最近天氣炎熱,在實(shí)驗(yàn)室的童孩估計(jì)有點(diǎn)冒火,本來在這夏困秋乏的季節(jié),每天都昏昏欲睡,還沒個(gè)假期(這也沒辦法,疫情嘛),還要一天天圍著實(shí)驗(yàn)轉(zhuǎn),做的出來還好,做不出來頭大心塞啊。尤其是新進(jìn)實(shí)驗(yàn)室的小白,對(duì)于實(shí)驗(yàn)的方方面面更是一頭霧水,面對(duì)導(dǎo)師的“期待與厚望”,懷著一腔熱血,躊躇滿志,踏上了科研的不歸路。話雖如此,該不懂的還是不懂:
比如說,老師給了你整個(gè)宇宙那么大的范圍,讓你選擇自己的研究課題,該怎么選課題呢?又比如說導(dǎo)師給了你一個(gè)基因,讓你去研究它,要怎么去研究呢?又比如說,導(dǎo)師給了你一個(gè)基因,還告訴了你怎么去研究,首先第一步是去把這個(gè)基團(tuán)給克隆一下吧。
聽到這里,你第一反應(yīng)可能是:啥?把這個(gè)基因克隆一下?什么意思?小朋友你是不是有很多問號(hào)?不過沒關(guān)系,不懂就問后還是不懂就查資料看文章看文獻(xiàn)嘛,總有解決問題的辦法。
小編不才,今天就給實(shí)驗(yàn)小白們捋捋ORF克隆和cDNA 克隆方面的知識(shí)吧。
一 、相關(guān)概念
關(guān)于基因克隆,剛剛踏入實(shí)驗(yàn)室的童孩們可能會(huì)比較陌生,不知道何為基因克隆,我們之前只是學(xué)過動(dòng)物克隆呀。比如說克隆羊多莉,大部分理科生應(yīng)該是有點(diǎn)印象的吧。由克隆羊多莉引出了克隆的概念:
克隆 (Clone):是指生物體通過體細(xì)胞進(jìn)行的無性繁殖,以及由無性繁殖形成的基因型完全相同的后代個(gè)體組成的種群。通常是利用生物技術(shù)由無性生殖產(chǎn)生與原個(gè)體有完全相同基因的個(gè)體或種群。多莉就是一個(gè)“copy”出來的動(dòng)物,與供核的羊媽媽長得一模一樣,基因型也是一模一樣的。因此我們又引出來了概念:基因克隆。
基因克隆:也叫分子克隆,是在體外對(duì)DNA分子按照既定的目的和方案進(jìn)行人工重組,將重組分子導(dǎo)入到合適的受體細(xì)胞中,使其在細(xì)胞中擴(kuò)增和繁殖,以獲得DNA分子大量復(fù)制,并使受體細(xì)胞獲得新的遺傳特征的過程。
舉個(gè)例子來說,A基因是調(diào)控小鼠褪黑素的分泌的,我想要完全抑制小鼠褪黑素的分泌,觀察褪黑素分泌抑制后小鼠的身體狀況。我們就需要在體外重組這個(gè)A基因(使A基因能夠抑制褪黑素分泌),并進(jìn)行大量的復(fù)制,然后將復(fù)制好的重組的A基因連接到相應(yīng)的表達(dá)載體上,然后再將這個(gè)載體轉(zhuǎn)入受體細(xì)胞中或者小鼠內(nèi),若實(shí)驗(yàn)成功的話,小鼠的褪黑素會(huì)被完全抑制分泌,褪黑素被完全抑制了的小鼠,身體狀況可能會(huì)出現(xiàn)相應(yīng)的問題。
而拿著一個(gè)基因要怎么去分析,去克隆自己想要的片段,就需要根據(jù)自己的實(shí)驗(yàn)需求來進(jìn)行了。小編今天就給大家講講ORF克隆和cDNA 克隆。
cDNA 克。菏侨L轉(zhuǎn)錄本的cDNA克隆,既包含了全長蛋白質(zhì)的編碼序列,也包含 5' 和 3' UTR非編碼序列,不能直接用于轉(zhuǎn)染細(xì)胞表達(dá),需要把5’ 及3’ UTR截去然后將表達(dá)框連接到構(gòu)建好的表達(dá)載體才可以進(jìn)行轉(zhuǎn)染細(xì)胞并表達(dá)。
ORF克隆:一個(gè)全長ORF(開放閱讀框)克隆,是指一個(gè)插入有編碼全長蛋白質(zhì)的DNA 片斷的質(zhì)粒。該插入DNA 片斷只含有編碼一個(gè)全長蛋白質(zhì)的序列(從起始密碼到終止密碼),而不包含有5′或3′端的非翻譯區(qū)(UTRs)或內(nèi)含子。
怎么?概念不好理解?沒事,看下面的圖:ORF就是基因的開放閱讀框,沒有5' 和3' UTR序列。是不是感覺很簡(jiǎn)單呢?
