1. 使用1×TAE緩沖液制作瓊脂糖凝膠,然后對(duì)目的DNA進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳。(參照瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)DNA實(shí)驗(yàn))
2. 在紫外燈下切出含有目的DNA(約600bp)的瓊脂糖凝膠,用紙巾吸盡凝膠表面的液體。此時(shí)應(yīng)注意盡量切除不含目的DNA部分的凝膠,盡量減小凝膠體積,提高DNA回收率。
注意:切膠時(shí)請(qǐng)注意不要將DNA長(zhǎng)時(shí)間暴露于紫外燈下,以防止DNA損傷。
3. 切碎膠塊。膠塊切碎后可以加快操作步驟6的膠塊融化時(shí)間,提高DNA的回收率。
4. 稱量膠塊重量,計(jì)算膠塊體積。計(jì)算膠塊體積時(shí),以1mg=1µL進(jìn)行計(jì)算。
5. 向膠塊中加入膠塊融化液DR-I Buffer,DR-I Buffer的加量如下表:
凝膠濃度 | DR-I Buffer 使用量 |
1% | 3個(gè)凝膠體積量 |
1%-1.5% | 4個(gè)凝膠體積量 |
1.5%-2% | 5個(gè)凝膠體積量 |
6. 均勻混合后75℃加熱,融化膠塊(低熔點(diǎn)瓊脂糖凝膠只需在45℃加熱)。此時(shí)應(yīng)間斷振蕩混合,使膠塊充分融化(約6~10分鐘)。
注意:膠塊一定要充分融化,否則將會(huì)嚴(yán)重影響DNA的回收率。
7. 向上述膠塊融化液中加入DR-I Buffer量的1/2體積量的DR-II Buffer,均勻混合。當(dāng)分離小于400 bp的DNA片段時(shí),應(yīng)在此溶液中再加入終濃度為20%的異丙醇。
8. 將試劑盒中的Spin Column安置于Collection Tube上。
9. 將上述操作7的溶液轉(zhuǎn)移至Spin Column中,12000 rpm離心1min,棄濾液。
注意:如將濾液再加入Spin Column中離心一次,可以提高DNA的回收率。
10. 將500 µL的Rinse A加入Spin Column中,12000 rpm離心30s,棄濾液。
11. 將700 µL的Rinse B加入Spin Column中,12000 rpm離心30s,棄濾液。
12. 重復(fù)操作步驟11。
13. 將Spin Column安置于新的1.5 mL的離心管上,在Spin Column膜的中央處加入25 µL的滅菌蒸餾水或Elution Buffer,室溫靜置1min。
注意:使用加熱至60℃的滅菌蒸餾水或Elution Buffer有利于提高洗脫效率。
14. 12000 rpm離心1min洗脫DNA。
-20℃低溫保存純化的目的DNA片段。