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泛素化蛋白快速富集純化黑科技-TUBEs

瀏覽次數(shù):1166 發(fā)布日期:2020-7-14  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負
       泛素化是一種常見的調(diào)節(jié)蛋白的穩(wěn)定性和功能的翻譯后修飾。蛋白的泛素化需要3種酶的參與,分別是泛素活化酶(ubiquitin-activating enzyme,E1)、泛素偶聯(lián)酶(ubiquitin conjugation enzyme,E2)和泛素連接酶(ubiquitin ligase,E3)。在3種酶的作用下,泛素(ubiquitin,ub)分子的C端羧基與底物蛋白賴氨酸(Lys)殘基的Ԑ氨基形成酰胺異構(gòu)肽。同時,泛素也能發(fā)生泛素化修飾形成不同的泛素鏈,而不同的泛素鏈又介導(dǎo)不同的生物功能。泛素化修飾不僅參與底物蛋白的26S蛋白酶體降解過程,還參與基因轉(zhuǎn)錄、細胞周期、DNA損傷和免疫應(yīng)激等生物過程。大規(guī)模富集泛素聚合物是研究泛素化系統(tǒng)的關(guān)鍵技術(shù)。傳統(tǒng)的富集泛素化蛋白的常用手段是標簽富集或者高親和力抗體富集,這種基于抗體的泛素蛋白質(zhì)組學(xué)對于大規(guī)模泛素化系統(tǒng)的研究是非常昂貴的,而且,目前市面上大多數(shù)供應(yīng)商出售的泛素抗體是非選擇性的,無法滿足研究學(xué)者的多樣需求。
 
 
       泛素結(jié)合結(jié)構(gòu)域(ubiquitin-binding domains,UBD)是一種可識別和結(jié)合泛素化修飾的蛋白小模塊。根據(jù)結(jié)構(gòu)域的不同可將UBD分為20個家族,這些UBD對泛素的親和力不等(2~500umol),且存在泛素鏈的偏好性。UBD結(jié)合下的泛素化蛋白在胰蛋白酶的作用下,泛素化底物上的泛素化位點Lys由于泛素化產(chǎn)生一個帶2個甘氨酸標簽的分枝狀漏切肽段,這2個甘氨酸標簽是由于修飾的泛素分子的C末端通過異肽鍵與泛素化位點的Lys結(jié)合,經(jīng)過胰蛋白酶消化后保留的殘基。產(chǎn)生的信號肽在質(zhì)譜信號中會產(chǎn)生一個114.043Da的質(zhì)量躍遷,結(jié)合漏切的Lys位點,合稱為GG-K信號肽,通過該信號肽結(jié)合數(shù)據(jù)庫搜索引擎可實現(xiàn)對泛素化底物的鑒定。這也是高精度質(zhì)譜技術(shù)實現(xiàn)泛素化底物鑒定的基礎(chǔ)。
 
       基于UBD對泛素的高親和力,泛素研究專家LifeSensors已開發(fā)出利用串聯(lián)泛素結(jié)合實體(Tandem Ubiquitin Binding Entities,TUBE)從細胞和組織裂解液中特異性分離富集泛素化蛋白的技術(shù)。TUBEs由多個UBDs串聯(lián)構(gòu)成,對泛素鏈親和性極高,而且,TUBEs通過與泛素鏈的結(jié)合可以保護蛋白質(zhì)不被去泛素化,同時避免靶蛋白發(fā)生蛋白酶體介導(dǎo)的降解,為研究泛素化蛋白質(zhì)組學(xué)提供了很好的工具。
 
       除了研發(fā)和生產(chǎn)可與所有類型的多聚泛素鏈結(jié)合的TUBE(pan-TUBE)之外,LifeSensors還開發(fā)了可選擇性地與K48或K63或線性(M1)多泛素化蛋白結(jié)合的鏈特異性TUBE。
 
 
       TUBE產(chǎn)品優(yōu)勢:
 
       1.可快速有效的實現(xiàn)泛素化蛋白的富集和純化
       2.比單個UBA結(jié)構(gòu)域的親和力高1000倍
       3.與泛素抗體相比有更高的特異性和親和力
       4.保護蛋白質(zhì)不被去泛素化,同時可避免靶蛋白發(fā)生蛋白酶體介導(dǎo)的降解
 
 
       pan-TUBE——可與所有類型的多聚泛素鏈結(jié)合
 
標簽類型 貨號 名稱
磁珠(Magnetic) UM401M TUBE 1 (Magnetic Beads)
UM402M TUBE 2 (Magnetic Beads)
瓊脂糖珠(Agarose) UM401 TUBE 1 (Agarose)
UM402 TUBE 2 (Agarose)
生物素 UM301 TUBE 1 (Biotin)
UM302 TUBE 2 (Biotin)
GST UM101 TUBE 1 (GST)
His6 UM201 TUBE 1 (His6)
HRP UM312 TUBE 2 (HRP)
熒光(Fluorescein/Tamra) UM502F TUBE 2 (Fluorescein)
UM502T TUBE 2 (TAMRA)
 
       Selective TUBEs——與M1-線性多聚泛素鏈特異性結(jié)合
 
標簽類型 貨號 名稱
His6 UM206 M1 TUBE (His6)
生物素 UM306 M1 TUBE (Biotin)
FLAG UM606 M1 TUBE (FLAG)
       Selective TUBEs——與K48-多聚泛素鏈特異性結(jié)合
 
標簽類型 貨號 名稱
磁珠(Magnetic) UM407M K48 TUBE HF (Magnetic Beads)
生物素 UM307 K48 TUBE HF (Biotin)
FLAG UM607 K48 TUBE HF (FLAG)
His6 UM207: K48 TUBE HF (His6)
GST UM107 K48 TUBE HF (GST)
熒光(Fluorescein/Tamra) UM507F K48 TUBE HF (Fluorescein)
UM507T K48 TUBE HF (TAMRA)
       Selective TUBEs——與K63-多聚泛素鏈特異性結(jié)合
 
標簽類型 貨號 名稱
磁珠(Magnetic) UM404M K63 TUBE (Magnetic Beads)
生物素 UM304 K63 TUBE (Biotin)
FLAG UM604 K63 TUBE (FLAG)
熒光(Fluorescein/Tamra) UM504F K63 TUBE (Fluorescein)
UM504T K63 TUBE (TAMRA)
 
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