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                                Sanger測序服務(wù)——EST測序
                                表達(dá)序列標(biāo)簽,短的、單次(測序)閱讀的cDNA序列,也包括來自于差異顯示和RACE實(shí)驗(yàn)的cDNA序列。
                                服務(wù)類別:測序/合成總訪問:3729
                                最后更新:2015-7-14半年訪問:80
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                                • 服務(wù)介紹
                                • 公司簡介

                                Sanger測序服務(wù)——EST測序

                                詳細(xì)描述:
                                EST(Expressed Sequence Tag)表達(dá)序列標(biāo)簽是指隨機(jī)從構(gòu)建的cDNA文庫中挑選克隆,并進(jìn)行5'端和3'端一次性測序所獲得的短cDNA部分序列,一般長度為150~500bp。雖然EST只是完整基因的一部分,但是其序列長度已足以代表該基因,因此可以采用EST特異性地標(biāo)記基因。目前,EST的數(shù)目比GenBank中其他核苷酸序列多,所以在EST 庫中更容易搜尋到新的基因,它已被廣泛地應(yīng)用于基因的識(shí)別。另外,由于EST 來源于特定組織在特定環(huán)境下總mRNA所構(gòu)建的cDNA文庫,因此EST也能說明該組織中各基因的表達(dá)水平。

                                EST測序的應(yīng)用 
                                1. 基因表達(dá)譜分析
                                2. SSR標(biāo)記的發(fā)掘 
                                3. 作為構(gòu)建分子標(biāo)記連鎖圖譜所用的探針
                                 
                                基本信息分析
                                1. 從峰圖到序列的轉(zhuǎn)化,去除低質(zhì)量的序列和載體序列
                                2. 序列拼接
                                3.  EST注釋
                                4. ORF預(yù)測及分析
                                5. 基因注釋(NR、NT數(shù)據(jù)庫)  
                                 
                                高級(jí)信息分析
                                1. 功能蛋白分析
                                2. Interpro功能域分析
                                3. 序列屬性及其對應(yīng)Unigene的分析
                                4. COG分析
                                5. Pathway分析

                                實(shí)驗(yàn)周期

                                EST測序?qū)嶒?yàn)周期視具體測序量而定;旧镄畔⒎治觯荷儆5000條為10個(gè)工作日左右,多于5000條為15個(gè)工作日左右。


                                提供結(jié)果 
                                1. 測序峰圖及序列文件
                                2. 生物分析報(bào)告

                                 

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