泛素化蛋白快速富集純化黑科技-TUBEs
瀏覽次數(shù):1166 發(fā)布日期:2020-7-14
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泛素化是一種常見的調(diào)節(jié)蛋白的穩(wěn)定性和功能的翻譯后修飾。蛋白的泛素化需要3種酶的參與,分別是泛素活化酶(ubiquitin-activating enzyme,E1)、泛素偶聯(lián)酶(ubiquitin conjugation enzyme,E2)和泛素連接酶(ubiquitin ligase,E3)。在3種酶的作用下,泛素(ubiquitin,ub)分子的C端羧基與底物蛋白賴氨酸(Lys)殘基的Ԑ氨基形成酰胺異構(gòu)肽。同時,泛素也能發(fā)生泛素化修飾形成不同的泛素鏈,而不同的泛素鏈又介導(dǎo)不同的生物功能。泛素化修飾不僅參與底物蛋白的26S蛋白酶體降解過程,還參與基因轉(zhuǎn)錄、細胞周期、DNA損傷和免疫應(yīng)激等生物過程。大規(guī)模富集泛素聚合物是研究泛素化系統(tǒng)的關(guān)鍵技術(shù)。傳統(tǒng)的富集泛素化蛋白的常用手段是標簽富集或者高親和力抗體富集,這種基于抗體的泛素蛋白質(zhì)組學(xué)對于大規(guī)模泛素化系統(tǒng)的研究是非常昂貴的,而且,目前市面上大多數(shù)供應(yīng)商出售的泛素抗體是非選擇性的,無法滿足研究學(xué)者的多樣需求。
泛素結(jié)合結(jié)構(gòu)域(ubiquitin-binding domains,UBD)是一種可識別和結(jié)合泛素化修飾的蛋白小模塊。根據(jù)結(jié)構(gòu)域的不同可將UBD分為20個家族,這些UBD對泛素的親和力不等(2~500umol),且存在泛素鏈的偏好性。UBD結(jié)合下的泛素化蛋白在胰蛋白酶的作用下,泛素化底物上的泛素化位點Lys由于泛素化產(chǎn)生一個帶2個甘氨酸標簽的分枝狀漏切肽段,這2個甘氨酸標簽是由于修飾的泛素分子的C末端通過異肽鍵與泛素化位點的Lys結(jié)合,經(jīng)過胰蛋白酶消化后保留的殘基。產(chǎn)生的信號肽在質(zhì)譜信號中會產(chǎn)生一個114.043Da的質(zhì)量躍遷,結(jié)合漏切的Lys位點,合稱為GG-K信號肽,通過該信號肽結(jié)合數(shù)據(jù)庫搜索引擎可實現(xiàn)對泛素化底物的鑒定。這也是高精度質(zhì)譜技術(shù)實現(xiàn)泛素化底物鑒定的基礎(chǔ)。
基于UBD對泛素的高親和力,泛素研究專家LifeSensors已開發(fā)出利用串聯(lián)泛素結(jié)合實體(Tandem Ubiquitin Binding Entities,TUBE)從細胞和組織裂解液中特異性分離富集泛素化蛋白的技術(shù)。TUBEs由多個UBDs串聯(lián)構(gòu)成,對泛素鏈親和性極高,而且,TUBEs通過與泛素鏈的結(jié)合可以保護蛋白質(zhì)不被去泛素化,同時避免靶蛋白發(fā)生蛋白酶體介導(dǎo)的降解,為研究泛素化蛋白質(zhì)組學(xué)提供了很好的工具。
除了研發(fā)和生產(chǎn)可與所有類型的多聚泛素鏈結(jié)合的TUBE(pan-TUBE)之外,LifeSensors還開發(fā)了可選擇性地與K48或K63或線性(M1)多泛素化蛋白結(jié)合的鏈特異性TUBE。
TUBE產(chǎn)品優(yōu)勢:
1.可快速有效的實現(xiàn)泛素化蛋白的富集和純化
2.比單個UBA結(jié)構(gòu)域的親和力高1000倍
3.與泛素抗體相比有更高的特異性和親和力
4.保護蛋白質(zhì)不被去泛素化,同時可避免靶蛋白發(fā)生蛋白酶體介導(dǎo)的降解
pan-TUBE——可與所有類型的多聚泛素鏈結(jié)合
標簽類型 |
貨號 |
名稱 |
磁珠(Magnetic) |
UM401M |
TUBE 1 (Magnetic Beads) |
UM402M |
TUBE 2 (Magnetic Beads) |
瓊脂糖珠(Agarose) |
UM401 |
TUBE 1 (Agarose) |
UM402 |
TUBE 2 (Agarose) |
生物素 |
UM301 |
TUBE 1 (Biotin) |
UM302 |
TUBE 2 (Biotin) |
GST |
UM101 |
TUBE 1 (GST) |
His6 |
UM201 |
TUBE 1 (His6) |
HRP |
UM312 |
TUBE 2 (HRP) |
熒光(Fluorescein/Tamra) |
UM502F |
TUBE 2 (Fluorescein) |
UM502T |
TUBE 2 (TAMRA) |
Selective TUBEs——與M1-線性多聚泛素鏈特異性結(jié)合
標簽類型 |
貨號 |
名稱 |
His6 |
UM206 |
M1 TUBE (His6) |
生物素 |
UM306 |
M1 TUBE (Biotin) |
FLAG |
UM606 |
M1 TUBE (FLAG) |
Selective TUBEs——與K48-多聚泛素鏈特異性結(jié)合
標簽類型 |
貨號 |
名稱 |
磁珠(Magnetic) |
UM407M |
K48 TUBE HF (Magnetic Beads) |
生物素 |
UM307 |
K48 TUBE HF (Biotin) |
FLAG |
UM607 |
K48 TUBE HF (FLAG) |
His6 |
UM207: |
K48 TUBE HF (His6) |
GST |
UM107 |
K48 TUBE HF (GST) |
熒光(Fluorescein/Tamra) |
UM507F |
K48 TUBE HF (Fluorescein) |
UM507T |
K48 TUBE HF (TAMRA) |
Selective TUBEs——與K63-多聚泛素鏈特異性結(jié)合
標簽類型 |
貨號 |
名稱 |
磁珠(Magnetic) |
UM404M |
K63 TUBE (Magnetic Beads) |
生物素 |
UM304 |
K63 TUBE (Biotin) |
FLAG |
UM604 |
K63 TUBE (FLAG) |
熒光(Fluorescein/Tamra) |
UM504F |
K63 TUBE (Fluorescein) |
UM504T |
K63 TUBE (TAMRA) |
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