综合图区亚洲网友自拍|亚洲黄色网络|成人无码网WWW在线观看,日本高清视频色视频kk266,激情综合五月天,欧美一区日韩一区中文字幕页

English | 中文版 | 手機版 企業(yè)登錄 | 個人登錄 | 郵件訂閱
當前位置 > 首頁 > 技術文章 > 細胞周期的數據質量評估和常見應用場景

細胞周期的數據質量評估和常見應用場景

瀏覽次數:921 發(fā)布日期:2024-7-16  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負

流筆記

周期數據質量評估

工欲善其事,必先利其器。漂亮的細胞周期數據離不開性能優(yōu)異的儀器,因此,首先需要通過《中華人民共和國醫(yī)藥行業(yè)標準YY/T 0588-2017》[1]來評估流式細胞儀的性能。本文中使用BD的DNA質量控制試劑盒,對層浪流式細胞儀檢測到的DNA數據進行質量評估。

DN質量控制試劑盒內容:

🔶 小雞紅細胞核(CEN):用于建立測試條件。

CEN試劑經過特殊處理,內含單個核、雙聯體核、三聯體核和更大的聚集體,用來檢測儀器的線性度和分辨率。經PI染色后,由于細胞核聚集程度的不同,在PI的直方圖中會出現至少4個峰,前4個峰分別代表單個核、雙聯體核、三聯體核和四聯體核。若染色正常,儀器線性度良好,則四個峰所在道數的平均比值接近1:2:3:4。

🔶 小牛胸腺細胞核(CTN):具有一個完整的細胞周期,且具有細胞周期的各個時期,大部分核處于G0/G1期,小部分處于S期和G2/M期。還可作為細胞周期統(tǒng)計分析的質控。

🔶 2μm的熒光微球作為一種穩(wěn)定的非生物標準品來確認儀器的CV(細胞離散度),要求儀器CV<2.3%。

🔶核酸染料碘化丙啶(PI)p圖.png

圖1:DNA QC試劑盒數據

數據評估結果:01

1. 出現明顯7峰,且檢測CEN結果為(圖1A)PK1:PK2:PK3:PK4:PK5:PK6:PK7 = 1.00:2.00:2.99:3.97:4.94:5.93:6.87 (≈1:2:3:4:5:6:7)。

【行業(yè)要求CEN結果滿足至少出現4個峰,且前四個峰的比值接近1:2:3:4】02

2. CTN檢測結果為周期擬合G2/G1=2.01(圖1B)。

【行業(yè)要求G2/M與G0/G1的平均熒光強度比值在1.95-2.05之間】03

3. 2μm微球結果CV=1.75%(圖1C)。

【行業(yè)要求CV<2.3%】

綜上可得,層浪流式細胞儀在DNA檢測中表現良好,QC數據均遠超行業(yè)標準,滿足臨床/科研實驗需求,是流式分析細胞周期的卓越選擇。
 

細胞周期應用場景1、細胞系

細胞系是周期實驗研究常用的樣本,如圖2分別依次為A圖:MCF-7乳腺癌細胞系、B圖:MDA-MB-231乳腺癌細胞系、C圖:HL-7702[L-02;LO2]肝細胞系。不同細胞系周期檢測及擬合結果如下圖所示:圖片2.png

圖2:常見細胞系自動周期擬合


數據分析與解讀

1. 三種細胞系檢測到的CVG1值分別為:

MCF7-1.63%、231-2.09%、LO2-2.93%。

【正常二倍體的CVG1應<8%】

注:G0/G1峰的CV(CVG1)顯著影響S期計算的準確性,然而在實際應用中,由于腫瘤樣本會存在多個亞群,其CVG1值可能會偏高,影響結果。建議將CVG1<8%的腫瘤樣本用于有用的S期測定。

