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在生物制藥行業(yè)日益競爭激烈的背景下,快速、高效地生產(chǎn)重組蛋白已成為決定企業(yè)成敗的關(guān)鍵。哺乳動(dòng)物細(xì)胞瞬時(shí)基因表達(dá)系統(tǒng)(TGE)以其周期短、操作簡便等優(yōu)勢,成為重組蛋白生產(chǎn)的核心技術(shù)之一。然而,提升TGE的表達(dá)效率和穩(wěn)定性仍是當(dāng)前研究的重點(diǎn)。
本文深入分析了TGE系統(tǒng)的最新改進(jìn)策略,包括細(xì)胞系優(yōu)化、表達(dá)載體設(shè)計(jì)、培養(yǎng)基改進(jìn)和共表達(dá)輔助基因的應(yīng)用,為生物制藥研發(fā)提供了切實(shí)可行的優(yōu)化方案,展示了該技術(shù)在推動(dòng)生物制藥產(chǎn)業(yè)化中的巨大潛力。
前言
重組治療蛋白(包括抗體)的生產(chǎn)是生物制藥領(lǐng)域的核心組成部分,其表達(dá)系統(tǒng)涵蓋了細(xì)菌、酵母、哺乳動(dòng)物細(xì)胞系和植物等多種形式。其中,常用的哺乳動(dòng)物細(xì)胞系統(tǒng)包括中國倉鼠卵巢細(xì)胞(CHO)、小鼠骨髓瘤細(xì)胞(NS0和Sp2/0)以及人胚胎腎293細(xì)胞(HEK293)。在2014至2018年期間,CHO細(xì)胞仍然是最常用的哺乳動(dòng)物細(xì)胞培養(yǎng)系統(tǒng)。數(shù)據(jù)顯示,在通過哺乳動(dòng)物細(xì)胞生產(chǎn)的107種產(chǎn)品中,有95種(即89%)是使用CHO細(xì)胞生產(chǎn)的,其次是HEK293細(xì)胞。CHO細(xì)胞不僅能夠生產(chǎn)具有復(fù)雜結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì),還具有大規(guī)模培養(yǎng)的能力,并且對病毒感染具有較強(qiáng)的抵御能力。HEK293細(xì)胞則以其在無血清懸浮培養(yǎng)中易于生長和快速繁殖的特點(diǎn)著稱,且在使用常見的轉(zhuǎn)染試劑時(shí)表現(xiàn)出高效的轉(zhuǎn)染能力,因此在藥物發(fā)現(xiàn)和毒性測試中被廣泛應(yīng)用。
哺乳動(dòng)物細(xì)胞表達(dá)系統(tǒng)主要分為兩種方式:瞬時(shí)轉(zhuǎn)染表達(dá)(TGE)和穩(wěn)定轉(zhuǎn)染表達(dá)(SGE)。TGE相比SGE具有更快的啟動(dòng)過程,不需要繁瑣的篩選步驟,目的基因(GOI)可以直接轉(zhuǎn)入宿主細(xì)胞(圖1),快速實(shí)現(xiàn)蛋白表達(dá)。然而,TGE系統(tǒng)的產(chǎn)量通常低于SGE,這也是限制大規(guī)模TGE應(yīng)用的主要瓶頸。為了提高TGE的產(chǎn)量和效率,主要改進(jìn)策略集中在優(yōu)化各個(gè)環(huán)節(jié),包括表達(dá)載體的設(shè)計(jì)、轉(zhuǎn)染方法的選擇、轉(zhuǎn)染條件的調(diào)整、培養(yǎng)工藝的優(yōu)化、培養(yǎng)基的改進(jìn)以及細(xì)胞系的改良。本文將對TGE系統(tǒng)及其在哺乳動(dòng)物細(xì)胞表達(dá)中的最新改進(jìn)策略進(jìn)行詳細(xì)綜述和分析。
宿主細(xì)胞系
通過瞬時(shí)基因表達(dá)(TGE)在這些哺乳動(dòng)物細(xì)胞中快速生產(chǎn)重組蛋白是生物制藥開發(fā)早期階段中的重要工具。TGE系統(tǒng)主要由表達(dá)載體、細(xì)胞系和培養(yǎng)基組成,每個(gè)組成部分在高效蛋白質(zhì)生產(chǎn)中都扮演著至關(guān)重要的角色。
◉CHO細(xì)胞:蛋白表達(dá)量的高低主要取決于基因的轉(zhuǎn)錄和翻譯水平,宿主細(xì)胞可以通過不同途徑調(diào)控基因的轉(zhuǎn)錄和翻譯過程,來影響蛋白的表達(dá)量。在TGE系統(tǒng)中,最常用的宿主細(xì)胞系是HEK293細(xì)胞和CHO細(xì)胞。CHO細(xì)胞來源于中國倉鼠的雌性卵巢組織,由于其在重組蛋白生產(chǎn)中的廣泛應(yīng)用,研究人員已分離出多個(gè)CHO細(xì)胞的亞型,并對其進(jìn)行了不同方向的開發(fā)。這些亞型包括CHO-S、CHO-K1、CHO-DXB11、CHO-DG44、CHO-M以及GS敲除的CHO細(xì)胞。每種亞型都具備不同的基因型和表型特性,適應(yīng)不同的生產(chǎn)需求。目前,重組蛋白生產(chǎn)中廣泛應(yīng)用的CHO細(xì)胞系主要有CHO-K1、CHO-DXB11和CHO-DG44三種。在選擇合適的CHO宿主細(xì)胞進(jìn)行蛋白質(zhì)生產(chǎn)時(shí),關(guān)鍵是根據(jù)特定需求選擇具有最佳特性的表達(dá)系統(tǒng)或細(xì)胞系。以下是常見CHO細(xì)胞表達(dá)系統(tǒng)和細(xì)胞系的特點(diǎn)總結(jié)(表1)。