cDNA 克隆最主要的用途就是大量復(fù)制,并保存單一cDNA信息,構(gòu)建cDNA文庫,亞克隆等。也由于其5’UTR非編碼區(qū)容易形成復(fù)雜的二級(jí)結(jié)構(gòu),在蛋白質(zhì)翻譯時(shí)容易出現(xiàn)問題。因此,cDNA克隆載體必須去掉5' 和3' UTR序列后,再連接到對(duì)應(yīng)的表達(dá)載體中才能夠在受體細(xì)胞中進(jìn)行表達(dá)。
而ORF克隆就沒有那么復(fù)雜了,它是cDNA開放閱讀框區(qū)域的序列,無5' 和3' UTR序列,可直接在宿主細(xì)胞中進(jìn)行表達(dá),更為省時(shí)省力。所以大家在選擇哪一種克隆的時(shí)候,要想好自己要做什么實(shí)驗(yàn),以及所要考慮的因素比如價(jià)格,時(shí)間,操作等。
二、 相關(guān)產(chǎn)品
看到這里,相信大家對(duì)cDNA克隆和ORF克隆有了一定的了解,那接下來就來聊聊相關(guān)的產(chǎn)品吧!
1.全長cDNA克隆產(chǎn)品
cDNA克。ㄩL度是指編碼區(qū)) |
FL / MFL開頭的cDNA克隆現(xiàn)在基本不銷售,主賣表達(dá)克隆 |
0-1000bp cDNA克隆 |
小鼠 |
質(zhì)粒10μg,及產(chǎn)品說明。不提供菌種和實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。 |
1000-2000bp cDNA克隆 |
小鼠 |
2000bp-4000bp cDNA克隆 |
小鼠 |
4000bp以上 cDNA克隆 |
小鼠 |
0-1000bp cDNA克隆 |
人 |
1000-2000bp cDNA克隆 |
人 |
2000bp-4000bp cDNA克隆 |
人 |
4000bp以上 cDNA克隆 |
人 |
部分特殊基因不在促銷范圍之內(nèi) |
人、小鼠 |
先要購買的童孩可以根據(jù)自己的物種,轉(zhuǎn)錄本、載體等在Genecopoeia官網(wǎng)上搜索喲~~如果是要定制產(chǎn)品,也可以聯(lián)系武漢艾美捷公司進(jìn)行咨詢哦。
2.ORF克隆相關(guān)產(chǎn)品
【1】即用型ORF克隆套裝
貨號(hào) |
基因數(shù) |
克隆數(shù) |
載體 |
產(chǎn)品描述 |
OC-HG-M02 |
12841 |
16,096 |
Receiver-M02 Non-viral |
Human whole genome mammalian expression clone sets (no tag) |
OC-HG-M13 |
12,579 |
13,766 |
pReceiver-M13 Non-viral |
Human whole genome mammalian expression clone sets (with C-terminal Flag tag) |
OC-HG-Lv105 |
12,651 |
15,799 |
pReceiver-Lv105 Lentiviral |
Human whole genome lentiviral expression clone sets (with no tag) |
OC-HG-GC |
14,087 |
18,660 |
pDONR™ Vector Gateway® |
Human whole genome Gateway® PLUS™ shuttle clone sets (no promoter) |
