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全能核酸酶多樣化應用場景介紹

瀏覽次數(shù):482 發(fā)布日期:2024-4-9  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負
全能核酸酶,又稱非限制性核酸內(nèi)切酶,是一種來源于Serratia Marcescen的非特異性核酸內(nèi)切酶,可以降解各種形式的(雙鏈,單鏈,線狀,環(huán)狀,天然或變性)DNA和RNA,產(chǎn)生3-5個堿基長度的5'-單磷酸寡核苷酸。無論是實驗研究,還是工業(yè)生產(chǎn),全能核酸酶都是目前唯一能夠同時有效去除DNA和RNA的酶。
 

一,廣闊的應用前景

1,降低細胞/細菌裂解時核酸釋放產(chǎn)生的黏度,并且適用于任何裂解方式。

2,在大規(guī)模的層析純化時,避免由于大量的核酸吸附在層析介質(zhì)上降低蛋白質(zhì)的有效載量從而降低純化得率。

3,在 ELISA、二維電泳和免疫印跡分析中,提高分辨率和回收率,這對于準確、高效地分析生物樣品至關重要。

4,消除重組蛋白、疫苗等生物制品的外源性核酸殘留,這是確保產(chǎn)品安全、有效的關鍵步驟。


二,全能核酸酶的應用

1,E.coli表達的重組蛋白純化

對于某些大腸桿菌表達的蛋白,很容易形成包涵體,在純化的過程中常常與宿主DNA纏繞在一起,破碎的菌體往往非常粘稠,大大降低了蛋白的純化效率。通過瓊脂糖凝膠電泳可以發(fā)現(xiàn),宿主DNA確實會與蛋白結合,并在一定程度上限制了全能核酸酶的消化。通過延長全能核酸酶的處理時間或增加用量,可以有效去除結合的宿主DNA。

 

圖1. 1-5:經(jīng)過全能核酸酶不同時長處理的樣品,處理時間越長,效果越好


2,Western-blot實驗中的應用

W-B實驗常常用于研究蛋白質(zhì)間的相互作用,當我們在研究細胞中蛋白互作網(wǎng)絡時,提取的蛋白樣本中往往含有大量核酸,使得研究者難以分辨這種互作關系是蛋白-蛋白之間形成的,還是由DNA的橋接間接導致的。同時,核酸的存在也會導致實驗結果條帶不清晰、背景較雜。
 

用全能核酸酶預處理樣品,一方面可以避免這種DNA的橋接作用的影響,另一方面可以減少背景雜質(zhì)。

 

圖2. +:用全能核酸酶預處理樣品,—:未使用全能核酸酶處理的樣本


3,CHIP-seq實驗中的應用

衰老的發(fā)生與大量染色質(zhì)變化同時發(fā)生,這很有可能就是衰老的原因。目前,研究這類變化的首選方法是染色質(zhì)免疫沉淀,然后進行測序 (ChIP-Seq)。早期常用的方法是甲醛處理細胞,再通過超聲處理產(chǎn)生150到300 bp之間的染色質(zhì)片段來完成的。但是通過這種方式得到的DNA量太少,不足以用于測序。使用全能核酸酶消化DNA和RNA,可以輕松地從衰老細胞中分離染色質(zhì)。全能核酸酶不具有蛋白酶活性,可以輕易獲得足夠的DNA并進行測序。

 

圖3. 20 分鐘內(nèi)RKO細胞中全能核酸酶對染色質(zhì)消化的比較


4,PBMC細胞結團

近年來,冷凍保存的外周血單核細胞 (PBMC) 在免疫分析中的應用急劇增加。冷凍保存的PBMC在終點頻率較低的臨床試驗中特別有用,因為可以在研究結束后進行免疫分析。此外,使用冷凍保存的PBMC可以在一個實驗室中進行所有檢測,消除了實驗室間變異性,使用冷凍PBMC還可以消除批間變異的影響。
 

除了解決儲存條件的問題以外,PBMC細胞最大的特性是在復蘇后極易結團,容易導致細胞質(zhì)量低,檢測結果不可信。在細胞復蘇的時候?qū)⑷芎怂崦讣尤氲脚囵B(yǎng)基中和細胞共培養(yǎng),可以有效防止細胞結團。

 

圖4.未經(jīng)全能核酸酶處理的過夜儲存血液的斑點計數(shù)結果顯示,四個供體有三個顯著減少,用全能核酸酶處理的過夜血液PBMC的SFC結果更接近于從新鮮血液中分離的細胞獲得的結果


三,逐典Pannarase全能核酸酶優(yōu)勢:

1.無動物源性、無氨芐青霉素

2.杰出單位比酶活、更高效的核酸降解能力

3.先進的生產(chǎn)工藝,非傳統(tǒng)His標簽純化、排除引入金屬離子風險

4.嚴格的質(zhì)控標準,內(nèi)毒水平低,確保單位酶活的準確性以及批次間穩(wěn)定性


1,全能核酸酶應用條件:

全能核酸酶的酶活會受到多種因素的影響(例如溫度、pH、離子強度等),故用量范圍也會從0.1 U/mL-250 U/mL不等。因此,不同的操作環(huán)境下酶的最佳濃度不同,需要通過實驗設置梯度進行最佳條件的摸索。


2,應用實例:

1.樣品:狂犬病毒濃縮液

處理條件:核酸酶濃度50~90U/ml ,

37 ℃處理 2 h,轉入18 ~ 26 ℃處理 6h

 

表 1.不同酶濃度對狂犬病病毒收獲液中 Vero 細胞 DNA 的去除效果【11


2.樣品:狂犬病病毒濃縮液

處理條件:25、50和100 U/ml,37℃

 

表 2.不同濃度核酸酶作用不同時間去除 Vero 細胞 DNA 效果的比較【2]

 

3.樣品:流感病毒濃縮液

處理條件:10 U/mL,37℃

 

表 3.核酸酶處理 300k 超濾濃縮效果(x± s,n=3)【3]

來源:上,|馳儀器有限公司
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