細(xì)胞株構(gòu)建是生物學(xué)常用的工具之一,也是很多項(xiàng)目的關(guān)鍵步驟,構(gòu)建一個(gè)好的細(xì)胞株也就成功了一半。但目前我們可能更多關(guān)注的是下游的細(xì)胞實(shí)驗(yàn),例如獲得的構(gòu)建好的質(zhì)粒轉(zhuǎn)染、富集、篩選、優(yōu)化及放大等等。而且已經(jīng)有很成熟的自動(dòng)化設(shè)備來(lái)幫助我們進(jìn)行相應(yīng)的液體操作,包括貝克曼也有全套的自動(dòng)化解決方案。但這些前提都是我們獲得了一個(gè)優(yōu)質(zhì)的質(zhì)粒。如果不是呢?
那我們?cè)撊绾慰焖儆窒到y(tǒng)的設(shè)計(jì)我們想要的細(xì)胞株呢?如何提高細(xì)胞株效能,降低風(fēng)險(xiǎn)?有如何利用有限的資源更快的做更多的測(cè)試?
基因-蛋白-細(xì)胞,系統(tǒng)化設(shè)計(jì)
非常幸運(yùn)的是,分子生物學(xué)和生物信息學(xué)技術(shù)的發(fā)展,給了我們從基因、蛋白、細(xì)胞層面等系統(tǒng)設(shè)計(jì)的可能,各種新的思路和新的技術(shù),如基因組裝、基因編輯、PCR、NGS測(cè)序技術(shù)和TXTL無(wú)細(xì)胞表達(dá)系統(tǒng)等技術(shù)可以幫助我們開(kāi)展測(cè)試。
Echo微量化,顯著降低成本,讓新技術(shù)更經(jīng)濟(jì)
系統(tǒng)化的設(shè)計(jì)必然會(huì)帶來(lái)更大的樣本量,從而導(dǎo)致更高的費(fèi)用,這也是大家對(duì)新技術(shù)和多因素考慮一個(gè)望而卻步的原因。Echo采用聲波的能量進(jìn)行無(wú)接觸式移液,且每滴液滴僅為2.5nL或25nL,因此可以直接省去吸頭耗材的消耗,也可以將檢測(cè)反應(yīng)體系降低5-100倍,使成本急劇下降。
Echo快速任意孔到任意孔移液,加快組裝,使結(jié)果更一致
在基因組裝中將不同的DNA片段混合,在檢測(cè)反應(yīng)中將不同的成本組合,在NGS文庫(kù)構(gòu)建過(guò)程中將多個(gè)文庫(kù)pooling到一起,在CRISPr基因編輯中構(gòu)建sgRNA文庫(kù)等等,都需要進(jìn)行快速、變化體積、靈活加樣,這也是傳統(tǒng)移液工作站很難突破的一點(diǎn),往往也要1小時(shí)甚至幾小時(shí)才能完成。聲波移液技術(shù)Echo的任意孔到任意孔的快速移液特點(diǎn)則讓此類(lèi)應(yīng)用簡(jiǎn)單、快速化,僅需幾分鐘即可,大大優(yōu)化工作流。
Echo加樣精準(zhǔn),提高克隆效率
使用Echo進(jìn)行微量化DNA組裝,可以在構(gòu)建更低的情況下獲得更高的轉(zhuǎn)化效率。在Gibson組裝中,反應(yīng)體系500nL和1000nL時(shí)轉(zhuǎn)化效率不差于手工操作20uL,反應(yīng)體系降低40倍;在Golden Gate組裝中,表現(xiàn)更優(yōu)秀,反應(yīng)體系低至50nL時(shí)轉(zhuǎn)化效率就不差于手動(dòng)操作7.5uL,反應(yīng)體系可降低150倍。
Echo以微量化、納升精準(zhǔn)化、快速任意孔到任意孔移液,加快細(xì)胞株開(kāi)發(fā)
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Reference:
Smart DNA Fabrication Using Sound Waves: Applying Acoustic Dispensing Technologies to Synthetic Biology. Kanigowska et al. Journal of Laboratory Automation 1–8, 2015.
*以上涉及產(chǎn)品僅用于科研和工業(yè),不用于診斷