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文獻(xiàn)解讀:儲(chǔ)軍課題組開發(fā)出新型高性能基因編碼的cAMP熒光探針

瀏覽次數(shù):8965 發(fā)布日期:2022-10-19  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

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文獻(xiàn)精讀第34期

環(huán)磷酸腺苷(cAMP)是細(xì)胞內(nèi)關(guān)鍵第二信使,可整合來(lái)自多種G蛋白偶聯(lián)受體(GPCR)的信號(hào),在學(xué)習(xí)與記憶、藥物成癮、運(yùn)動(dòng)控制、免疫、腫瘤、代謝等過(guò)程中發(fā)揮重要作用;罴(xì)胞和活體水平的cAMP分子濃度變化的高時(shí)空分辨率熒光成像是解析cAMP信號(hào)通路及其生物學(xué)功能的重要基礎(chǔ)。因此,開發(fā)高靈敏的cAMP熒光探針成為研究復(fù)雜生物過(guò)程的關(guān)鍵。與非基因編碼探針(染料和材料類)相比,基因編碼探針具有低毒性、低背景、可遺傳、可定位特定細(xì)胞亞結(jié)構(gòu)或特定細(xì)胞等優(yōu)點(diǎn),在生命科學(xué)基礎(chǔ)研究中具有無(wú)可比擬的優(yōu)勢(shì)。然而,現(xiàn)有的50多個(gè)基因編碼的cAMP熒光探針要么靈敏度低(熒光變化最大只有1.5倍),要么熒光亮度較暗,很難監(jiān)測(cè)活體中微弱的內(nèi)源性cAMP變化,極大地限制了生理和病理狀態(tài)下cAMP分子調(diào)控機(jī)理和功能的研究。2022年9月12日,中國(guó)科學(xué)院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院醫(yī)工所儲(chǔ)軍課題組在國(guó)際知名期刊Nature Communications上發(fā)表了題為“A high-performance genetically encoded fluorescent indicator for in vivo cAMP imaging”的最/新成果,展示了一種高性能基因編碼的cAMP熒光探針。在該工作中,研究人員利用基于晶體結(jié)構(gòu)介導(dǎo)的理性設(shè)計(jì)和蛋白質(zhì)定向進(jìn)化技術(shù),開發(fā)了一種基于“環(huán)化重排熒光蛋白”(circularly permuted fluorescent protein)的高性能基因編碼的cAMP綠色熒光探針(命名為G-Flamp1)。在活細(xì)胞內(nèi),該探針在單光子和雙光子激發(fā)下的最大熒光變化均達(dá)到了12倍,并且結(jié)合和解離的時(shí)間達(dá)到了0.2和0.087秒。利用雙光子顯微鏡和光纖記錄儀,在果蠅和小鼠等模式生物內(nèi),該探針可實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)特定動(dòng)物行為過(guò)程中特定神經(jīng)元的cAMP信號(hào)的時(shí)空動(dòng)力學(xué)變化。

深圳先進(jìn)院儲(chǔ)軍研究員為該論文的通訊作者,深圳先進(jìn)院助理研究員王亮博士及北京大學(xué)鄔春靈博士為該論文的共同第/一作者。該工作得到了北京大學(xué)李毓龍課題組、中國(guó)科學(xué)院神經(jīng)科學(xué)研究所徐敏課題組和何杰課題組、中山大學(xué)附屬第五醫(yī)院陳守登課題組、美國(guó)堪薩斯州立大學(xué)Ho Leung Ng課題組、中國(guó)科學(xué)院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院路中華課題組和鄭煒課題組及華中科技大學(xué)高尚邦課題組等多個(gè)合作伙伴的大力支持。
 

 

為了開發(fā)適用于活體檢測(cè)的高靈敏度探針,研究人員將環(huán)化重排綠色熒光蛋白(cpGFP)插入細(xì)菌MlotiK1通道的cAMP結(jié)合結(jié)構(gòu)域(mlCNBD)中。經(jīng)過(guò)插入位點(diǎn)篩選、連接肽優(yōu)化、熒光蛋白及感應(yīng)模塊優(yōu)化,得到了具有高亮度、高靈敏度、合適親和力和快響應(yīng)速度等特征的高性能基因編碼cAMP綠色熒光探針G-Flamp1。非常有意思的是,晶體結(jié)構(gòu)顯示G-Flamp1探針的連接肽具有獨(dú)一/無(wú)二的結(jié)構(gòu):其中一個(gè)連接肽是一個(gè)非常剛性的 β-strand 結(jié)構(gòu),這在其它晶體結(jié)構(gòu)已知的環(huán)化重排熒光蛋白探針中是不存在的,為開發(fā)其它高性能探針提供了新思路和新方法。

在體外實(shí)驗(yàn)中,結(jié)合/未結(jié)合cAMP的G-Flamp1有不同發(fā)色團(tuán)環(huán)境。G-Flamp1在450nm(單光子)或者900-920nm(雙光子)激發(fā)下,動(dòng)態(tài)范圍達(dá)最大,即ΔF/F0約為13。G-Flamp1與cAMP親和力適中,其解離常數(shù)Kd值為2.17µM。G-Flamp1可在亞秒時(shí)間分辨率上檢測(cè)cAMP動(dòng)態(tài)變化。在培養(yǎng)細(xì)胞中,該探針均勻分布在細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核中,本底熒光亮度介于同類探針cAMPr和Flamindo2之間。G-Flamp1探針在活細(xì)胞中的動(dòng)態(tài)范圍達(dá)到了12倍,是目前少數(shù)幾個(gè)動(dòng)態(tài)范圍在10倍以上的熒光蛋白探針之一。同時(shí)該探針具有良好的特異性和可逆性(圖1)。

