上期我們與大家一起分析鑒定了支原體樣本，

今天繼續(xù)來看看剩下的細菌樣本。

江湖上流傳很久的黑膠蟲，到底真實身份是啥？

我們一起來扒一扒~

 

逍鵬生物收集了全國29個黑膠蟲污染樣本進行DNA提取、測序、數(shù)據(jù)庫比對，得到鑒定結(jié)果。

在這29個樣本中，有11個樣本鑒定為支原體，種類分別為豬鼻支原體、牛支原體、鼠肺支原體、山羊支原體。18個樣本鑒定為細菌，種類分別為放線菌屬、羅爾斯通菌屬、短波單胞菌屬、泳池芽殖單胞菌、假單胞菌、鞘氨醇單胞菌、甲基菌屬、微桿菌屬、赫氏草螺菌。
 

接下來我們分析一下剩余的18個被鑒定為細菌的黑膠蟲樣本

首先我們來了解一下細菌基本特征

 

# 細菌污染 #

定義：一類細胞細短，結(jié)構(gòu)簡單，胞壁堅韌，多以二分裂方式繁殖和水生性強的原核生物。

結(jié)構(gòu)：主要是單細胞的原核生物，有球形，桿形，螺旋形，放線形�；�本結(jié)構(gòu)：細胞膜、細胞壁、細胞質(zhì)、擬核。特殊結(jié)構(gòu)：莢膜、鞭毛、菌毛、芽胞。大家注意，鞭毛多一些游動相對活躍，鞭毛少一些可能會原地大鉆，顫動，這就和我們觀察到的黑膠蟲現(xiàn)象相吻合了。

繁殖：多數(shù)細菌主要以二分裂方式進行繁殖。
 

圖7. 菌落圖
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這里有一些菌落的形態(tài)供大家欣賞一下，不同的微生物形成的菌落在形態(tài)、突起、邊緣上具有不同的特征，是鑒別菌種的重要依據(jù)。
 

酵母菌和霉菌屬于真菌，有成型的細胞核，放線菌和大腸桿菌屬于細菌，兩者有本質(zhì)的區(qū)別，前者有核膜包圍的細胞核，后者沒有。酵母菌的菌落呈白色光滑原斑；霉菌的菌落相對其它菌都比較大，會呈現(xiàn)青綠、灰黑等顏色；放線菌菌落呈明顯的放射狀，菌落也相對較大；大腸桿菌的菌落呈白色小圓點，和酵母菌菌落有相似之處。

 

圖8. 細菌形態(tài)（來源：百度百科）

 

細菌主要有兩種劃分標準。

根據(jù)形狀主要分為三類：球菌、桿菌、螺旋菌（包括弧菌、螺菌、螺桿菌）；

 

圖9. 革蘭氏陽性菌

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根據(jù)細胞壁的組成成分又分為革蘭氏陽性菌和革蘭氏陰性菌。丹麥細菌學家革蘭（Hans Christian Gram），他發(fā)明了革蘭氏染色。經(jīng)過染色細菌仍然保留初染結(jié)晶紫的藍紫色為革蘭氏陽性菌，經(jīng)過染色細菌脫去了初染結(jié)晶紫的顏色，帶上了蕃紅或沙黃的紅色為革蘭氏陰性菌。

 

放線菌屬  //

圖10. Actinobacterium sp.（放線菌屬）

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鑒定結(jié)果：樣本3 為 Actinobacterium sp.（放線菌屬）

類別：G+菌

形狀：絲狀；菌落呈放射狀

大�。�寬度近于桿狀細菌，直徑0.5~1 μm

代表屬：鏈霉菌屬，多達1000多種，大家所熟知的鏈霉素就是其代謝產(chǎn)物

分布范圍：土壤、空氣和水中，尤其是含水量低、有機物豐富、呈中性或微堿性的土壤中數(shù)量最多。土壤特有的泥腥味，主要是放線菌的代謝產(chǎn)物所致

 

 

羅爾斯通菌屬  //

圖11. Ralstonia sp.（羅爾斯通菌屬）

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鑒定結(jié)果：樣本4 定序為 Ralstonia sp.（羅爾斯通菌屬）

類別：G-菌

形狀：桿狀；菌落呈圓形臍狀凸起，無色透明，表面光滑濕潤，邊緣不規(guī)則

大�。�1.2×2.5~3.5 μm

代表種：植物青枯菌，寄主范圍很廣泛，可以侵染茄科、豆科、蓼科、紫草科、鳳仙花科等44科200多種植物。除煙草外，番茄、花生、辣椒、茄子、芝麻、生姜、馬鈴薯以及棉、木麻黃、油橄欖、桑都可受感染，但不危害禾本科植物

分布范圍：土壤和水等環(huán)境源中

 

 

短波單胞菌屬  //

圖12. Brevundimonas vesicularis（泡囊假單胞菌）

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鑒定結(jié)果：樣本5 為 Brevundimonas sp.（短波單胞菌屬）

類別：G-菌

形狀：桿狀；菌落為圓形，凸起，表面濕潤光滑，邊緣整齊

大�。�0.4~0.5x1-2 μm

代表種：泡囊短波單胞菌是一種較罕見的非發(fā)酵性病原性假單胞菌，在人體可引起肺炎、敗血癥、皮膚炎癥和壞死性蜂窩織炎等

分布范圍：通常存在于土壤、河流等自然界中

 

 

泳池芽殖單胞菌  //

圖13. Blastomonas（芽單胞菌屬）

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鑒定結(jié)果：樣本13 為 Blastomonas natatoria（泳池芽殖單胞菌）

類別：G-菌

形狀：卵圓形或桿狀，含有黃色或橙褐色色素。與芽單胞菌屬關(guān)系：泳池芽殖單胞菌是芽單胞菌屬的一種，通過出芽方式繁殖

分布范圍：通常存在于土壤、河流等自然界中

 