表1 瞬時(shí)表達(dá)用CHO細(xì)胞表達(dá)系統(tǒng)和細(xì)胞系的特征細(xì)胞系
細(xì)胞系特征 | 優(yōu)勢 | |
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CHO-K1細(xì)胞 | 最早分離的CHO細(xì)胞,適應(yīng)性強(qiáng),生長快速 | 適合基因轉(zhuǎn)染實(shí)驗(yàn)和重組蛋白的表達(dá) |
CHO-S細(xì)胞 | 用于懸浮培養(yǎng),增殖速度快 | 對培養(yǎng)基成分有良好的適應(yīng)性,適用于工業(yè)化生產(chǎn)。 |
CHO-DG44細(xì)胞 | 缺乏二氫葉酸還原酶(DHFR) | 便于建立穩(wěn)定細(xì)胞株,適合長時(shí)間重組蛋白生產(chǎn)。 |
CHO-EBNA細(xì)胞 | 可維持重組基因的長期表達(dá) | 高效且適合持續(xù)生產(chǎn),表現(xiàn)出良好的蛋白表達(dá)能力。 |
CHO-S(EBNA)細(xì)胞 | 結(jié)合了CHO-S細(xì)胞和EBNA的優(yōu)點(diǎn) | 適合快速實(shí)驗(yàn)需求,表現(xiàn)出良好的蛋白表達(dá)和分泌能力。 |
◉HEK293細(xì)胞:HEK293細(xì)胞系及其亞型(293E、293T、293F)也是一種廣泛應(yīng)用于瞬時(shí)基因的表達(dá)系統(tǒng),具有基因操作簡便、高轉(zhuǎn)染效率、無血清懸浮培養(yǎng)下實(shí)現(xiàn)高密度生長等優(yōu)勢。然而,其在N-聚糖結(jié)構(gòu)差異、臨床應(yīng)用受限及易受病毒污染等方面存在局限性。通過優(yōu)化糖基化修飾、加強(qiáng)病毒污染控制和合理選擇亞型,可以提升其蛋白質(zhì)生產(chǎn)效率與質(zhì)量。
◉表達(dá)載體:表達(dá)載體是瞬時(shí)基因表達(dá)(TGE)系統(tǒng)的重要組成部分,負(fù)責(zé)攜帶目標(biāo)基因進(jìn)入宿主細(xì)胞,并調(diào)控其表達(dá),包括啟動(dòng)子、增強(qiáng)子、終止子和選擇標(biāo)記等調(diào)控元件。不同的調(diào)控元件組合會(huì)影響基因表達(dá)效率和重組蛋白的產(chǎn)量(表2)。
表2 TGE系統(tǒng)中的關(guān)鍵調(diào)控元件總結(jié)調(diào)控
元件 | 作用 | 常見示例 | 影響 |
---|---|---|---|
啟動(dòng)子 | 決定基因轉(zhuǎn)錄的起始效率,調(diào)控基因表達(dá)的強(qiáng)度 | CMV、EF1α、SV40、SCP | 超級(jí)核心啟動(dòng)子能夠增強(qiáng)基因轉(zhuǎn)錄活性,提高目的蛋白表達(dá)及其穩(wěn)定性 |
增強(qiáng)子 | 協(xié)助啟動(dòng)子增強(qiáng)轉(zhuǎn)錄效率,提升基因表達(dá)的量 | SV40 enhancerCMV enhancer | 增強(qiáng)基因表達(dá),增加轉(zhuǎn)錄效率 |
終止子 | 終止轉(zhuǎn)錄并確保mRNA穩(wěn)定性,影響mRNA的壽命與轉(zhuǎn)運(yùn) | BGH Poly(A)SV40 Poly(A) | 提高mRNA穩(wěn)定性,間接增強(qiáng)蛋白表達(dá) |
選擇標(biāo)記 | 篩選成功轉(zhuǎn)染的細(xì)胞,確保目標(biāo)蛋白的有效表達(dá) | Neo、Puro、GFP | 確保篩選陽性細(xì)胞群,提高表達(dá)的純度 |
復(fù)制元件 | 提供質(zhì)粒復(fù)制功能,增強(qiáng)外源基因的表達(dá)持續(xù)性 | oriP(與EBNA-1蛋白結(jié)合)、SV40 ori(與大T抗原結(jié)合) | 延長質(zhì)粒在細(xì)胞中的維持時(shí)間,提升蛋白產(chǎn)量 |
