Arrayjet飛行噴墨式生物芯片點(diǎn)樣技在開發(fā)新冠病毒蛋白組芯片的應(yīng)用
瀏覽次數(shù):2358 發(fā)布日期:2021-2-1
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上海交通大學(xué)系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)研究院陶生策教授團(tuán)隊(duì)聯(lián)合中科院武漢病毒研究所,佛山第四人民醫(yī)院,中科院生物物理研究所等單位在著名期刊nature communications上在線發(fā)表新冠研究重要研究成果“SARS-CoV-2 proteome microarray for global profiling of COVID-19 specific IgG and IgM responses”。
該研究團(tuán)隊(duì)基于新冠病毒蛋白的基因編碼序列,通過密碼子優(yōu)化,基因合成,病毒蛋白的體外表達(dá)和純化獲得病毒蛋白。然后通過Arrayjet Super Marathon 芯片點(diǎn)樣儀將這些新冠病毒蛋白噴點(diǎn)到覆有硝酸纖維素膜的載玻片芯片上(Grace Bio-Labs,PATH 芯片),制備出新冠病毒蛋白組芯片。該芯片覆蓋預(yù)測的28種新冠病毒蛋白中的18種。一張芯片上具有14個新冠病毒蛋白組微陣列,可進(jìn)行14個樣品的檢測。
圖1. 新冠病毒蛋白組芯片制作及實(shí)驗(yàn)流程
通過對新冠患者血清樣本進(jìn)行檢測,作者發(fā)現(xiàn)所有參檢患者血清均含有能與新冠病毒蛋白結(jié)合的IgG與IgM抗體, 尤其是特異性結(jié)合新冠病毒N蛋白與S1蛋白的抗體。另外,作者發(fā)現(xiàn)抗體還對新冠病毒蛋白ORF9b與NSP5表現(xiàn)出很強(qiáng)的反應(yīng)。S1蛋白特異性IgG信號與患者年齡和乳酸脫氫酶(LDH)水平呈正相關(guān)并與淋巴細(xì)胞百分比成負(fù)相關(guān)。
圖2.b: 用新冠病毒蛋白組芯片檢測恢復(fù)期新冠患者血清樣本和健康人群對照血清樣本;綠色和紅色信號分別代表IgG和IgM的反應(yīng)信號。
該研究團(tuán)隊(duì)提供了新冠患者免疫系統(tǒng)IgG和IgM抗體的系統(tǒng)性研究,為開發(fā)有效的新冠病毒診斷,治療和疫苗,提供了有價值的線索。
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https://www.nature.com/articles/s41467-020-17488-8
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