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                                當(dāng)前位置 > 首頁(yè) > 技術(shù)文章 > 小鼠表型組數(shù)據(jù)庫(kù)簡(jiǎn)介

                                小鼠表型組數(shù)據(jù)庫(kù)簡(jiǎn)介

                                瀏覽次數(shù):1444 發(fā)布日期:2022-2-21  來(lái)源:杰克森實(shí)驗(yàn)室
                                大家對(duì)于C57BL/6小鼠(俗稱B6)可能并不陌生。

                                但是,作為全球最常用的實(shí)驗(yàn)室小鼠近交品系,C57BL/6小鼠其實(shí)還有許多不為人知的秘密!

                                您知道這一品系的雄性小鼠在接受5周的游泳訓(xùn)練后平均可以游591分鐘嗎?
                                 

                                (圖源:電影《精靈鼠小弟》)

                                您知道C57BL/6雄性和雌性小鼠會(huì)比其他品系自行攝入更多的乙醇(即酒精)嗎?
                                 


                                如果您未曾了解過(guò),快來(lái)查看小鼠表型組數(shù)據(jù)庫(kù)吧 (Mouse Phenome Database, MPD)!這里的豐富信息可能對(duì)您的研究大有幫助。
                                 

                                小鼠表型組數(shù)據(jù)庫(kù)(Mouse Phenome Database,MPD)是由美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院資助并由杰克森實(shí)驗(yàn)室維護(hù)的實(shí)驗(yàn)小鼠品系特征的網(wǎng)站,是致力于促進(jìn)人類健康和疾病的轉(zhuǎn)化研究的免費(fèi)生物信息學(xué)資源。

                                在MPD上,你可以找到多個(gè)品系實(shí)驗(yàn)小鼠的基因型數(shù)據(jù)、表型數(shù)據(jù)、詳盡的數(shù)據(jù)采集方法以及在線數(shù)據(jù)分析工具。

                                 

                                https://phenome.jax.org 
                                  

                                帶您認(rèn)識(shí)MPD

                                MPD涵蓋了超過(guò)447個(gè)JAX不同小鼠品系的數(shù)據(jù),其中包括46種最常用的近交系小鼠。

                                我們?yōu)檫@些品系中的每一種都準(zhǔn)備了全面的生理數(shù)據(jù)總結(jié),匯總了研究人員最常關(guān)注的數(shù)據(jù)。這些數(shù)據(jù)也為幫助科學(xué)家選擇最合適的小鼠模型提供了參考。

                                這些生理數(shù)據(jù)總結(jié)可從各JAX小鼠的品系詳情頁(yè)面“疾病和表型”標(biāo)簽下獲取。
                                 
                                 

                                常用數(shù)據(jù)

                                體重
                                許多研究人員將體重作為小鼠健康狀況和總體狀況的基本指標(biāo),有時(shí)甚至將其作為選擇最適合其研究目的的小鼠品系的標(biāo)準(zhǔn)。
                                 
                                血液學(xué)概況
                                了解血液的細(xì)胞組成可以幫助研究人員評(píng)估動(dòng)物的健康狀況。這些概況包括:
                                ▲ 白細(xì)胞 (White Blood Cell, WBC) 計(jì)數(shù)
                                ▲ 紅細(xì)胞 (Red Blood Cell, RBC) 計(jì)數(shù)
                                ▲ 血紅蛋白濃度
                                ▲ 血細(xì)胞比容
                                ▲ 平均紅細(xì)胞體積 (Mean Cell Volume, MCV)
                                ▲ 平均細(xì)胞血紅蛋白濃度 (Mean Cell Hemoglobin Concentration, MCHC)
                                ▲ 血小板計(jì)數(shù)
                                ▲ 平均血小板體積 (Mean Platelet Volume, MPV)
                                ▲ 網(wǎng)織紅細(xì)胞計(jì)數(shù)
                                ▲ 網(wǎng)織紅細(xì)胞百分比
                                ▲ 網(wǎng)織紅細(xì)胞血紅蛋白含量
                                ▲ 中性粒細(xì)胞、淋巴細(xì)胞、單核細(xì)胞、嗜酸性粒細(xì)胞和嗜堿性粒細(xì)胞計(jì)數(shù)
                                ▲ 中性粒細(xì)胞、淋巴細(xì)胞、單核細(xì)胞、嗜酸性粒細(xì)胞和嗜堿性粒細(xì)胞百分比
                                 