◉細(xì)胞培養(yǎng)基:細(xì)胞培養(yǎng)基為細(xì)胞的生長和蛋白表達(dá)提供必要的營養(yǎng),是確保高效表達(dá)重組蛋白的關(guān)鍵因素。安全、有效的培養(yǎng)基不僅能夠提高蛋白產(chǎn)量,還能簡化下游的純化過程。傳統(tǒng)的細(xì)胞培養(yǎng)常需在基礎(chǔ)培養(yǎng)基中加入10-20%的血清,以維持細(xì)胞生長。然而,血清在不同批次中的差異、其易受支原體污染,以及其復(fù)雜的蛋白質(zhì)成分,都會(huì)增加后續(xù)蛋白分離和純化的難度。
◉SFM:為克服這些局限,無血清培養(yǎng)基(SFM)成為理想替代方案。SFM由明確的血清替代成分和基礎(chǔ)培養(yǎng)基組成,減少了血清對細(xì)胞培養(yǎng)的影響。這不僅能夠使下游的分離和純化過程更為簡便,同時(shí)降低了生產(chǎn)成本,提高了工藝的一致性和安全性。因此,SFM在工業(yè)化蛋白生產(chǎn)中具有顯著優(yōu)勢,有助于簡化流程并提升重組蛋白的質(zhì)量。瞬時(shí)基因表達(dá)改
細(xì)胞系改造
細(xì)胞系的改造主要通過提高轉(zhuǎn)染效率、引入抗凋亡基因、過表達(dá)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)伴侶蛋白以優(yōu)化蛋白折疊和分泌、調(diào)整糖基化修飾、以及調(diào)節(jié)細(xì)胞代謝途徑來提升蛋白質(zhì)生產(chǎn)的效率、產(chǎn)量和質(zhì)量。這些改造方法廣泛應(yīng)用于CHO和HEK293等細(xì)胞系中,Macaraeg等在CHO-K1細(xì)胞中敲除了兩個(gè)誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡的基因Bax和Bak,構(gòu)建了雙敲除(DKO)細(xì)胞,DKO細(xì)胞所表達(dá)的抗體產(chǎn)量比對照組高出3至4倍。Major等構(gòu)建的Bcl-xL細(xì)胞系在14天的批次培養(yǎng)后,融合蛋白的產(chǎn)量增加了70%至270%,細(xì)胞活力維持在90%以上,且凋亡率降低。Zhong等的研究顯示,ExpiCHO-S™ TGE系統(tǒng)能夠產(chǎn)生高水平的重組抗體,與其他系統(tǒng)相比具有顯著的表達(dá)產(chǎn)量提升,同時(shí)具有所需的轉(zhuǎn)錄后修飾(PTMs)。Chen等的研究中,人類17β-羥基類固醇脫氫酶1在HEK293T細(xì)胞中通過TGE得到了高水平表達(dá),經(jīng)過72小時(shí)的轉(zhuǎn)染后達(dá)到了17mg/L的最高表達(dá)水平。Jäger等進(jìn)一步優(yōu)化了HEK293細(xì)胞中的單鏈可變區(qū)抗體(scFv Fc)的TGE系統(tǒng),達(dá)到了10-20mg/L的抗體表達(dá)產(chǎn)量。為了進(jìn)一步提升產(chǎn)量,研究者使用了帶有EBNA-1截短變體的HEK293-6E懸浮細(xì)胞。這種改進(jìn)極大提高了抗體的體積產(chǎn)量,使產(chǎn)量增加了10倍,達(dá)到140mg/L。
表達(dá)載體工程
瞬時(shí)基因表達(dá)載體工程是設(shè)計(jì)和構(gòu)建質(zhì)粒載體以促進(jìn)目標(biāo)基因在宿主細(xì)胞中短時(shí)間內(nèi)高效表達(dá)的過程。通過優(yōu)化表達(dá)載體的組成元件,可以提高瞬時(shí)基因表達(dá)(TGE)的效率和產(chǎn)量。
➣啟動(dòng)子:啟動(dòng)子是可以被RNA聚合酶特異性識(shí)別并結(jié)合的DNA調(diào)控序列,從而有效啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄。人類巨細(xì)胞病毒(hCMV)的即早期啟動(dòng)子是哺乳動(dòng)物細(xì)胞中驅(qū)動(dòng)重組蛋白表達(dá)的常用的啟動(dòng)子。Jostock等研究指出,在HEK293T細(xì)胞中,由CMV啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)的IRES介導(dǎo)的雙順反子載體能夠?qū)崿F(xiàn)平均IgG瞬時(shí)表達(dá)量超過10μg/mL。進(jìn)一步的研究表明,采用相同CMV啟動(dòng)子的雙啟動(dòng)子載體系統(tǒng)的抗體滴度達(dá)到最高,分別比雙順反子和雙載體系統(tǒng)提高了1.4倍和1.9倍。