全能核酸酶,又稱非限制性核酸內切酶,是一種來源于Serratia Marcescen的非特異性核酸內切酶,可以降解各種形式的(雙鏈,單鏈,線狀,環(huán)狀,天然或變性)DNA和RNA,產生3-5個堿基長度的5'-單磷酸寡核苷酸。無論是實驗研究,還是工業(yè)生產,全能核酸酶都是目前唯一能夠同時有效去除DNA和RNA的酶。另外,全能核酸酶在非常廣泛的條件下(6M urea,0.1 M Guanidine HCl,0.4% Triton X100,0.1% SDS,1 mM EDTA,1 mM PMSF)都能保持很高的穩(wěn)定性和消化活力,非常適用于作為各類科學研究以及疫苗、蛋白、多糖類制藥工業(yè)的首選酶制劑,去除樣本或制品中的核酸殘留,提升樣本純度和制品生物功效。
隨著越來越多的生物制品(重組蛋白、Vero細胞疫苗、細胞治療/基因治療藥物等)進入治療領域,生物制品的質量控制也日趨嚴格,其中核酸殘留是各類質控標準的重中之重,因為DNA較好的穩(wěn)定性,容易在生產過程中形成殘留,而這些生物制品應用到人類疾病預防和治療時,會帶來不可控危險因素。終產品的宿主核酸殘留量必須遵循WHO、FDA和EMEA以及我國NMPA監(jiān)管條例。尤其近年來包括大牌進口產品在內的狂犬疫苗DNA殘留超標問題,引起了社會和業(yè)界的廣泛關注。WHO和各國藥物監(jiān)管機構一般將疫苗等生物制品的殘留DNA控制在100pg/劑量,特殊情況下最高允許10ng/劑量。我國參照WHO、FDA和歐盟標準,在藥典中對生物制品的核酸殘留量有明確規(guī)定。藥典中明確規(guī)定酵母、大腸桿菌表達的生物制品中DNA殘留量不超過10ng/劑量。我國2020年藥典將人用狂犬病疫苗(Vero細胞)DNA殘留標準更新為≤3ng/劑量。本產品無動物源性, 無氨芐青霉素,可高效降解單鏈、雙鏈、線性、環(huán)狀、超螺旋等任何形式的DNA及RNA。
一,應用范圍
1)用于除去生物制品中的DNA/RNA
美國FDA對治療用每劑量的生物制品的核酸含量要求為低于10 pg,國內對此相應的要求為低于100 pg。全能核酸酶可用于疫苗、多糖、蛋白等工業(yè)生物制品中核酸的去除,使生物制品的最終核酸含量符合要求,同時提高生物制品功效。
2)用于降低細胞破碎后的粘度
全能核酸酶可以降解所有形式的核酸,降低細胞裂解液的粘度,提高蛋白得率,改善分離效果,使之易于過濾(尤其是超濾),利于下游層析純化操作。
圖2 細胞裂解液全能核酸酶處理(A)和未處理(B)比較圖
3)用于細胞培養(yǎng)來源產物的純化過程
核酸很容易粘附在病毒樣顆粒(VLP)、病毒粒子、包涵體等細胞生成顆粒的表面,使顆粒大小或電荷發(fā)生改變,造成這些顆粒的聚集,如外周血單細胞(PBMC)存放過程中的結塊現象。全能核酸酶可有效降解核酸,避免核酸對細胞產物的影響以及純化效率,利于提高細胞產物純化效率。
4)用于生化分析樣品的制備
在ELISA、色譜分析、雙相電泳和足跡分析等過程中,用全能核酸酶處理含有核酸的蛋白樣品,可提高分辨率,并提高回收率。
圖3 小鼠腦核蛋白全能核酸酶處理(A)和未處理(B)雙向電泳比較圖
二,質量控制
1.宿主蛋白殘留:酶聯免疫檢測試劑盒未檢測到宿主蛋白。
2.蛋白酶殘留:250KU/mL 的全能核酸酶與底物反應 60min,未檢測到活力。
3. 細菌內毒素(Endotoxin):LAL-Test,中國藥典 2020 版第四部凝膠限度試驗法通則(1143)。
4.微生物負載:中國藥典2020版第四部無菌檢查法通則(1101),中華人民共和國國家標準,GB 4789.2-2016。
5. 重金屬殘留:電感耦合等離子體發(fā)射光譜法,HJ776-2015。
三,常見問答
Q.產品按多少比例加入?
