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Sanger測序服務——小基因組Shotgun測序
全長Shotgun測序 大片段全長鳥槍法測序
服務類別:測序/合成總訪問:4116
最后更新:2015-7-14半年訪問:93
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Sanger測序服務——小基因組Shotgun測序

詳細描述:
鳥槍戰(zhàn)略(Shotgun Strategy)又稱隨機測序戰(zhàn)略,是由美國塞萊拉遺傳公司創(chuàng)始人克雷格·文特爾發(fā)明,主要針對大片段的全長測序。此策略是將基因組DNA用機械方法隨機打斷成小片段,并連入合適的載體構建亞克隆文庫,從中隨機挑取克隆測序,再通過生物信息學方法對測得的序列進行拼接組裝以獲得大片段DNA的序列。
構建不同插入片段大小的Shotgun文庫(1.5~3 Kb、4~6 Kb、6~8 Kb等),可減少因基因組中的重復序列造成的錯誤拼裝,提供更多Contigs之間的關聯信息。Shotgun策略已廣泛應用于包括基因組、葉綠體、線粒體、野生質粒、噬菌體、病毒以及Fosmid/Cosmid/BAC克隆等的全長測序。


 

BAC全長測序流程圖
 
美吉優(yōu)勢
1. 成熟的Shotgun文庫構建體系,確保您在最短時間拿到數據    我們曾創(chuàng)造了10個工作日完成40 Kb Fosmid全長測序的記錄。
2. 專業(yè)的生物信息團隊    能提供可靠精準的序列拼接結果,8~10倍覆蓋率,phred-20質量標準,全長準確率大于99.99%,并可提供專業(yè)的生物信息分析。
3. 豐富的實戰(zhàn)經驗    目前已成功完成了包括鏈霉菌、水稻、番茄、揚子鱷、熊貓、朱鹮等物種的Fosmid/BAC克隆全長測序1000余例,小鼠、蚯蚓、油菜花、大豆等物種的線粒體100余例,大腸桿菌的野生質粒、噬菌體、病毒等全長測序20余例。我們所提供的全長序列已被眾多實驗室用于發(fā)表學術論文。
 
收費標準

樣品來源
內容
技術指標
價格
Fosmid/Cosmid
全長
測序
獲得大片段DNA全序列;無Gap;測序覆蓋率8~10倍;單堿基準確率99.99%以上。
0.6元/bp,插入片段<25Kb時,載體序列折半收費
BAC
0.6元/bp
葉綠體、線粒體、病毒、噬菌體
0.8元/bp
其他大片段樣品
0.6元/bp,最低8000元

 
提供結果
完整的實驗報告(包含實驗細節(jié)、質控點、數據拼接記錄和完整序列)。

 

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