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植物miRNA及piRNA的逆轉錄

瀏覽次數(shù):6728 發(fā)布日期:2014-9-29  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負


miRNA在植物的發(fā)育、抗病、和應激反應中發(fā)揮著重要作用。一般認為,這些小的非編碼RNA通過靶向mRNA剪切,在后轉錄水平調節(jié)植物的基因表達。這些基因表達中的靶向變化由數(shù)百個成熟miRNA的差異表達所調控,每個成熟miRNA結合在靶mRNA的特定序列上。因此,對植物的成熟miRNA調控和表達進行分析,能夠為植物的組織發(fā)育、干旱保護及疾病防御機理提供寶貴信息。目前基本無法通過qRT-PCR對植物的成熟miRNA進行分析,由于植物miRNA的特性,基于多聚腺苷酸的逆轉錄反應對其反應效率十分低下。QIAGEN推出了獨特的解決方案,能夠對植物組織中的成熟miRNA進行通用的逆轉錄反應。

QIAGEN miScript Plant RT Kit用于植物miRNA和其他3’端修飾的小RNA的cDNA合成;是針對具有3’端甲基化(2’-O-Me)修飾的小RNA進行無偏差 cDNA合成的通用型試劑盒。本試劑盒專為基于實時定量PCR技術的小RNA表達分析應用設計和優(yōu)化,能夠配合miScript SYBR Green PCR Kit和miScript miRNA PCR Array或miScript Primer Assay等產品使用。這一類通過功能驗證的分析和芯片產品可應用于水稻、玉米、大豆、煙草和其他一些重要農業(yè)作物的檢測,以及植物學相關的研究。在3’末端堿基具有2’-O-Me甲基化修飾的小RNA(如植物成熟miRNA和piwi互作RNA (piRNA))中,一般不具有poly A尾結構,因此無法通過多聚腺苷酸依賴的cDNA合成方法有效地反轉錄。專用的miScript Plant RT Kit通過首先向植物miRNA的3’末端連接一個接頭解決了這一難題。不同于多聚腺苷酸化,這一鏈接反應不會受到植物miRNA 3’末端堿基上存在的2’-O-Me甲基化修飾的負面抑制。接頭一旦連接成功,即可實現(xiàn)反轉錄反應。

性   能

miScript Plant RT Kit與miScript Plant qPCR System的聯(lián)合使用,能夠確保針對植物樣本實現(xiàn)靈敏和特異性的miRNA檢測和定量工作。由于許多miRNA表達豐度很低,因此檢測靈敏度對于確保獲得可靠數(shù)據至關重要。miScript Plant qPCR System能夠提供優(yōu)異的靈敏度,寬廣的動態(tài)監(jiān)測范圍,以及始終如一的高擴增效率。miScript Plant qPCR System的良好性能將幫助您于首次嘗試時,即在技術重復和生物重復樣本之間獲得高度可重復的結果。

操作流程

反轉錄反應可方便地進行。通常在連接反應介導的反轉錄反應中,一般使用含有3’端2’-O-Me修飾小RNA的總RNA做為起始材料。反轉錄是一個簡單直接的操作步驟,包含了37℃下1小時的溫育反應,以及之后在95℃下通過短暫孵育對反應進行失活。

應   用

miScript Plant RT Kit通常做為miScript Plant PCR System的一部分,用于進行: 

  • 植物成熟miRNA的定量和表達譜分析
  • piRNA的定量和表達譜分析

相關產品信

產品貨號

產品名稱

218760

miScript Plant RT Kit (12)

218761

miScript Plant RT Kit (50)

218762

miScript Plant RT Kit (96)

218073

miScript SYBR Green PCR Kit (200)

218075

miScript SYBR Green PCR Kit (1000)

218076

miScript SYBR Green PCR Kit (2000)

218300

miScript Primer Assay (100)

Varies

miScript miRNA PCR Arrays

 以上信息來源QIAGEN:

 




 閱讀原文:

來源:杭州聯(lián)科生物技術股份有限公司
聯(lián)系電話:4006721600
E-mail:network@liankebio.com

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