2. 檢測到的RCS(限制性立方樣條回歸,用來反映樣本的擬合程度)分別為:3.55、2.783.70。

【RCS<3.0,表示擬合良好;RCS在3.0-5.0,被認為是基本擬合;RCS>5.0,表明擬合匹配度差】

2、生殖細胞

在生殖相關研究中,生殖細胞不同時期百分比的變化一直是研究的重點。以C57BL/6小鼠精囊為例,可以檢測到不同時期的細胞數量百分比:亞倍體(sub1N)細長精子細胞;單倍體(1N)圓形精子細胞;二倍體(2N)精原細胞;四倍體(4N)精原細胞G2M期。使用層浪流式細胞儀PI檢測精細胞周期結果如圖3所示:圖片3.png

圖3:C57BL/6小鼠精囊周期檢測

數據分析與解讀

亞倍體(sub1N)和單倍體(1N)百分比為64.66%、二倍體(2N)百分比為7.52%、四倍體(4N)的百分比為20.84%,與文獻報道中正常C57BL/6生殖細胞占比一致。[2]

3、植物細胞

植物細胞的多倍化對于研究個體生長發(fā)育具有重要的生物學意義。流式細胞儀檢測植物倍體具有簡單、快速、準確、直觀等優(yōu)點,在植物學中有著越來越廣泛的應用價值。模式生物擬南芥是植物倍體研究的經典角色,用層浪流式細胞儀對其葉片倍體進行檢測和分析,得到圖4結果:WPS圖片(1).png

圖4:擬南芥葉片周期檢測

數據分析與解讀
1.PK1:PK2=1:1.9,接近1:2。
注:植物周期檢測一般不用周期擬合軟件擬合,根據標準品確定樣本有單倍體、二倍體、四倍體,或者多倍體。植物可以檢測的樣本有:根、莖、葉、種子、花等。

 總結一鍵擬合功能示意

層浪流式細胞儀對DNA QC試劑盒(CEN/CTN/微球)的各項檢測結果均表現優(yōu)異,表明儀器的性能不僅滿足各類樣本細胞周期檢測的需求,其檢測結果更是遠優(yōu)于行業(yè)檢測標準的要求,特別是CEN檢測,可以檢測出多個峰值,且符合倍比關系。

除此之外,層浪流式細胞儀分析軟件ModelFlower內置細胞周期分析功能,可以對周期數據進行一鍵擬合,并有批量分析批量數據導出的功能。


注意事項
· 除去碎片之外,建議可供分析的目的細胞在1萬以上,雖然細胞數據過大會影響到分析的速度,但不會對細胞各個時期的百分比檢測產生影響,擬合效果反而更好,因此在條件允許的情況下,收集量多多益善。擬合不準確可以自行調整嗎?
· 自動擬合之后如不滿意結果,也可以通過手動調整的方式,改變G1和G2門的位置,還可以批量應用到其他樣本中以保持一致性。
· 首先,不同細胞系的擬合效果存在差異。其次,影響周期擬合效果的因素還有:試劑盒差異、細胞固定方式的影響、收集細胞量的差異、人為操作影響等。因此,為了盡量減少差異,操作標準要規(guī)范,最大程度上避免操作誤差。|流筆

參考文獻

[1]中華人民共和國醫(yī)藥行業(yè)標準YY/T 0588-2017,流式細胞儀.國家食品藥品監(jiān)督管理局.2017.

[2]R.B. Struijk,1 C.M. De Winter-Korver,1 S, Simultaneous Purifification of Round and Elongated Spermatids from Testis Tissue Using a FACS-Based DNA Ploidy Assay,International Society for Advancement of Cytometry.

——END——

 

聯系我們
公眾號二維碼.jpg

客服熱線|400-1011-131

郵箱|sale@challenbio.com

來源:北京層浪生物科技有限公司
聯系電話:400-1011-131 13011121581
E-mail:sale@challenbio.com

用戶名: 密碼: 匿名 快速注冊 忘記密碼
評論只代表網友觀點,不代表本站觀點。 請輸入驗證碼: 8795
Copyright(C) 1998-2024 生物器材網 電話:021-64166852;13621656896 E-mail:info@bio-equip.com