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新冠病毒核酸檢測PCR技術(shù)知識點梳理

瀏覽次數(shù):4896 發(fā)布日期:2020-4-30  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
近日,由于全國復(fù)工復(fù)產(chǎn)復(fù)學(xué)的大量需求,阿里健康、美團App 等線上平臺聯(lián)合各大第三方檢測機構(gòu),陸續(xù)開放了線上預(yù)約新冠病毒核酸檢測服務(wù)。
 
開通服務(wù)的地區(qū),人們可以拿起手機即可便捷的預(yù)約核酸檢測,最快24小時即可拿到結(jié)果。如此便捷的服務(wù),讓廣大民眾歡欣鼓舞,科技的發(fā)展又一次為人們的生活帶來翻天覆地的變化。
 
談技術(shù)之前,咱們先說點國計民生重要的事情:
 
根據(jù)國家藥品監(jiān)督管理局官網(wǎng)數(shù)據(jù)查詢信息,國內(nèi)已有19個新冠病毒核酸檢測產(chǎn)品取得醫(yī)療器械注冊證書,如下圖。
 
廣大醫(yī)療機構(gòu)及百姓做核酸檢測的時候,請一定要認(rèn)準(zhǔn)這些合法的產(chǎn)品和企業(yè)!
 

 
而瀏覽完上表,我們會發(fā)現(xiàn),大部分的新冠病毒核酸檢測試劑盒的原理都是基于熒光PCR法,對于一直活躍在科研圈的工作者,自然對鼎鼎大名的PCR技術(shù)不陌生,那么熒光PCR、qPCR、RT-PCR等等各種PCR技術(shù),您分得清嗎?是不是還在犯迷糊呢?
 
 
今天,小艾就帶你區(qū)分區(qū)分,梳理一下分子診斷領(lǐng)域的“杠把子”-PCR技術(shù):
 
PCR,也就是聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Polymerase Chain Reaction),是一種用于放大擴增特定的DNA片段的分子生物學(xué)技術(shù),它可看作是生物體外的特殊DNA復(fù)制,PCR的最大特點是能將微量的DNA大幅擴增,放大,用于后續(xù)的檢測和基因比對。因此,無論是化石中的古生物、歷史人物的殘骸,還是幾十年前兇殺案中兇手所遺留的毛發(fā)、皮膚或血液,只要能分離出一丁點的DNA,就能用PCR加以放大,進行比對。這也是“微量證據(jù)”的威力之所在。
 

 
PCR由1983年美國Mullis首先提出設(shè)想,1985年由其發(fā)明了聚合酶鏈反應(yīng),即簡易DNA擴增法,意味著PCR技術(shù)的真正誕生。所有的各種PCR都是在此基礎(chǔ)上發(fā)展出來的,比如熒光PCR、qPCR、RT-QPCR等。
 
什么是熒光PCR?
 
熒光PCR技術(shù)是20世紀(jì)90年代中期發(fā)展起來的一種新型核酸定量技術(shù)。該技術(shù)具有實時監(jiān)測、快速、靈敏、精確等特點,是對原有PCR技術(shù)的革新,擴大了PCR的應(yīng)用范圍。
 
熒光PCR法根據(jù)化學(xué)發(fā)光原理可以分為染料法和探針法,它們的區(qū)別是什么呢?
 
1.染料法:可用的染料有SYBR®Green I 、SolisGreen® 等;染料能夠與DNA雙鏈結(jié)合,當(dāng)PCR擴增的時候,染料結(jié)合到DNA上,從而發(fā)光,單個的染料不發(fā)光,這樣就能收集到信號。
 
 
2.探針法:TaqMan 探針法即除了引物外另外設(shè)置一個探針,在探針的兩端分別帶上發(fā)光基團和淬滅基團,這個時候,兩個平衡不發(fā)光,但是當(dāng)DNA通過引物合成的時候,探針被折斷,釋放出發(fā)光基團和淬滅基團,兩個距離較遠(yuǎn),發(fā)光基團產(chǎn)生熒光,被機器收集到信號,從而檢測到基因的量。
 
 
根據(jù)擴增策略和檢測產(chǎn)物手段的不同,PCR又可分為定性PCR和定量PCR。這里主要說一說定量PCR。
 
定量PCR,也就是qPCR,由于其英文全稱是real-time quantitative polymerase chain reaction,有些也稱為RT-qPCR,國外通常簡稱為qPCR,是由美國Applied Bisystems公司于1996年研制出的一種新型核酸定量技術(shù),并隨著熒光PCR 儀的推出而逐漸得到廣泛應(yīng)用。也是現(xiàn)在常用于臨床檢驗的PCR技術(shù),該技術(shù)在常規(guī)PCR 基礎(chǔ)上運用熒光共振能量轉(zhuǎn)移現(xiàn)象( fluorescence resonance energy transfer, FRET) 技術(shù), 加入熒光標(biāo)記探針, 巧妙地把核酸擴增、雜交、光譜分析和實時檢測技術(shù)結(jié)合在一起, 在PCR 指數(shù)擴增期間通過連續(xù)監(jiān)測熒光信號的強弱來即時測定特異性產(chǎn)物的量, 并據(jù)此推斷目的基因的初始量。
 