 

假單胞菌屬  //

圖14. Pseudomonas （假單胞菌屬）

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鑒定結(jié)果：樣本27 定序為 Pseudomonas sp.（假單胞菌屬

類別：G-菌

形狀：桿狀；菌落多呈藍綠色或熒光色，有生姜味

大�。�(0.5～1)×(1.5～4) μm

代表種：假單胞菌屬種類繁多，含有200余種。代表種綠膿假單胞菌，因能產(chǎn)生綠色水溶性色素，感染創(chuàng)口時可形成綠色膿液而得名。本菌是條件性致病菌，一般為繼發(fā)性感染，如大面積燒傷的創(chuàng)面感染、中耳炎、泌尿系統(tǒng)感染感染，甚至敗血癥

分布范圍：主要分布在水、土壤和空氣中，在臨床標本如傷口創(chuàng)面分泌物、膿汁、血液等檢出率較高，是醫(yī)院內(nèi)感染常見的條件致病菌

 

 

鞘脂菌屬  //

圖15. Sphingobium（鞘脂菌屬）

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鑒定結(jié)果：樣本2 定序為 Sphingobium sp.（鞘脂菌屬）

類別：G-菌

形狀：桿狀; 菌落直徑1.0-2.0mm，黃色，圓形

大�。� (0.5～1)×(1.5～4) μm

特點：該細菌嚴格好氧，無芽孢，生長溫度為10-40 ℃;最適生長溫度為30-37 ℃。生長的pH值范圍是5.5-9.0，最佳pH值在6.5到8.0之間

分布范圍：主要從土壤中分離

 

 

鞘氨醇單胞菌屬  //

圖16. Sphingomonas（鞘氨醇單胞菌）

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鑒定結(jié)果：樣本7，8，11，23 為 Sphingomonas sp.（鞘氨醇單胞菌）

類別：G-菌

形狀：桿狀；菌落為黃色

大�。�0.3-0.8x1.0-2.7 µm

特點：該菌屬至今共有12個種，是一類豐富的新型微生物資源，可用于芳香化合物的生物降解。該屬菌株憑借自身的高代謝能力與多功能的生理特性，在環(huán)境保護及工業(yè)生產(chǎn)方面具有巨大的應用潛力

分布范圍：鞘氨醇單胞菌在環(huán)境中無處不在，河水、根際、地表及深層的地下的沉積物、海洋，甚至極地土壤中都有它們的蹤跡

 

 

甲基芽孢桿菌屬  //

圖17. Methylobacillus sp（甲基芽孢桿菌屬）

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鑒定結(jié)果：樣本16 為Methylobacillus sp.（甲基芽孢桿菌屬）

類別：G-菌

形狀：桿狀，以單極毛運動或不運動；菌落形態(tài)為乳白色，透明，凸起，邊緣規(guī)則，生長緩慢

大小：0.8-1.0×1.0-8.0 μm

特點：專性甲基營養(yǎng)菌，只能生長于除了甲醇外的 C1化合物，在甲烷中也不生長。對果糖的利用因菌株而異。嚴格好氧，呼吸代謝

分布范圍：主要分布在水、土壤中

 

 

微桿菌屬  //

圖18. Microbacterium sp.（微桿菌屬）

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鑒定結(jié)果：樣本21、22 定序為Microbacterium sp.（微桿菌屬）

類別：G+菌

形狀：桿狀 ；菌落淺黃色，圓形，表面光滑、濕潤、稍凸，不透明

大小：1-10 µm long and between 0.2-0.6 µm wide

特點：微桿菌屬目前已知有40種；此類細菌特點不生孢，不抗酸。不運動或以1～3根鞭毛運動。好氧，弱厭氧�；�能異養(yǎng)菌，以呼吸代謝為主，也可能弱發(fā)酵。利用葡萄糖和一些其他糖產(chǎn)酸。營養(yǎng)要求復雜。最適生長溫度30℃

分布范圍：微桿菌屬的成員可以從廣泛的環(huán)境中分離出來，包括土壤、昆蟲、海洋環(huán)境、植物、乳制品等

 

 

赫氏草螺菌  //

圖19. Herbaspirillum spp.（草螺菌屬）

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鑒定結(jié)果：樣本24、25、26、29 定序為Herbaspirillum huttiense（赫氏草螺菌）

類別：G-菌

形狀：螺旋型；菌落呈圓形，淡黃色不透明，表面褶皺，干燥，無暈環(huán)，無凸起，直徑約1mm

大�。�長度至數(shù)十微米；螺旋波長為 5-15 µm，螺旋幅度約一乃至數(shù)微米

特點：赫氏草螺菌，具有低溫固氮的能力，是堆肥技術(shù)應用得以保氮固氮的優(yōu)秀功能菌株之一。近年來，隨著草螺菌研究的不斷深入，發(fā)現(xiàn)草螺菌具有固氮或產(chǎn)生植物激素的功能并具有使宿主植物增產(chǎn)的潛能

分布范圍：在土壤和其他自然環(huán)境中分布廣泛，是土壤和植物微生態(tài)優(yōu)勢種群之一

 

//  小結(jié)  //

在檢測的18個黑膠蟲樣本中，大多數(shù)細菌呈桿狀，只有極個別的細菌呈絲狀或螺旋型，這和觀察到的大多數(shù)黑膠蟲呈桿狀相符。通過測序鑒定，可推測黑膠蟲的身真實身份極有可能是細菌。

 

好啦~

本期分析到這里也就結(jié)束啦~

如果您也想鑒定您的細胞是否有黑膠蟲污染

快來參加逍鵬生物的

“黑膠蟲通緝令”吧~

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