圖1 G-Flamp1探針在體外和培養(yǎng)細(xì)胞內(nèi)的表征

隨后,研究人員將G-Flamp1探針應(yīng)用于果蠅這一模式生物中。果蠅腦部蘑菇體(mushroom body)的Kenyon細(xì)胞中cAMP信號(hào)通路在氣味相關(guān)的記憶中發(fā)揮關(guān)鍵作用。作者首先獲取了Kenyon細(xì)胞中表達(dá)G-Flamp1探針的轉(zhuǎn)基因果蠅,然后利用雙光子進(jìn)行成像,果蠅受到氣味或電擊刺激時(shí),蘑菇體不同子區(qū)域呈現(xiàn)不一樣的cAMP信號(hào)時(shí)空變化(圖2),暗示不同子區(qū)域可能在聯(lián)想性學(xué)習(xí)中起著相對(duì)獨(dú)立的作用。
 

圖2 不同刺激下果蠅Kenyon細(xì)胞中cAMP信號(hào)的變化

為驗(yàn)證G-Flamp1探針在活體動(dòng)物中檢測(cè)cAMP動(dòng)態(tài)變化的實(shí)用性,研究人員利用腺相關(guān)病毒在小鼠運(yùn)動(dòng)皮層中共表達(dá)綠色G-Flamp1探針和紅色jRGECO1a鈣探針;铙w雙光子成像揭示了跑步運(yùn)動(dòng)中細(xì)胞特異性的cAMP信號(hào),其與鈣信號(hào)無(wú)明顯相關(guān)性(圖3)。這反映了小鼠運(yùn)動(dòng)時(shí)大腦皮層M1神經(jīng)元反應(yīng)的異質(zhì)性。
 

圖3 運(yùn)動(dòng)過(guò)程中小鼠皮質(zhì)神經(jīng)元內(nèi)cAMP信號(hào)的變化


最后,研究人員在小鼠大腦深部的伏隔核(NAc)腦區(qū)中表達(dá)G-Flamp1探針,并利用光纖記錄聽覺巴甫洛夫條件反射任務(wù)中該腦區(qū)cAMP信號(hào)的變化。結(jié)果表明,隨著訓(xùn)練的熟練,小鼠得到獎(jiǎng)賞時(shí)cAMP信號(hào)幅度在降低,而聽到相應(yīng)聲頻信號(hào)時(shí)cAMP信號(hào)幅度在升高(圖4);該特性與多巴胺信號(hào)類似,暗示多巴胺釋放引起了cAMP信號(hào)。綜上,G-Flamp1探針的高信噪比和高時(shí)間分辨率能夠高靈敏檢測(cè)到活體小鼠中內(nèi)源性cAMP信號(hào)的動(dòng)態(tài)變化。
 


圖4 巴甫洛夫條件反射任務(wù)中小鼠NAc腦區(qū)cAMP信號(hào)的變化


綜上所述,該研究開發(fā)了一種適用于活體檢測(cè)的cAMP熒光探針,并初步揭示了果蠅和小鼠等模式生物在特定行為過(guò)程中特定神經(jīng)元的cAMP信號(hào)變化的規(guī)律,為進(jìn)一步理解cAMP信號(hào)的調(diào)控和功能奠定了基礎(chǔ)。與廣泛使用的鈣離子探針GCaMP相比,G-Flamp1才僅僅只是開始:目前已有幾十家國(guó)內(nèi)外實(shí)驗(yàn)室在使用G-Flamp1,未來(lái)將會(huì)有更多實(shí)驗(yàn)室利用G-Flamp1來(lái)研究復(fù)雜的生物學(xué)問(wèn)題。

在未來(lái)研究中,研究人員將進(jìn)一步提高探針性能,開發(fā)適用于不同應(yīng)用場(chǎng)景的下一代高靈敏cAMP探針,并利用其揭示活細(xì)胞和活體中cAMP信號(hào)的規(guī)律、調(diào)控機(jī)制及生物學(xué)功能。與此同時(shí),結(jié)合高內(nèi)涵藥物篩選平臺(tái),上述探針也將嘗試應(yīng)用于針對(duì)GPCR受體的藥物篩選,以期發(fā)現(xiàn)更多的具有臨床價(jià)值的GPCR藥物。
 
課題組PI簡(jiǎn)介

儲(chǔ)軍,研究員,博士生導(dǎo)師。中國(guó)科學(xué)院百人計(jì)劃A類。廣東省生物醫(yī)學(xué)光學(xué)影像技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室副主任。2001年獲華中科技大學(xué)生物技術(shù)專業(yè)學(xué)士學(xué)位;2004年獲華中科技大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程專業(yè)碩士學(xué)位;2009年獲得華中科技大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程專業(yè)博士學(xué)位,2009-2015年分別在麻省大學(xué)阿莫斯特分校和斯坦福大學(xué)進(jìn)行博士后研究。2015年加入中科院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院。研究方向?yàn)樾滦凸鈱W(xué)和光聲分子探針的開發(fā)、分子信號(hào)通路的光學(xué)成像和光遺傳學(xué)、分子診斷和藥物篩選等研究等。目前已主持2項(xiàng)國(guó)家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目、主持和參與2項(xiàng)國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃,并主持多項(xiàng)深圳市項(xiàng)目,在Nature Biotechnology、Nature Methods、Nature Communications、PNAS等國(guó)際知名雜志發(fā)表論文30余篇。申請(qǐng)15項(xiàng)發(fā)明專利,并授權(quán)7項(xiàng)。

課題組長(zhǎng)期招收博士后、博/碩士生和研究助理,歡迎大家聯(lián)系,儲(chǔ)軍老師郵箱:jun.chu@siat.ac.cn。

來(lái)源:深圳市瑞沃德生命科技股份有限公司
聯(lián)系電話:400-966-9516
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