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Sanger測序服務(wù)——EST測序
表達(dá)序列標(biāo)簽,短的、單次(測序)閱讀的cDNA序列,也包括來自于差異顯示和RACE實(shí)驗(yàn)的cDNA序列。
服務(wù)類別:測序/合成總訪問:3729
最后更新:2015-7-14半年訪問:80
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Sanger測序服務(wù)——EST測序

詳細(xì)描述:
EST(Expressed Sequence Tag)表達(dá)序列標(biāo)簽是指隨機(jī)從構(gòu)建的cDNA文庫中挑選克隆,并進(jìn)行5'端和3'端一次性測序所獲得的短cDNA部分序列,一般長度為150~500bp。雖然EST只是完整基因的一部分,但是其序列長度已足以代表該基因,因此可以采用EST特異性地標(biāo)記基因。目前,EST的數(shù)目比GenBank中其他核苷酸序列多,所以在EST 庫中更容易搜尋到新的基因,它已被廣泛地應(yīng)用于基因的識(shí)別。另外,由于EST 來源于特定組織在特定環(huán)境下總mRNA所構(gòu)建的cDNA文庫,因此EST也能說明該組織中各基因的表達(dá)水平。

EST測序的應(yīng)用 
1. 基因表達(dá)譜分析
2. SSR標(biāo)記的發(fā)掘 
3. 作為構(gòu)建分子標(biāo)記連鎖圖譜所用的探針
 
基本信息分析
1. 從峰圖到序列的轉(zhuǎn)化,去除低質(zhì)量的序列和載體序列
2. 序列拼接
3.  EST注釋
4. ORF預(yù)測及分析
5. 基因注釋(NR、NT數(shù)據(jù)庫)  
 
高級(jí)信息分析
1. 功能蛋白分析
2. Interpro功能域分析
3. 序列屬性及其對應(yīng)Unigene的分析
4. COG分析
5. Pathway分析

實(shí)驗(yàn)周期

EST測序?qū)嶒?yàn)周期視具體測序量而定;旧镄畔⒎治觯荷儆5000條為10個(gè)工作日左右,多于5000條為15個(gè)工作日左右。


提供結(jié)果 
1. 測序峰圖及序列文件
2. 生物分析報(bào)告

 

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