                                血清生化指標(biāo)
                                許多科學(xué)家使用血清生化指標(biāo)作為主要的健康指標(biāo),并研究常見(jiàn)的疾病狀態(tài)。血清生化指標(biāo)數(shù)據(jù)包括:
                                ▲ 白蛋白和總蛋白水平
                                ▲ 血液尿素氮 (Blood Urea Nitrogen, BUN)
                                ▲ 電解質(zhì)(鈣、磷)
                                ▲ 脂質(zhì)水平(包括膽固醇、高密度脂蛋白膽固醇 (High Density Lipoprotein Cholesterol, HDLC)、甘油三酯和游離脂肪酸)
                                ▲ 葡萄糖(飽腹)
                                ▲ 丙氨酸轉(zhuǎn)氨酶 (Alanine Transferase, ALT),
                                ▲ 肌酸激酶 (Creatine Kinase, CK)
                                ▲ 甲狀腺素 (T4)
                                 
                                器官重量
                                ▲ 腦
                                ▲ 心臟
                                ▲ 肝臟
                                ▲ 腎臟
                                ▲ 脾臟
                                ▲ 其他
                                 
                                身體構(gòu)成(DEXA分析)
                                ▲ 骨骼礦物質(zhì)密度
                                ▲ 骨無(wú)機(jī)鹽含量
                                ▲ 瘦肉組織
                                ▲ 脂肪組織

                                免疫學(xué)特征(通過(guò)流式細(xì)胞術(shù)進(jìn)行脾臟分析)
                                ▲ 淋巴樣細(xì)胞百分比(包括B 胞、T細(xì)胞、NK細(xì)胞和NKT細(xì)胞)
                                ▲ 骨髓細(xì)胞百分比(粒細(xì)胞和單核細(xì)胞)
                                 


                                您可以利用這些基線數(shù)據(jù)選擇合適的近交系、優(yōu)化實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、減少不必要的預(yù)實(shí)驗(yàn),從而讓研究更加高效。
                                 
                                 

                                將不同品系進(jìn)行比較
                                 

                                不僅如此,MPD還提供一些工具來(lái)幫助您比較不同品系的數(shù)據(jù)。例如,如果您要測(cè)量特定因素誘導(dǎo)后出現(xiàn)的發(fā)熱情況,您可能需要使用基線體溫較低的品系。而在下圖的比較數(shù)據(jù)中,您可以快速發(fā)現(xiàn)C3H/HeJ或BALB/cJ可能是不錯(cuò)的選擇。



                                 
                                上傳您的數(shù)據(jù)
                                 

                                MPD另一個(gè)有趣的功能是,您可以上傳自己的數(shù)據(jù)并將其與已發(fā)表的數(shù)據(jù)并行比較,還可以將結(jié)果導(dǎo)出到工作表中。例如,如果您正在測(cè)量特定品系對(duì)高脂飲食或特定感染的反應(yīng),您可以下載各個(gè)相關(guān)數(shù)據(jù)并直接將其與您的數(shù)據(jù)進(jìn)行初步比較。
                                 


                                無(wú)論您想知道您的小鼠愛(ài)吃甜食還是酗酒,在MPD中都可以找到基線數(shù)據(jù)。
                                 
                                如果您還在苦苦糾結(jié)如何選擇品系、預(yù)實(shí)驗(yàn)?zāi)懿荒苁∪�,如何�?jiǎn)化實(shí)驗(yàn)降低預(yù)算這些問(wèn)題,快來(lái)MPD研究一下已有的數(shù)據(jù)吧!
                                 

                                來(lái)源:杰克森醫(yī)療科技(上海)有限公司
                                聯(lián)系電話:400-693-5700
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