A:建議加入比例(終濃度)為1:1000-1:20000,具體需依據反應時間、溫度、以及待處理樣本中的鹽離子濃度。
Q.產品能否可以減少用量?
A:如希望減少用量,需適當延長處理時間。
Q.全能核酸酶的抑制因素有哪些?
A:在含有以下物質的體系中,全能核酸酶的活性會降低50%或以上:>150 mM一價陽離子,>100 mM磷酸鹽,>100 mM硫酸銨,>100 mM鹽酸胍,>0.1% SDS,>1% Triton X-100,>1% Tween 20。
Q.怎樣滅活全能核酸酶?
A:采用EDTA螯合金屬離子會可逆地抑制全能核酸酶活性,極端條件會造成不可逆失活,例如100 mM NaOH,70℃處理30 min等。
Q.如何去除處理后樣本中的全能核酸酶?
億目思的全能核酸酶分為無標簽、His標簽和Strep標簽三種版本。若所處理的樣本無標簽,則可選擇帶標簽的全能核酸酶,通過相應親和resin去除殘留核酸酶;若所處理的樣本帶有His標簽,則可選擇無標簽的全能核酸酶,通過親和層析吸附目標蛋白,從而去除殘留核酸酶;若所處理的樣本是無標簽和帶His標簽的混合蛋白,則可選擇帶Strep標簽的全能核酸酶,通過Strep親和resin去除殘留核酸酶。
Q.全能核酸酶與蛋白酶抑制劑混合物是否兼容?
A:全能核酸酶與不含EDTA的蛋白酶抑制劑混合物兼容。若含有EDTA且濃度>1 mM時,會抑制核酸酶活性,建議:如果必須加EDTA,按照2倍EDTA濃度補加Mg2+。
Q. 如何確認樣本中是否還有全能核酸酶殘留?
A:可用億目思的全能核酸酶殘留檢測試劑盒(Cat.No. 70291)進行鑒定,僅需10分鐘即可對樣本中的殘留核酸酶進行定量鑒定,最低檢出限達0.001 ng/mL。
Q.產品的用量是多少?
A:需要根據重懸菌體所需裂解液的體積來確定需要酶的量。若普通蛋白純化,則需要濃度為25 U/mL;核蛋白則需要100 U/mL;病毒表達蛋白純化需要濃度為12.5 U/mL;疫苗產品需要量為0.9-1.1 U/mL。具體用量還需要參照待處理樣本成分進行調整。
Q.產品的穩(wěn)定性如何,如果不小心在室溫放置幾天后,酶活性會受到怎樣的影響?
A:室溫2-3天,對活力影響不大。
Q.全能核酸酶能在尿素環(huán)境消化核酸嗎?
A:全能核酸酶在尿素濃度為6 M時活性先增加,隨著時間延長活性又有降低;在尿素為7 M時,全能核酸酶15分鐘后出現變性并失活。但是在酶失活前多數核酸已經降解了。可通過提高全能核酸酶使用濃度補償7 M尿素的影響。
四,逐典Pannarase全能核酸酶優(yōu)勢:
1.無動物源性、無氨芐青霉素
2.杰出單位比酶活、更高效的核酸降解能力
3.先進的生產工藝,非傳統(tǒng)His標簽純化、排除引入金屬離子風險
4.嚴格的質控標準,內毒水平低,確保單位酶活的準確性以及批次間穩(wěn)定性
1,全能核酸酶應用條件:
全能核酸酶的酶活會受到多種因素的影響(例如溫度、pH、離子強度等),故用量范圍也會從0.1 U/mL-250 U/mL不等。因此,不同的操作環(huán)境下酶的最佳濃度不同,需要通過實驗設置梯度進行最佳條件的摸索。
2,應用實例:
1.樣品:狂犬病毒濃縮液
處理條件:核酸酶濃度50~90U/ml ,
37 ℃處理 2 h,轉入18 ~ 26 ℃處理 6h
2.樣品:狂犬病病毒濃縮液
處理條件:25、50和100 U/ml,37℃
3.樣品:流感病毒濃縮液
處理條件:10 U/mL,37℃