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twistDx 的重組酶聚合酶擴增(RPA)技術(shù)原理

瀏覽次數(shù):2260 發(fā)布日期:2019-12-19  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責任自負

​twistDx 的重組酶聚合酶擴增(RPA)將徹底改變在資源有限的現(xiàn)場環(huán)境中擴增和檢測核酸的能力。

RPA 技術(shù)原理

RPA 體系的重點是重組酶,這些酶與寡核苷酸引物形成復合體,并使引物與雙鏈 DNA 中的同源序列配對。單鏈 DNA 結(jié)合(SSB)蛋白與被取代的 DNA 鏈結(jié)合,并使形成的 D 環(huán)保持穩(wěn)定。然后從引物啟動由聚合酶介導的 DNA 擴增,但前提是存在靶標序列。一旦啟動,擴增反應將快速進行,因此開始時只需一點靶標 DNA 拷貝數(shù),高特異性 DNA 擴增在數(shù)分鐘內(nèi)即可達到可檢出水平。

RPA 循環(huán)
 


RPA 的技術(shù)特點

為什么選擇 RPA 方法?

◇ 速度

RPA 非常快速,在 37~42 °C 這一通常最適宜的反應溫度下,只需少量核酸分子即可在 3~10 分鐘(通常)內(nèi)擴增至可檢出水平,但這將取決于靶標大小。在大部分情況下,只需要一個人即可在半小時內(nèi)采集樣本、制備樣本、運行檢測并取得結(jié)果,并且無需專業(yè)培訓。

◇ 靈敏度

RPA 可檢測復合樣本中的單拷貝 DNA 和 10 拷貝甚至更少 RNA,而無需預先純化核酸。

◇ 特異性

RPA 具有高度特異性,該技術(shù)可從可能含有數(shù)百納克來自多個不同物種的不相關(guān)復合基因組 DNA(包括人 DNA)的樣本中識別并擴增單個 DNA 分子,抗干擾能力強。

◇ 恒溫運行

RPA 在恒定的低溫(37~42 °C 最適宜)下運行。對于某些應用,如果需要,即便體溫也可支持 RPA 擴增。該反應在偏離溫度及低溫設置下也表現(xiàn)穩(wěn)健,即使在常規(guī)室溫 25 °C 下也將奏效,雖然反應速度會下降; 在此溫度下,只要此生物化學過程被正確配置,仍可在一小時內(nèi)獲得結(jié)果。

◇ 樣本容差

RPA 對樣本類型的要求寬松,有時可直接檢測未經(jīng)核酸純化的原始樣本,例如血液、鼻拭子或培養(yǎng)基。通常,只需采用基本的病原體裂解方法處理樣本以釋放核酸即可,例如熱處理或弱堿處理。每種檢測所需的最合適的樣本制備方法取決于病原體滴定度、是否存在抑制劑以及裂解要求等因素,并將需要設計到檢測程序中。RPA 對某些復合樣本類型的寬容性使該技術(shù)非常適合廣泛的現(xiàn)場實地應用。

◇ 廣泛的適用性

RPA 能夠方便地應用于任何 DNA 或 RNA 靶標,無序列偏好性,這一點對于 NGS 尤其重要。如果將逆轉(zhuǎn)錄酶添加到反應混合液中開發(fā)出了超高靈敏度的 RNA 一步檢測法。

◇ 多重檢測

通過將多種引物同時添加到同一反應管中,單次 RPA 測試即可擴增和檢測多種不同的靶標。

◇ 低設備成本

RPA 僅需要基本的檢測設備,也就是說,最終用戶可以使用 RPA 技術(shù)開發(fā)出適合各種應用和環(huán)境的人性化診斷方法和試劑盒。

◇ 靈活的試劑形態(tài)

核心反應組分能夠以穩(wěn)定的干燥形態(tài)供貨,該形態(tài)易于運輸,且無需冷藏即可儲存最多 12 個月(穩(wěn)定性可能因用途不同而有變化,因此仍建議在冷藏條件下長期儲存),也能夠以 PCR 試劑更常見的液體形態(tài)供貨,該形態(tài)允許用戶針對特定的應用改變反應體積和組分比例。

◇ 多種檢測形式

RPA 可應用于各種檢測系統(tǒng)和儀器,包括實時熒光探針和夾心法等形式。


RPA 與 其他核酸擴增方法 PCR 及 LAMP 的比較



產(chǎn)品系列
 

TwistAmp? 試劑盒(隨附凍干試劑)的試劑形態(tài)具有高度便利性,非常適合在現(xiàn)場、床邊等環(huán)境中使用,而且特別適用于無法維持冷鏈的情況下。TwistAmp? 研究試劑盒包含使用最終用戶設計的特定引物進行核酸擴增時所需的所有試劑。

包含凍干試劑的 TwistAmp? 試劑盒具有以下優(yōu)勢:

