Sanger測序服務(wù)——EST測序
詳細(xì)描述:
EST(Expressed Sequence Tag)表達(dá)序列標(biāo)簽是指隨機(jī)從構(gòu)建的cDNA文庫中挑選克隆,并進(jìn)行5'端和3'端一次性測序所獲得的短cDNA部分序列,一般長度為150~500bp。雖然EST只是完整基因的一部分,但是其序列長度已足以代表該基因,因此可以采用EST特異性地標(biāo)記基因。目前,EST的數(shù)目比GenBank中其他核苷酸序列多,所以在EST 庫中更容易搜尋到新的基因,它已被廣泛地應(yīng)用于基因的識(shí)別。另外,由于EST 來源于特定組織在特定環(huán)境下總mRNA所構(gòu)建的cDNA文庫,因此EST也能說明該組織中各基因的表達(dá)水平。
EST測序的應(yīng)用
1. 基因表達(dá)譜分析
2. SSR標(biāo)記的發(fā)掘
3. 作為構(gòu)建分子標(biāo)記連鎖圖譜所用的探針
基本信息分析
1. 從峰圖到序列的轉(zhuǎn)化,去除低質(zhì)量的序列和載體序列
2. 序列拼接
3. EST注釋
4. ORF預(yù)測及分析
5. 基因注釋(NR、NT數(shù)據(jù)庫)
高級(jí)信息分析
1. 功能蛋白分析
2. Interpro功能域分析
3. 序列屬性及其對應(yīng)Unigene的分析
4. COG分析
5. Pathway分析
實(shí)驗(yàn)周期
EST測序?qū)嶒?yàn)周期視具體測序量而定;旧镄畔⒎治觯荷儆5000條為10個(gè)工作日左右,多于5000條為15個(gè)工作日左右。
提供結(jié)果
1. 測序峰圖及序列文件
2. 生物分析報(bào)告
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上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司專注于新一代DNA高通量測序技術(shù)的應(yīng)用和推廣、生物信息分析、臨床診斷試劑盒研發(fā)和轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究,是上海張江高科技園區(qū)、張江藥谷重點(diǎn)支持企業(yè),華東師范大學(xué)戰(zhàn)略合作單位。目前,美吉生物在上海、北京、廣州三個(gè)一線城市建立了實(shí)驗(yàn)基地,銷售網(wǎng)絡(luò)遍布全國各地。
美吉生物擁有世界一流的測序平臺(tái),在ABI3730xl常規(guī)測序平臺(tái)的基礎(chǔ)上,先后引進(jìn)了羅氏454高通量測序平臺(tái)和Illumina高通量測序平臺(tái),專業(yè)提供動(dòng)植物基因組測序、微生物基因組測序、宏基因組測序、轉(zhuǎn)錄組測序、小RNA測序、基因表達(dá)譜分析等技術(shù)服務(wù)。
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生物信息學(xué)是國際前沿的新興學(xué)科,近年來發(fā)展迅猛。美吉生物擁有一支具有國際一流水平的生物信息分析團(tuán)隊(duì),不僅可以提供標(biāo)準(zhǔn)流程化的生物信息分析,還可以根據(jù)不同的課題需求,提供個(gè)性化的深度數(shù)據(jù)挖掘。
B2B(Bench to Bedside)的轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)模式,大大縮短了醫(yī)學(xué)科學(xué)從基礎(chǔ)研究到臨床應(yīng)用的時(shí)間,加速了人類進(jìn)入基因組醫(yī)學(xué)時(shí)代的步伐;趯ξ磥磲t(yī)學(xué)發(fā)展趨勢的充分理解,美吉生物和國內(nèi)多家著名三甲醫(yī)院聯(lián)合建立了轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)中心,開展轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究,以迎接基因組醫(yī)學(xué)時(shí)代的到來。
美吉生物秉承“專業(yè)、卓越”的企業(yè)理念,“以客戶為本,讓客戶滿意”的服務(wù)宗旨,一如既往地致力于提供高品質(zhì)、高效率的技術(shù)服務(wù),努力將公司打造成為國內(nèi)一流企業(yè)。因?yàn)榫礃I(yè),所以專業(yè);因?yàn)閷I(yè),所以選擇;選擇美吉,選擇滿意!