傳統(tǒng)的藥物主要作用于相應的分子靶點 (如激酶、受體、離子通道和轉運體等蛋白質靶標)、生物學途徑或細胞過程,從而達到治療疾病的藥理作用。小分子化合物和抗體是當前醫(yī)療用藥的主要形式和藥物開發(fā)的方式。但是只有 10-14% 的蛋白質可以成為小分子化合物或抗體的作用靶點。這限制了小分子化合物和抗體在藥物開發(fā)中的可能性。
圖 1. 小核酸藥物的發(fā)展歷程
圖 2. 小分子化合物、抗體、蛋白質替代治療和 RNA 治療的特征
圖 3. 不同類型核酸的結構特點和作用機制
ASO、siRNA 和 miRNA 通過堿基互補配對原則靶向 mRNA 或 pre-mRNA,通過基因沉默抑制靶蛋白的表達從而實現(xiàn)治療疾病的目的。mRNA 分子進入細胞然后翻譯成目標蛋白質,可以用于蛋白質替代治療或疫苗接種。
核酸適配體通過其獨特的三級結構而不是其序列與靶蛋白結合。
CRISPR/Cas9 系統(tǒng)由 Cas9 蛋白和引導 RNA 兩種分子組成 (“魔剪” CRISPR/Cas9,你 get 到了嗎?)。Cas9 蛋白被引導 RNA 分子所激活,發(fā)揮識別和切割基因組 DNA 的功能。核酶是具有催化活性的 RNA,可降解特異的 mRNA 序列。
ASOs 可以調節(jié) RNA 拼接,抑制 mRNA 翻譯。miRNA 和 siRNA 抑制翻譯導致 mRNA 降解。RNA適配體抑制蛋白質活性。IVT mRNA被翻譯成宿主蛋白,在細胞內充當抗原或替代蛋白。
圖 5. 處于研發(fā)階段的核酸藥物
除了將核酸作為藥物用于治療疾病,科研人員也在嘗試開發(fā)靶向 RNA 的小分子化合物。RNA 可以被折疊成二級 (如螺旋、莖、環(huán)和凸起)、三級 (如結、假結和基序) 和四級 (如復合體) 結構,因此,小分子化合物有可能直接與 RNA 獨特的高級結構而不是序列相互作用。以 rRNA 為靶點的新型合成抗生素 (如酮內酯 Telithromycin),靶向核糖體的 Ataluren (用于杜氏肌營養(yǎng)不良治療),以及靶向 SMN2 pre-mRNA 的 Risdiplam (用于治療脊髓性肌肉萎縮癥) 等藥物都已獲批用于治療。
盡管核酸藥物具有很好的治療,但也面臨一些挑戰(zhàn)。由于核酸通常分子量較大 (單鏈ASOs ~4 - 10kda,雙鏈siRNA ~ 14kda),且攜帶負電荷,所以很難有效地進入細胞。此外,裸的核酸在血液中容易被核酸酶降解,還能激活一些免疫識別受體如TLR3/7/8。這些因素限制了核酸藥物的的治療潛力。
為了克服核酸遞送的障礙,科學家們已經開發(fā)了基于病毒載體和非病毒載體的傳遞系統(tǒng)(脂質體),以保護寡核苷酸不被降解,最大限度地傳遞到靶細胞。脂質納米顆粒通常由陽離子脂質、膽固醇、PEG化脂質和磷脂組成,有助于掩蓋核酸攜帶的電荷,保護其不被核酸酶降解;瘜W修飾同樣可以幫助提高核酸遞送的遞送效率。2'化學修飾(2'-F、2'-OMe和2'-MOE等)的摻入大大提高了核酸的穩(wěn)定性和整體半衰期。
不過值得注意的是,與蛋白質不同,RNA 與 DNA 密切相關。許多最初設計和識別的 RNA 的化合物后來被知道會作用于其他靶點 (例如,直接與 DNA 結合)。因此,在開發(fā) RNA 靶向的小分子化合物時,結構優(yōu)化是必要的,以提高對 RNA 靶點的選擇性。
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參考文獻
1. Damase TR, Sukhovershin R, Boada C, Taraballi F, Pettigrew RI, Cooke JP. The Limitless Future of RNA Therapeutics. Front Bioeng Biotechnol. 2021;9:628137.