高通量測序服務(wù)——真菌基因組測序
詳細描述:
真菌屬于較低等的真核生物,種類繁多,在自然界中分布廣泛。據(jù)估計,全世界約有150萬種真菌,其中包含許多具有重要的藥用價值和食用價值的有益真菌,同時也存在著大量能引發(fā)動植物病害的致病菌。因此,合理利用有益真菌,控制和預(yù)防有害真菌對人類的生產(chǎn)和生活具有重要的意義。而真菌基因組的闡明,將為真菌特性的分析提供有用的依據(jù)。隨著第二代高通量測序技術(shù)的成熟,基因組測序成本已大大降低,使得快速而經(jīng)濟的進行真菌基因組測序成為可能,目前真菌基因組學(xué)研究已經(jīng)進入了一個快速增長時期。
美吉優(yōu)勢
1. 擁有標(biāo)準化操作實驗室和高通量測序技術(shù)平臺,可以根據(jù)合作伙伴要求靈活安排實驗,實驗周期短,質(zhì)量可靠。
2. 擁有Roche 454和Illumina Solexa兩種高通量測序平臺,合作伙伴可根據(jù)具體需求進行選擇,以獲取最佳的實驗結(jié)果。
3. 技術(shù)人員經(jīng)驗豐富,可以根據(jù)合作伙伴要求在第一時間提供實驗方案、解決實驗問題、分析實驗結(jié)果。
4. 擁有專業(yè)的生物信息團隊和大型計算機,可以為合作伙伴提供個性化的生物信息分析服務(wù)。
生物信息分析
1. De novo真菌基因組測序
1)基因組序列拼接
原始數(shù)據(jù)統(tǒng)計、基因組覆蓋度計算、組裝結(jié)果統(tǒng)計等。
2)基因注釋
編碼基因預(yù)測,基因功能注釋(NR、Swiss-prot、Interpro等)、Non-coding RNA注釋、重復(fù)序列注釋等。
3)基因功能分類
GO分類、KEGG通路分析等。
4)比較基因組及進化分析
與近源物種的基因組序列對比,進行SNP、SV等變異結(jié)構(gòu)檢測、pan-genome和core-genome組成分析、同源基因分析、進化分析等。
2. 真菌基因組重測序
1)原始數(shù)據(jù)統(tǒng)計
2)短序列mapping至參考基因組
3)分析mapping區(qū)域reads的覆蓋度、重復(fù)性、覆蓋堿基的質(zhì)量及reads方向
4)SNPs、InDel、CNVs檢測
5)結(jié)構(gòu)變異(SVs)和基因組重排事件分析
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上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司專注于新一代DNA高通量測序技術(shù)的應(yīng)用和推廣、生物信息分析、臨床診斷試劑盒研發(fā)和轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究,是上海張江高科技園區(qū)、張江藥谷重點支持企業(yè),華東師范大學(xué)戰(zhàn)略合作單位。目前,美吉生物在上海、北京、廣州三個一線城市建立了實驗基地,銷售網(wǎng)絡(luò)遍布全國各地。
美吉生物擁有世界一流的測序平臺,在ABI3730xl常規(guī)測序平臺的基礎(chǔ)上,先后引進了羅氏454高通量測序平臺和Illumina高通量測序平臺,專業(yè)提供動植物基因組測序、微生物基因組測序、宏基因組測序、轉(zhuǎn)錄組測序、小RNA測序、基因表達譜分析等技術(shù)服務(wù)。
美吉生物擁有一支實力雄厚的技術(shù)團隊,有從事分子生物學(xué)研究十多年、經(jīng)驗豐富的技術(shù)骨干,也有創(chuàng)新進取、拼勁十足的希望之星。技術(shù)團隊經(jīng)驗豐富,曾參與水稻、番茄、家蠶等多項大型基因組學(xué)項目,可以為您提供專業(yè)、合理、高性價比的實驗方案。
生物信息學(xué)是國際前沿的新興學(xué)科,近年來發(fā)展迅猛。美吉生物擁有一支具有國際一流水平的生物信息分析團隊,不僅可以提供標(biāo)準流程化的生物信息分析,還可以根據(jù)不同的課題需求,提供個性化的深度數(shù)據(jù)挖掘。
B2B(Bench to Bedside)的轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)模式,大大縮短了醫(yī)學(xué)科學(xué)從基礎(chǔ)研究到臨床應(yīng)用的時間,加速了人類進入基因組醫(yī)學(xué)時代的步伐;趯ξ磥磲t(yī)學(xué)發(fā)展趨勢的充分理解,美吉生物和國內(nèi)多家著名三甲醫(yī)院聯(lián)合建立了轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)中心,開展轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究,以迎接基因組醫(yī)學(xué)時代的到來。
美吉生物秉承“專業(yè)、卓越”的企業(yè)理念,“以客戶為本,讓客戶滿意”的服務(wù)宗旨,一如既往地致力于提供高品質(zhì)、高效率的技術(shù)服務(wù),努力將公司打造成為國內(nèi)一流企業(yè)。因為敬業(yè),所以專業(yè);因為專業(yè),所以選擇;選擇美吉,選擇滿意!