此外,Yang等構(gòu)建了雙順反子、單順反子和雙啟動(dòng)子載體,并在CHO細(xì)胞中進(jìn)行了瞬時(shí)表達(dá),發(fā)現(xiàn)雙啟動(dòng)子載體在CHO細(xì)胞中的表達(dá)量最高,達(dá)約18 ± 4μg/mL。這些研究結(jié)果表明,雙啟動(dòng)子策略在提高重組抗體產(chǎn)量上更具優(yōu)勢,主要機(jī)制可能在于重鏈(HC)和輕鏈(LC)基因通過不同啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄,實(shí)現(xiàn)了更高的轉(zhuǎn)錄獨(dú)立性和表達(dá)靈活性,從而增強(qiáng)了抗體的瞬時(shí)表達(dá)效率。
Poulain等研究指出,在累麥基因開關(guān)啟動(dòng)子(CR5)的驅(qū)動(dòng)下,重組蛋白的體積產(chǎn)量顯著提升,比CMV啟動(dòng)子或雜合EF-1α-HTLV組成啟動(dòng)子的表達(dá)量高出三到四倍,此結(jié)果表明CR5啟動(dòng)子在蛋白質(zhì)表達(dá)中具有顯著優(yōu)勢。Brown等的研究則表明,通過抑制YY1轉(zhuǎn)錄抑制因子的活性,分泌型堿性磷酸酶(SEAP)的產(chǎn)量可增加1.5倍,這一發(fā)現(xiàn)表明,通過調(diào)控CMV啟動(dòng)子來優(yōu)化CHO細(xì)胞的瞬時(shí)表達(dá)(TGE)可以增加重組蛋白的生產(chǎn)效率。另外,Gupta等通過轉(zhuǎn)染密碼子優(yōu)化的酵母細(xì)胞質(zhì)丙酮酸羧化酶(PYC2)和使用強(qiáng)效融合啟動(dòng)子,顯著提升了PYC2酶的表達(dá)水平,使單mAb的產(chǎn)量提高了5%,同時(shí)顯著提升了糖基化的產(chǎn)物質(zhì)量,甘露糖化水平提高了兩倍,半乳糖化水平提高了2.5倍。這些研究結(jié)果表明,通過啟動(dòng)子選擇、轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控和基因優(yōu)化,可以實(shí)現(xiàn)重組蛋白表達(dá)和質(zhì)量的顯著改善。
➣順式元件:順式元件是通過調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄效率和穩(wěn)定性,在載體工程中起到重要作用的遺傳元件。常見的順式元件包括基因座控制區(qū)(LCR)、核基質(zhì)附著區(qū)(MAR)和普遍染色質(zhì)開啟元件(UCOE)。其中,UCOE是CpG島中未甲基化的基因啟動(dòng)子,通過防止轉(zhuǎn)染過程中DNA甲基化引起的沉默效應(yīng),有助于維持高水平的轉(zhuǎn)基因表達(dá)。Nematpour等的研究表明,UCOE能夠提高細(xì)胞系的抗體產(chǎn)量,特別是與重鏈結(jié)合使用時(shí),其穩(wěn)定性更好,能夠進(jìn)一步提升單克隆抗體的產(chǎn)量。
MAR則是另一種重要的順式元件,它作為表觀遺傳調(diào)控因子,通過與核基質(zhì)特異性結(jié)合,參與基因表達(dá)的調(diào)控過程。相比沒有MAR的對照載體,含有MAR的質(zhì)粒在轉(zhuǎn)染CHO細(xì)胞時(shí),能夠顯著提高重組蛋白的表達(dá)水平。LCR則是調(diào)控轉(zhuǎn)基因表達(dá)的核心元件之一,研究表明,LCR通過慢病毒載體能有效增強(qiáng)抗體的滴度和基因轉(zhuǎn)移效率。此外,Mariati等研究了五種轉(zhuǎn)錄后調(diào)控元素(PTREs),包括熱休克蛋白70(Hsp70)、163bp長剪接變體(SP163)、與主要晚期啟動(dòng)子增強(qiáng)子(TM)連接的人腺病毒mRNA的三部分首碼序列、內(nèi)含子A以及野鼠肝炎病毒轉(zhuǎn)錄后調(diào)控元素(WPRE)。結(jié)果顯示,TM能夠提供最高的基因表達(dá)水平,使表達(dá)水平提高了3.6到7.6倍。
其他PTREs元素也能顯著提高蛋白表達(dá)水平,幅度為1.7到3.2倍。而多種PTREs的組合則進(jìn)一步使重組蛋白的表達(dá)增加至10.5倍,特別是WPRE與內(nèi)含子A、SP163或TM的組合具有疊加效應(yīng)。
