀,如若沒有,可重復(fù)步驟6,再離心;后棄掉上清液,緩緩倒出上清液,注意不要將沉淀倒出,加入75%乙醇(無水乙醇:DEPC水=3:1)上下顛倒,直至沉淀離開管壁(清洗RNA沉淀)
8. 12000rpm,4℃離心5min;
9. 再次清洗(棄掉上清液,緩緩倒出上清液,注意不要將沉淀倒出,加入75%乙醇,上下顛倒,直至沉淀離開管壁;
10. 12000rpm,4℃離心5min;
11. 棄掉上清液,將EP管倒扣在干凈的濾紙上,吸干EP管內(nèi)殘留的液體,保證管內(nèi)僅剩RNA沉淀;
12. 加入一定量的DEPC水(根據(jù)RNA沉淀的大小加,一般10~20ul),瞬離,輕彈EP管,保證沉淀溶于DEPC水中后,再次瞬離,RNA完全溶解后,至于-80℃保存。