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高GC含量PCR樣本的擴(kuò)增困難與防止污染與降解的操作方法

瀏覽次數(shù):5037 發(fā)布日期:2020-5-26  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
       每天做實(shí)驗(yàn)小心翼翼,時(shí)時(shí)擔(dān)心提取的DNA被污染、被降解。終于,廢了九牛二虎之力,好不容易提取到高質(zhì)量的DNA,然而PCR仍然P不出來(lái)?xiàng)l帶。是試劑加漏了嗎?是酶失活了嗎?換上新試劑,冰上重來(lái)一次,然并卵,不僅P不出來(lái),更重要的是也不知道為啥P不出來(lái),貝多芬都彈不出我的悲傷!
 
       算了,悲傷往事不再提,今天小編就總結(jié)教訓(xùn),帶你啃一啃PCR的這個(gè)硬骨頭吧!PCR擴(kuò)增不出來(lái)?xiàng)l帶的原因有很多,諸如引物設(shè)計(jì)有誤,DNA模板已降解,酶失活或者有雜酶污染,緩沖液條件不當(dāng),模板DNA的GC含量太高等等。大部分原因可以通過(guò)換試劑得到解決,但是對(duì)于高GC含量的樣本,往往束手無(wú)策。
 
 
       在DNA(A、T、C、G)4種堿基中,鳥嘌呤(G)和胞嘧啶(C)所占的比率稱為GC含量。因?yàn)镚、C之間形成三對(duì)氫鍵,解鏈所需能量較高,所以模板很難打開(kāi),高GC含量(G+C≥60%)模板擴(kuò)增中所面臨的主要困難是模板中容易形成穩(wěn)定的二級(jí)結(jié)構(gòu)妨礙DNA聚合酶在模板上的推進(jìn),而且模板上可能存在多個(gè)非特異性的引物復(fù)性位點(diǎn),導(dǎo)致非特異性擴(kuò)增,甚至很多時(shí)候擴(kuò)增不出靶基因。高GC含量的DNA序列廣泛存在于不同物種的基因組中。人類高GC含量的DNA序列雖然只占了全基因組的3%,但有28%的基因位于這些區(qū)域內(nèi)。此外,包括啟動(dòng)子和增強(qiáng)子在內(nèi)的許多基因重要調(diào)控區(qū)域也大都由高GC含量的DNA序列組成。
 
       目前,研究學(xué)者建立了各種不同的方法來(lái)解決高GC含量DNA模板擴(kuò)增困難的問(wèn)題,包括降落PCR、添加增強(qiáng)劑(如DMSO)等。雖然這些方法和手段的單獨(dú)使用都獲得了一定的效果,但是對(duì)于引物和模板的要求普遍過(guò)于苛刻,適用范圍也比較局限,并不具有普遍適用性,而且往往經(jīng)過(guò)多次摸索和嘗試,也不易得到較好的結(jié)果。
 

 
       所以您還在為高GC含量PCR煩惱嗎?您還在為擴(kuò)增不出來(lái)結(jié)果而焦心嗎?PCR試劑領(lǐng)軍品牌Solis BioDyne可以為您輕松解決這個(gè)難題,可同時(shí)提供適合高GC含量PCR的預(yù)混液以及添加劑:
 
貨號(hào) 名稱 規(guī)格 特點(diǎn)
04-33-00115 5x HOT FIREPol GC Master Mix
高GC含量模板預(yù)混液
250rnx 適用于GC含量高至79%的模板;長(zhǎng)度可擴(kuò)增至5kb;非常穩(wěn)定,可常溫運(yùn)輸和操作
04-33-02015 5000rnx
05-16-00010 10x GC-rich Enhancer
高GC含量增強(qiáng)劑
1ml 高GC含量模板PCR的添加劑
05-16-00050 5ml

 
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       價(jià)值觀:激情、敬業(yè)、學(xué)習(xí)、創(chuàng)新、合作、卓越。
 
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