➣信號(hào)肽的優(yōu)化:信號(hào)肽的優(yōu)化是提高重組蛋白分泌效率的重要策略。Kober等人通過對16種不同信號(hào)肽的效果進(jìn)行比較,發(fā)現(xiàn)來自人血清白蛋白和嗜中性粒細(xì)胞特異性蛋白(azurocidin)的信號(hào)肽效果最佳。進(jìn)一步的補(bǔ)料批次分析驗(yàn)證了這些結(jié)果,在穩(wěn)定轉(zhuǎn)染的細(xì)胞池中,使用這些信號(hào)肽可以實(shí)現(xiàn)高達(dá)90pg/cell/day的細(xì)胞特異性產(chǎn)量,且使用白蛋白信號(hào)肽的抗體產(chǎn)量達(dá)到4g/L。然而,最合適的信號(hào)肽選擇可能因蛋白質(zhì)種類而異。
Haryadi等人研究了兩個(gè)κ輕鏈信號(hào)肽(L1和L2)和八個(gè)重鏈信號(hào)肽(H1–H8)在五種不同抗體生產(chǎn)中的表現(xiàn)。結(jié)果表明,不同抗體的最佳信號(hào)肽組合并不一致。例如,Avastin、Herceptin、Rituxan、Remicade和Humira的最佳信號(hào)肽組合分別為H7/L1、H5/L1、H7/L2、H7/L2和H7/L1。這些研究表明,信號(hào)肽的優(yōu)化需要根據(jù)每種抗體的特性進(jìn)行具體分析。O’Neill等人則使用計(jì)算機(jī)模擬技術(shù)設(shè)計(jì)合成信號(hào)肽,并評估其對三種不同重組蛋白的表達(dá)效果。這三種蛋白包括一個(gè)單鏈變體融合蛋白、一個(gè)易于表達(dá)的單克隆抗體(ETE),以及一個(gè)難以表達(dá)的單克隆抗體(DTE)。研究顯示,最優(yōu)信號(hào)肽方案具有高度的蛋白質(zhì)特異性,能夠分別將ETE輕鏈、DTE輕鏈和單鏈變體融合蛋白的產(chǎn)量提高1.8倍、2.5倍和2.7倍。這表明,信號(hào)肽的選擇與目標(biāo)蛋白質(zhì)的特性密切相關(guān),優(yōu)化信號(hào)肽能夠顯著提高重組蛋白的分泌效率。
培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件優(yōu)化
培養(yǎng)基添加物
培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件的優(yōu)化是提高哺乳動(dòng)物細(xì)胞中重組蛋白表達(dá)的重要手段。蛋白胨作為一種富含肽、氨基酸和無機(jī)鹽的水溶性蛋白水解物,能夠顯著改善細(xì)胞培養(yǎng)效果。Davami等通過將蛋白胨添加到無血清培養(yǎng)基中,顯著提升了HEK293-EBNA細(xì)胞瞬時(shí)轉(zhuǎn)染表達(dá)(TGE)的產(chǎn)量,并使CHO細(xì)胞的體積生產(chǎn)力提高了37%。類似地,Burteau等的研究發(fā)現(xiàn),補(bǔ)充小麥蛋白胨使細(xì)胞生長增加了30%,同時(shí)干擾素-γ(IFN-γ)的生產(chǎn)提高了60%,這表明植物來源的蛋白胨不僅能夠提高哺乳動(dòng)物細(xì)胞的生長,還能增強(qiáng)產(chǎn)品產(chǎn)量。Ye等研究通過在批次培養(yǎng)中補(bǔ)充二甲基亞砜(DMSO)和乙酸鋰(LiAc)對CHO細(xì)胞瞬時(shí)轉(zhuǎn)染的影響,結(jié)果表明這些添加物顯著提高了IgG的生產(chǎn),最終產(chǎn)量達(dá)到80mg/L。類似的研究中,Lynch等發(fā)現(xiàn),在轉(zhuǎn)染后4小時(shí)向HEK293細(xì)胞培養(yǎng)基中添加10%的DMSO,能夠?qū)⒅亟M蛋白的表達(dá)水平提高約1.6倍,同時(shí)未觀察到顯著的細(xì)胞毒性。此外,伴侶蛋白在重組蛋白生產(chǎn)過程中扮演著重要角色,能夠輔助蛋白質(zhì)正確折疊并防止蛋白聚集。DMSO在蛋白折疊途徑中表現(xiàn)出伴侶蛋白樣的功能,減少了蛋白質(zhì)聚集現(xiàn)象,進(jìn)而提高了生產(chǎn)效率。
降溫策略