當(dāng)然,這只是一小部分產(chǎn)品,即用型的ORF克隆載體也是廠家極力推薦的省時(shí)省力的產(chǎn)品哦,這類產(chǎn)品一共有7種克隆載體供您選擇若是想要查詢更多的產(chǎn)品,可以根據(jù)自己的物種,轉(zhuǎn)錄本、載體等在Genecopoeia官網(wǎng)上搜索喲~~如果是要定制產(chǎn)品,也可以聯(lián)系武漢艾美捷公司進(jìn)行咨詢哦。
全方位的表達(dá)載體選擇
表達(dá)載體 |
種類 |
ORFEXPRESS™ Gateway® PLUS |
1種 |
大腸桿菌表達(dá)克隆載體 |
15種 |
哺乳細(xì)胞表達(dá)克隆載體 |
48種 |
慢病毒表達(dá)克隆載體 |
82種 |
酵母表達(dá)克隆載體 |
3種 |
麥胚無細(xì)胞表達(dá)克隆載體 |
8種 |
昆蟲細(xì)胞表達(dá)克隆載體 |
1種 |
【2】ORFeome
GeneCopoeia提供20,000人的ORFeome collaboration克隆,這些構(gòu)建到Gateway® Entry載體的克隆缺少多克隆位點(diǎn)?蛻艨梢赃x擇載體是否需要終止密碼子。公司還提供小家鼠的ORFeome克隆。
【3】人類 及小鼠 Safe Harbor ORF 敲入克隆
貨號(hào) |
產(chǎn)品 |
產(chǎn)品描述 |
SH300 |
人類 AAVS1 safe harbor Cas9 敲入克。DC-C9NU-03) |
ORF區(qū)為 Cas9 核酸酶基因,由 CBh 啟動(dòng)子啟動(dòng)表達(dá)。能將Cas9 核酸酶基因整合到人類 AAVS1 safe harbor 位點(diǎn)。 (Puromycin) |
SH301 |
人類 AAVS1 safe harbor Cas9 敲入克。DC-C9NU-04) |
ORF區(qū)為 Cas9 核酸酶基因,由 CBh 啟動(dòng)子啟動(dòng)表達(dá)。能將Cas9 核酸酶基因整合到人類 AAVS1 safe harbor 位點(diǎn)。 (Hygromycin) |
SH302 |
人類 AAVS1 safe harbor Cas9 敲入克。DC-C9NU-05) |
ORF區(qū)為 Cas9 核酸酶基因,由 CBh 啟動(dòng)子啟動(dòng)表達(dá)。能將Cas9 核酸酶基因整合到人類 AAVS1 safe harbor 位點(diǎn)。 (Neomycin) |
SH350 |
小鼠 ROSA26 safe harbor Cas9 敲入克。DC-C9NU-06) |
ORF區(qū)為 Cas9 核酸酶基因,由 CBh 啟動(dòng)子啟動(dòng)表達(dá)。能將Cas9 核酸酶基因整合到人類 小鼠 ROSA26 位點(diǎn)。(Puromycin) |
SH351 |
小鼠 ROSA26 safe harbor Cas9 敲入克。DC-C9NU-07) |
ORF區(qū)為 Cas9 核酸酶基因,由 CBh 啟動(dòng)子啟動(dòng)表達(dá)。能將Cas9 核酸酶基因整合到人類 小鼠 ROSA26 位點(diǎn)。 (Hygromycin) |
SH352 |
小鼠 ROSA26 safe harbor Cas9 敲入克。DC-C9NU-08) |
ORF區(qū)為 Cas9 核酸酶基因,由 CBh 啟動(dòng)子啟動(dòng)表達(dá)。能將Cas9 核酸酶基因整合到人類 小鼠 ROSA26 位點(diǎn)。 (Neomycin) |
多種 |
人類 AAVS1 或小鼠 ROSA26 ORF 敲入克隆 |
由 CMV 啟動(dòng)子啟動(dòng) ORF 表達(dá)。能將 ORF 或您的目的基因敲入人類 AAVS1 或小鼠 ROSA26 safe harbor 位點(diǎn)。 |
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