* RPA 擴增溫度要求低,允許使用低成本、便于攜帶的檢驗設備。

* 干 RPA 試劑足夠穩(wěn)定,可以在室溫下運輸。

* 允許多種「適宜現(xiàn)場的」檢測輸出技術(shù),例如側(cè)向?qū)游黾夹g(shù)和熒光技術(shù)。

* RPA 對一些復雜樣本類型表現(xiàn)出高度穩(wěn)健性(即樣本耐受性),更適合于許多不同的現(xiàn)場實地應用。

除了在現(xiàn)場實地使用中的優(yōu)勢,通過 TwistAmp? 試劑盒還便于為許多應用和用途開發(fā)出快速、特異且靈敏的 DNA 和 RNA 檢測方法。


 

TwistAmp? Basic 試劑盒可實現(xiàn) DNA 擴增。包含 DNA 擴增所需的所有酶和試劑,用戶只需提供引物和模板。使用 TwistAmp? Basic 時,即使 PCR 引物也有效。TwistAmp? Basic 已被用于固相、加尾引物、配基、電化學和微陣列等應用。

非常適用于:終點凝膠電泳 DNA 檢測、下游應用(例如亞克。
 


TwistAmp? exo 試劑盒可實現(xiàn)實時熒光 DNA 擴增。若想要以均相形式將 TwistDx RPA 擴增技術(shù)與 TwistDx 專利熒光 TwistAmp? exo 探針結(jié)合使用,則推薦使用本產(chǎn)品。用戶只需提供引物、探針和模板。更多信息請參閱手冊。

非常適用于:實時熒光 DNA 檢測
 

TwistAmp? nfo 試劑盒可實現(xiàn)橫向流動檢測用 DNA 擴增。若想要通過終點夾心法(例如橫向流動 [LF] 試紙條)檢測有效 DNA 擴增反應的產(chǎn)物,則適合使用本產(chǎn)品。用戶只需提供引物、探針和模板。

非常適用于:開發(fā)低成本的現(xiàn)場側(cè)向?qū)游鰴z測方法。
 


TwistAmp? Liquid 是為了提供散裝液體形態(tài)的核心 RPA 組分,最終用戶能夠以不同的比例混合這些組分,以便用戶為各自的應用配制預混液*。

TwistAmp? Liquid 具有以下優(yōu)勢:

最終用戶可自由調(diào)整預混液制備量,而不再被局限于凍干試劑的固定體積

最終用戶可自由調(diào)整反應體系中的組分比例,這使 RPA 試驗開發(fā)工作具有更大的靈活性

TwistAmp? Liquid Basic 是一款最適合用于凝膠分析或者作固相、加尾引物、適配體、電化學和微陣列應用的 DNA 擴增試劑盒。TwistAmp? Liquid exo 是一款用于以實時熒光檢測擴增反應的 DNA 擴增試劑盒。
 

 

以靈活的液體形態(tài)實現(xiàn) DNA 擴增。包含 DNA 擴增所需的所有酶和試劑,用戶只需提供引物、dNTP 和模板。更多信息請參閱手冊。

非常適用于:終點凝膠電泳 DNA 檢測、下游應用(例如亞克隆)、便于使用不同的 RPA 反應體積或改變組分比例
 

以靈活的液體形態(tài)進行實時熒光 DNA 擴增。若想要將 RPA 與 TwistDx 專利熒光 TwistAmp? exo 探針結(jié)合使用,則推薦使用本產(chǎn)品。除了基本的組分,還包含強大的核酸酶 (核酸外切酶 I),該酶將在擴增反應期間處理 TwistAmp? exo 探針并產(chǎn)生實時讀出。用戶只需提供引物、探針、dNTP 和模板。

非常適用于:實時熒光 DNA 檢測,便于使用不同的 RPA 反應體積或改變組分比例


默瑞生物是 TwistDx Inc 品牌的中國代理商,歡迎大家咨詢訂貨。
默瑞熱線:4006-400-850
售前咨詢:info@moreybio.com
產(chǎn)品訂購:order@moreybio.com
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默瑞官網(wǎng):www.moreybio.com

公司背景

TwistDx Inc. 由分子生物學家兼蛋白生物化學家 Niall Armes 博士以及 Derek Stemple 博士和 Nagesh Mahanthappa 博士于 1999 年共同創(chuàng)立,其總部位于美國馬薩諸塞州劍橋市。TwistDx Limited 于 2002 年成立,其公司位于英國劍橋,2010 年被 IVD 行業(yè) POCT 巨頭美艾利爾 Alere 收購,Alere 在 2017 年 4 月被雅培 Abbott 收購。

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    • TwistAmp? Liquid exo

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    • Twist Amp? Liquid 研發(fā)試劑盒

    • TwistAmp? nfo

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    • TwistAmp? 凍干研發(fā)試劑盒

來源:默瑞(上海)生物科技有限公司
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