在工業(yè)生產(chǎn)中,降溫策略被廣泛用于提高哺乳動(dòng)物細(xì)胞中重組蛋白的產(chǎn)量。通常,哺乳動(dòng)物細(xì)胞在培養(yǎng)初期保持在37℃的標(biāo)準(zhǔn)溫度下,以促進(jìn)細(xì)胞快速生長和增殖。隨著培養(yǎng)進(jìn)入生長抑制階段,溫度通常會(huì)降低至31℃或33℃,以優(yōu)化蛋白質(zhì)生產(chǎn)。Lin等發(fā)現(xiàn),通過將培養(yǎng)溫度降至33℃,雖然降低了HEK293S細(xì)胞的生長速率,但綠色熒光蛋白(GFP)和α-氨基-3-羥基-5-甲基-4-異惡唑丙酸(AMPA)受體的表達(dá)顯著增加了約1.5倍。降溫通過使細(xì)胞在G1/G0期停滯并抑制細(xì)胞凋亡,從而提高了重組蛋白的產(chǎn)量,并增強(qiáng)了細(xì)胞活力。同時(shí),降溫還能提高與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)蛋白折疊和加工相關(guān)的基因(如ddit3、atfx、bp1s5、grp78、trib3、grp94和ero1α)的表達(dá),這些基因調(diào)控未折疊蛋白反應(yīng)和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)駐留蛋白的產(chǎn)生,從而改善蛋白質(zhì)加工和分泌。
Sou等研究表明,將培養(yǎng)溫度降至32℃進(jìn)行瞬時(shí)轉(zhuǎn)染表達(dá)(TGE)相比于在36.5℃條件下培養(yǎng),能使產(chǎn)量的qP提高76%。這一增幅伴隨著氨基酸和營養(yǎng)物質(zhì)的消耗增加,同時(shí)核苷糖種類的產(chǎn)量也有所增加,重組單克隆抗體的半乳糖化速率顯著提高。Zhang等提出,在哺乳動(dòng)物細(xì)胞的大規(guī)模生產(chǎn)過程中,可以在懸浮培養(yǎng)的第3天將溫度降至33℃,以提高治療蛋白的產(chǎn)量。
此外,Barron等的研究表明,降溫可調(diào)節(jié)miRNA的表達(dá),六種miRNA(mir-219、mir-518d、mir-126、mir-30e、mir-489和mir-345)在降溫下顯著上調(diào),而四種miRNA(mir-7、mir-320、mir-101和mir-199)則下調(diào)。這些miRNA的表達(dá)變化與重組蛋白生產(chǎn)的增強(qiáng)密切相關(guān)。Fischer等發(fā)現(xiàn),miR-30e的過表達(dá)能夠使CHO細(xì)胞中分泌型堿性磷酸酶(SEAP)的產(chǎn)量提高約兩倍。而在CEVEC的羊膜細(xì)胞生產(chǎn)系統(tǒng)中,miR-136、miR-3074和miR-219的過表達(dá)顯著提高了單克隆抗體的最終濃度。Sanchez等的研究進(jìn)一步表明,抑制miR-7幾乎使CHO細(xì)胞中SEAP的產(chǎn)量翻倍。這些結(jié)果表明,降溫策略不僅通過調(diào)控細(xì)胞周期和蛋白折疊途徑增強(qiáng)蛋白表達(dá),還通過miRNA的調(diào)節(jié)機(jī)制顯著提高了重組蛋白的生產(chǎn)效率。
轉(zhuǎn)染條件優(yōu)化
合適的聚合物
轉(zhuǎn)染的每個(gè)步驟對最終結(jié)果都有不同程度的影響,因此優(yōu)化轉(zhuǎn)染條件至關(guān)重要。通過選擇適合的轉(zhuǎn)染試劑、調(diào)整DNA和試劑的用量、控制細(xì)胞密度,可以提高轉(zhuǎn)染效率和重組蛋白的產(chǎn)量。優(yōu)化后的轉(zhuǎn)染方案應(yīng)具備操作簡便、成本低、流程短、效率高的特點(diǎn),以滿足高效生產(chǎn)的需求,并在保持產(chǎn)量的同時(shí)確保產(chǎn)品質(zhì)量。
Daramola等使用陽離子脂質(zhì)基試劑對CHO-S細(xì)胞進(jìn)行瞬時(shí)轉(zhuǎn)染,在1L搖瓶批量培養(yǎng)中獲得了60mg/L的重組IgG。Kadlecova等研究了一種新型轉(zhuǎn)染試劑-超支化聚賴氨酸(HBPL),發(fā)現(xiàn)其轉(zhuǎn)染效果與傳統(tǒng)的PEI或Fugene1相當(dāng),甚至在某些情況下更高。HBPL具有不需要復(fù)雜預(yù)孵育、適用于含血清培養(yǎng)基且可生物降解的優(yōu)勢,從而降低了細(xì)胞毒性并簡化了下游處理流程。Delafosse等則發(fā)現(xiàn),使用去;腜EI “Max”和PEIpro™相比于常規(guī)PEI,能夠顯著提高重組蛋白的表達(dá)水平。這些研究表明,選擇最合適的聚合物對優(yōu)化瞬時(shí)基因表達(dá)(TGE)系統(tǒng)非常重要。
添加比例
