感染性疾病是當(dāng)今世界嚴(yán)重威脅人類健康的重大疾病，快速、準(zhǔn)確的診斷是有效治療、病情監(jiān)測和控制疾病蔓延的重要前提。隨著分子檢測技術(shù)的不斷發(fā)展和完善，分子檢測在病原微生物感染診斷及治療監(jiān)測上的臨床應(yīng)用日益廣泛，已成為一些重要的感染性疾病的診斷和療效評價中不可缺少的重要工具。
隨著基礎(chǔ)研究的深入與技術(shù)的進步，病原微生物的認(rèn)知程度和檢測市場也不斷增長，為了適應(yīng)未來發(fā)展需求，AMTK推出了系列病原微生物分子檢測方向的自動化解決方案，整個流程方便快速、自動化程度高、結(jié)果精確、污染率低，很好的服務(wù)于血站、醫(yī)院、疾控中心、第三方醫(yī)學(xué)檢驗所等機構(gòu)。
       目前常用的病原微生物分子檢測方法主要包括：基于PCR的電泳法、實時熒光定量PCR（QPCR）、數(shù)字PCR、基因芯片技術(shù)、測序技術(shù)（Sanger測序技術(shù)、焦磷酸測序技術(shù)、高通量測序技術(shù)）等。今天給大家分享的AMTK病原微生物自動化解決方案主要基于 QPCR和NGS檢測方法。       QPCR技術(shù)已經(jīng)廣泛應(yīng)用于已知病原微生物的定性和定量檢測、基因分型、耐藥性基因檢測等方面，一方面用于個體病情評估、療效預(yù)測、預(yù)后判斷等，在感染性疾病的個體化治療中具有重要的臨床應(yīng)用價值；另一方面用于了解病毒的流行狀況, 監(jiān)測病毒的流行型別, 發(fā)現(xiàn)病毒傳染源, 對于制定有針對性病毒性傳染性疾病的防控策略和措施具有重要意義。
方案一：高通量QPCR檢測自動化解決方案
該方案一次可完成96-192 個樣本的檢測
1、病原微生物QPCR檢測流程圖

2、工作站配置
配置說明

3、案例分享
（1）EB病毒QPCR檢測
16個樣本分別人工和AMTK工作站進行提取和QPCR體系構(gòu)建，其中工作站平行3次實驗，數(shù)據(jù)對比如下：


結(jié)論：EB病毒的自動化提取效果與人工提取無顯著差異，樣本濃度達(dá)到測試要求。
（2）HPV病毒QPCR檢測
2個樣本原液和梯度稀釋4次，分別人工和AMTK工作站進行HPV提取，QPCR檢測結(jié)果如下：


結(jié)論：實驗組AMTK和對照組人工的QPCR檢測結(jié)果無顯著差
方案二：原管上樣QPCR檢測自動化一體機解決方案
該方案實現(xiàn)樣品處理全流程自動化
1、QPCR檢測流程圖

2、主機配置

3、案例分享
（1）HPV核酸提取檢測數(shù)據(jù)
32個宮頸脫落細(xì)胞保存液原管上樣，AMTK LH-1808工作站進行HPV核酸提取，提取后DNA的檢測結(jié)果如下：
結(jié)論：AMTK LH-1808原管上樣及核酸提取濃度均一性、濃度和純度在合格范圍內(nèi)。
  如今，NGS已經(jīng)迅速成為臨床實驗室的重要檢測平臺，延展提高了經(jīng)典微生物方法的檢測能力。NGS技術(shù)在病原微生物檢測上的應(yīng)用，主要作用有：（1）病原體快速鑒定（特別是對未知或者無法培養(yǎng)的病原）；（2）通過病原體基因組變異，研究病原體隨時間的變異情況，有助于疫情起源追蹤與疫情監(jiān)測；（3）研究病原體的種屬信息、耐藥情況、毒力因子、與宿主的相互作用等，提供快速精準(zhǔn)診斷依據(jù)、輔助疾病治療與防控，促進藥物的合理使用。
方案： NGS全流程檢測解決自動化方案
該方案可完成1-32 個樣本的NGS檢測
1、病原微生物NGS檢測流程圖：



2、​工作站配置












3、案例分享
16個樣本分別人工和AMTK LH-1406工作站進行核酸提取和文庫構(gòu)建，文庫QPCR定量結(jié)果如下：

數(shù)據(jù)顯示：AMTK LH-1406工作站與人工提取和文庫構(gòu)建后的QPCR結(jié)果無明顯差異。
 
    奧美泰克在病原微生物分子檢測方面提供了系列樣本前處理的自動化解決方案，不僅節(jié)省人力成本，縮短檢測時間，而且保證樣本結(jié)果的均一性和準(zhǔn)確性。未來，奧美泰克隨著病原微生物檢測市場規(guī)模的不斷增長，將整合更多智能化功能模塊，如離心、血漿分離、QPCR
分析系統(tǒng)等，將優(yōu)質(zhì)、高效、一體化的自動化方案呈現(xiàn)給客戶。
 
 
參考資料

1. 感染性疾病相關(guān)個體化醫(yī)學(xué)分子檢測技術(shù)指南。

      2、華大王威博客—NGS與病原體生物鑒定。