水化上樣( 被動上樣)
1. 從冰箱中取出 IPG 膠條,室溫放置 10min。
2. 沿水化盤槽的邊緣從左向右線性加入樣品,槽兩端各 1cm 左右不加樣,中間的樣品液一定要連貫。注意:不要產生氣泡,否則會影響膠條中蛋白質的分布。
3. 用鑷子輕輕撕去 IPG 膠條上的保護層。注意:堿性端較脆弱,應小心操作。
4. 將IPG膠條膠面朝下輕輕置于水化盤中樣品溶液上。注意:不要將樣品溶液弄到膠條背面,因為這些溶液不會被膠條吸收; 還使膠條下面的溶液產生氣泡。如產 生了氣泡,用鑷子輕輕地提起膠條的一端,上下移動膠條,直到氣泡被趕走。
5. 放置 30~45min 大部分樣品被膠條吸收,沿著膠條緩慢加入礦物油,每根膠條 約 3ml(17cmIPG),防止膠條水化過程中液體蒸發(fā)。
6. 置等電聚焦儀于- 20℃水化 11~15h。
第一向 等電聚焦
1. 將紙電極置于聚焦盤的正負極上,加 ddH2O 5~8μl 潤濕。
2. 取出水化好的膠條,提起一端將礦物油瀝干,膠面朝下,將其置于剛好潤濕 的濾紙片上雜交以去除表面上的不溶物。
3. 將 IPG 膠條膠面朝下置于聚焦盤中,膠條的正極(標有+)對應于聚焦盤的正 極,確保膠條與電極緊密接觸。
4. 在每根膠條上覆蓋 2- 3ml 礦物油。
5. 對好正、負極,蓋上蓋子。設置等電聚焦程序。
6. 聚焦結束的膠條,立即進行平衡、第二向 SDS-PAGE電泳;驅⒛z條置于樣 品水化盤中,- 20℃冰箱保存,電泳前取出膠條, 室溫放置10 分鐘,使其溶解。
第二向 SDS-PAGE電泳
1. 配制 12%的凝膠。
2. 待凝膠凝固后, 倒去分離膠表面的MilliQ水、 乙醇或水飽和正丁醇,用MilliQ 水沖洗。
3. 配制膠條平衡緩沖液 I
4. 在桌上先放置干的厚濾紙,聚焦好的膠條膠面朝上放在干的厚濾紙上。將另 一份厚濾紙用 MilliQ水浸濕,擠去多余水分,然后直接置于膠條上,輕輕吸 干膠條上的礦物油及多余樣品,這樣可以減少凝膠染色時出現(xiàn)的縱條紋。
5. 將膠條轉移至樣品水化盤中,加入 6ml(17cmIPG)平衡緩沖液 I ,在水平搖床 上緩慢搖晃 15 分鐘。
6. 配制膠條平衡緩沖液 II 。
7. 第一次平衡結束后,取出膠條將之豎在濾紙上瀝去多余的液體,放入平衡緩 沖液 II 中,繼續(xù)在水平搖床上緩慢搖晃 15 分鐘。
8. 用濾紙吸去 SDS-PAGE膠上方玻璃板間多余的液體,將二向凝膠放在桌面上, 凝膠的頂部面對自己。
9. 將瓊脂糖封膠液加熱溶解。
10. 在 100ml 量筒中加入 TGS 電泳緩沖液。
11. 第二次平衡結束后,取出膠條,用濾紙吸去多余的平衡液(將膠條豎在濾紙 上,以免損失蛋白或損壞凝膠表面) 。
12. 用鑷子夾住膠條的一端使膠面完全浸末在 1×電泳緩沖液中漂洗數(shù)次。
13. 將膠條背面朝向玻璃板,輕輕放在長玻板上,加入低熔點瓊脂糖封膠液。
14. 用適當厚度的膠片,輕輕地將膠條向下推,使之與聚凝膠膠面完全接 觸。注意:不要在膠條下方產生氣泡, 應推動凝膠背面的支撐膜, 不要碰到面膠。
15. 放置 5 分鐘,使低熔點瓊脂糖封膠液凝固。
16. 打開二向電泳制冷儀,調溫度為 15℃。
17. 將凝膠轉移至電泳槽中,加入電泳緩沖液,接通電源,起始時用的低電流(5mA~10mA/gel/17cm) ,待樣品在完全走出IPG 膠條,濃縮成一條線后,再加大電流 (20-30mA/gel/17cm) 待溴酚藍指示劑達到底部邊緣時即可停止電泳。
18. 電泳結束后,輕輕撬開兩層玻璃,取出凝膠,并切角以作記號(戴手套,防 止污染膠面) 。
19. 進行染色。