de Los Milagros Bassani Molinas等開發(fā)了一種完全無血清的瞬時(shí)轉(zhuǎn)染方法,采用不含鈣的DMEM和FreeStyle™ 293表達(dá)培養(yǎng)基的1:1混合物,通過優(yōu)化DNA和PEI的比例(1:3),在轉(zhuǎn)染后72小時(shí)內(nèi)達(dá)到最大轉(zhuǎn)染效率(70-96%),并獲得1.6 μg/mL的重組人促紅細(xì)胞生成素。Johari等設(shè)計(jì)了一種脂質(zhì)體介導(dǎo)的雙相SP35Fc特異性TGE過程,利用免疫抑制因子CYPB共表達(dá)來最大化產(chǎn)量,并通過最佳比例(5:1)消除SP35Fc的聚集,從而將產(chǎn)量提高了六倍,同時(shí)避免了二硫鍵聚集體的形成。此外,苯環(huán)醇(DNA聚合酶抑制劑)與丁酸鹽(組蛋白去乙;敢种苿┑穆(lián)合預(yù)處理,通過電穿孔顯著增加了熒光強(qiáng)度。在CHO細(xì)胞中熒光強(qiáng)度增加了4.8倍,在HEK293細(xì)胞中增加了2.8倍,而在HEK293-EBNA細(xì)胞中則增加了1.9倍。這些優(yōu)化方法表明,通過調(diào)整不同的轉(zhuǎn)染條件,可以大幅提高瞬時(shí)基因表達(dá)的效率和蛋白質(zhì)產(chǎn)量。
通過優(yōu)化DNA(N)與PEI(P)的比率,可以顯著提高轉(zhuǎn)染效率和重組蛋白的表達(dá)。研究發(fā)現(xiàn),當(dāng)DNA/PEI(w/w)比率為1:3時(shí),轉(zhuǎn)染效率最高,范圍在60%到66.93%之間。此外,Rajendra等研究表明,使用非特異性填充DNA來替代部分編碼DNA時(shí),盡管編碼DNA量減少67%,重組蛋白的生產(chǎn)仍與對照組相當(dāng)。填充DNA不會(huì)影響編碼DNA的細(xì)胞攝取或穩(wěn)定性,反而增加了轉(zhuǎn)染細(xì)胞的比例和轉(zhuǎn)基因mRNA的穩(wěn)定性。
瞬時(shí)轉(zhuǎn)染的優(yōu)化還需要考慮多種因素,包括培養(yǎng)基類型、懸浮細(xì)胞密度、質(zhì)粒DNA和PEI的用量。Haldankar等人通過優(yōu)化這些轉(zhuǎn)染參數(shù),獲得了高達(dá)9.4mg/L的重組蛋白表達(dá)水平。Liu等使用陽離子脂質(zhì)轉(zhuǎn)染試劑FreeStyle™ MAX對HEK293和CHO細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)染,通過優(yōu)化參數(shù),獲得了約70%的eGFP陽性細(xì)胞和50–80mg/L的IgG抗體分泌。轉(zhuǎn)染系統(tǒng)擴(kuò)大到1L時(shí),保持了相似的轉(zhuǎn)染效率和蛋白產(chǎn)量,并提高了人紅細(xì)胞生成素和凝血因子IX的表達(dá)。
此外,在HEK293T細(xì)胞系中,對質(zhì)粒DNA進(jìn)行72°C加熱處理30分鐘顯著提高了轉(zhuǎn)染效率。González-Domínguez等通過實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)(DoE)優(yōu)化了轉(zhuǎn)染參數(shù),發(fā)現(xiàn)在NaCl濃度為125mM和孵育時(shí)間為11分鐘的條件下,獲得了最高的轉(zhuǎn)染產(chǎn)量。這些研究表明,通過優(yōu)化轉(zhuǎn)染條件,可以顯著提升重組蛋白的表達(dá)效率和產(chǎn)量。
共表達(dá)調(diào)節(jié)蛋白
X-box結(jié)合蛋白
調(diào)節(jié)蛋白的共表達(dá)對細(xì)胞生長和重組蛋白的表達(dá)起到了顯著的促進(jìn)作用。Rajendra等人的研究表明,過表達(dá)X-box結(jié)合蛋白(XBP-1S)能夠使CHO細(xì)胞中幾種治療蛋白的產(chǎn)量增加15%至85%。此外,Cain等發(fā)現(xiàn),過表達(dá)XBP-1S和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)氧化還原酶(ERO1-La)的CHO-S細(xì)胞系相比對照組,其抗體產(chǎn)量增加了5.3至6.2倍。
miRNA
某些miRNA的共表達(dá)也可以提高重組蛋白的產(chǎn)量。Jadhav等人通過miRNA篩選發(fā)現(xiàn),miR-17能夠促進(jìn)CHO細(xì)胞的生長并提高蛋白生產(chǎn)力。Ohsfeldt等人的研究顯示,過表達(dá)Bcl-xL基因的CHO細(xì)胞在轉(zhuǎn)染表皮生長因子受體或成纖維生長因子受體3后,重組蛋白的表達(dá)量顯著增加,證明Bcl-xL的共表達(dá)可以提高蛋白產(chǎn)量。Zustiak等也發(fā)現(xiàn),Bcl-xL共轉(zhuǎn)染的CHO細(xì)胞凋亡率降低,特異生產(chǎn)力提高,重組蛋白產(chǎn)量增加了約100%。
其它調(diào)節(jié)因子
此外,Budge等人發(fā)現(xiàn),核苷酸二磷酸激酶A(NDPK-A)的共表達(dá)提高了CHO細(xì)胞的轉(zhuǎn)染效率,并且當(dāng)NDPK-A與EBNA-1結(jié)合時(shí),重組蛋白的瞬時(shí)表達(dá)顯著增加。Lee等人通過建立共表達(dá)EBNA-1和多瘤病毒大T抗原(PyLT)的CHO細(xì)胞,顯著提高了Fc-融合蛋白的表達(dá)量,qP比對照細(xì)胞高出22.9倍。Daramola等的研究也表明,EBNA-1與GS的共表達(dá)增強(qiáng)了CHO細(xì)胞中重組抗體的瞬時(shí)基因表達(dá)。
Roobol等人發(fā)現(xiàn),瞬時(shí)過表達(dá)真核起始因子3(eIF3i)復(fù)合物可提高CHO-K1細(xì)胞中整體蛋白的合成速率約10%。此外,Vink等人描述了一種基于快速生長懸浮細(xì)胞系FreeStyle™ 293-F的優(yōu)化系統(tǒng),通過與表達(dá)增強(qiáng)質(zhì)粒的共轉(zhuǎn)染,在不到一周內(nèi)獲得了高達(dá)400 mg/L的分泌抗體產(chǎn)量。這些研究表明,通過調(diào)節(jié)蛋白的共表達(dá),能夠顯著改善重組蛋白的生產(chǎn)效率。
小結(jié)
哺乳動(dòng)物細(xì)胞的瞬時(shí)基因表達(dá)(TGE)系統(tǒng)以其周期短、操作簡單的優(yōu)勢,成為重組蛋白生產(chǎn)的重要平臺(tái),尤其適用于初步研究和快速篩選。TGE系統(tǒng)的核心組成包括細(xì)胞系、表達(dá)載體和培養(yǎng)基。通過細(xì)胞系的改造、載體工程的優(yōu)化、轉(zhuǎn)染條件的篩選,以及培養(yǎng)基配方和工藝流程的改進(jìn),TGE系統(tǒng)生成的重組蛋白的表達(dá)水平和質(zhì)量得到了顯著提升。此外,共表達(dá)輔助基因,如XBP-1S、Bcl-xL等,進(jìn)一步增強(qiáng)了蛋白的合成和分泌效率。
然而,盡管TGE系統(tǒng)具備多項(xiàng)優(yōu)勢,重組蛋白的表達(dá)仍然受到批次間差異、轉(zhuǎn)染效率波動(dòng)等因素的影響,導(dǎo)致表達(dá)水平有待進(jìn)一步提升。隨著組學(xué)技術(shù)(如基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)等)的發(fā)展,以及數(shù)據(jù)分析技術(shù)和人工智能的融合,更加精準(zhǔn)、高效的TGE系統(tǒng)將為工業(yè)化重組蛋白的生產(chǎn)提供更可靠的解決方案。這些新興技術(shù)將推動(dòng)TGE系統(tǒng)在大規(guī)模生產(chǎn)中更廣泛的應(yīng)用,從而滿足生物制藥和研究領(lǐng)域?qū)Ω咝У鞍咨a(chǎn)的需求。
參考文獻(xiàn):
[1]Fu Y , Han Z , Cheng W ,et al.Improvement strategies for transient gene expression in mammalian cells[J].Applied Microbiology & Biotechnology, 2024, 108(1).DOI:10.1007/s00253-024-13315-y.
逐典生物定制化原核蛋白表達(dá)服務(wù)
上海逐典生物的科學(xué)家團(tuán)隊(duì)在定制原核蛋白領(lǐng)域潛心鉆研十余年,積累了極為豐富的分子設(shè)計(jì)、蛋白篩選以及工藝開發(fā)經(jīng)驗(yàn)。迄今,已成功交付了數(shù)百種細(xì)胞因子和定制酶。逐典生物定制化原核蛋白表達(dá)服務(wù)以先進(jìn)的技術(shù)平臺(tái)為支撐,其中人工智能驅(qū)動(dòng)的分子設(shè)計(jì)平臺(tái),可對蛋白的結(jié)構(gòu)與功能進(jìn)行優(yōu)化設(shè)計(jì),從而顯著提高蛋白的表達(dá)效率與活性;高通量蛋白制備平臺(tái)能夠快速支持蛋白的表達(dá)和篩選,充分滿足客戶需求;此外,還有獨(dú)特的包涵體變復(fù)性平臺(tái),有效解決了原核表達(dá)蛋白因錯(cuò)誤折疊而形成包涵體這一痛點(diǎn)問題。
服務(wù)優(yōu)勢
服務(wù)流程
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