RT-PCR,實際上是反轉(zhuǎn)錄PCR(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction),又稱逆轉(zhuǎn)錄PCR。國際上的約定俗成的是:RT-PCR 特指反轉(zhuǎn)錄 PCR,而 Real-time PCR 一般縮寫為 qPCR(quantitative real-time PCR)
 
RT-PCR原理是:提取組織或細(xì)胞中的總RNA,以其中的mRNA作為模板,采用Oligo(dT)或隨機引物利用逆轉(zhuǎn)錄酶反轉(zhuǎn)錄稱cDNA。再以cDNA為模板進行PCR擴增,而獲得目的基因的表達(dá)。RT-PCR使RNA檢測的靈敏性提高了幾個數(shù)量級,使一些極為微量RNA樣品分析成為可能。
 
RT-PCR技術(shù)靈敏而且用途廣泛,可用檢測細(xì)胞、組織中基因表達(dá)水平,細(xì)胞中RNA病毒的含量和直接克隆特點基因的cDNA序列等。如果用于定量檢測,就是上文提到的qPCR, 此次新冠病毒核酸檢測熒光PCR技術(shù),就是基于此。
 
 
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新冠病毒核酸檢測試劑盒優(yōu)勢:
 
    特異識別和檢測新冠病毒SARS-CoV-2
    適用于人痰液、鼻液、咽拭子樣本
    可信度高、即用型、快速出結(jié)果 < 2 hr
 
新冠病毒核酸檢測試劑盒檢測原理圖示:
 
 
新冠病毒核酸檢測試劑盒組分:
 
新冠病毒全套核酸PCR檢測試劑盒(貨號#K1460-100
中文名 英文名
2X qPCR主要預(yù)混物 2X qPCR Master Mix
反轉(zhuǎn)錄預(yù)混物 Reverse Transcription Mix
PCR引物和探針套裝 PCR Primer/ Probe set
緩沖液 Rehydration Buffer
新冠病毒陽性對照 COVID-19 Positive control (PTC)
陰性對照 Non-Template Negative Control (NTC)
 
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新冠病毒一步法PCR檢測試劑盒檢測原理:是基于一步法反轉(zhuǎn)錄實時定量PCR技術(shù)(real-time RT-PCR),通過反轉(zhuǎn)錄病毒RNA實現(xiàn)快速高效的檢測新冠病毒(SARS-CoV-2)
 
新冠病毒一步法PCR檢測試劑盒(貨號#08-65-00250)組分:
 

組分

規(guī)格

50rxn 250rxn 5000rxn
40xOne-step SOLIScript® CoV  Mix 25ul 125ul 2.5ml
5x One-step Probe CoV  Mix 200ul 1ml 20ml
Nuclease-free water 1.25ml 5ml 100ml
 
小編福利:如果想要獲取新型冠狀病毒核酸檢測引物和探針序列(Specific primers and probes for detection 2019 novel coronavirus)可以參考
 
    中國國家疾病控制中心
 
鏈接:http://ivdc.chinacdc.cn/kyjz/202001/t20200121_211337.html
 
    WHO幫助文件《Diagnostic detection of 2019-nCoV by real-time RT-PCR》
 
(原文鏈接地址:https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/protocol-v2-1.pdf?sfvrsn=a9ef618c_2),其中RdRP_SARSr-P2為檢測2019-conV的特異性探針,P1為通用探針,能檢測2019-nCoV、SARS-CoV以及bat-SARS-related CoV。


艾美捷科技有限公司,通過提供完整的產(chǎn)品和服務(wù)體系、便利的客戶關(guān)系和供應(yīng)鏈管理,為生命科學(xué)研究工作者提供整體打包方案。我們的企業(yè)的核心價值觀:“學(xué)習(xí)、創(chuàng)新、合作、卓越”。激發(fā)我們內(nèi)在的創(chuàng)造力,提供有競爭力的生物醫(yī)學(xué)產(chǎn)品和服務(wù),持續(xù)為客戶創(chuàng)造最大價值是我們的企業(yè)使命。我們的企業(yè)愿景是成為受人尊重、世界一流的生物醫(yī)學(xué)產(chǎn)品及服務(wù)供應(yīng)商。
 
作為一家具有尖端的技術(shù)實力、一流的經(jīng)營管理水平和完善的市場銷售體系的生物高科技企業(yè),總部位于武漢光谷國家級高新技術(shù)開發(fā)區(qū),服務(wù)面向全國。艾美捷科技是集進口試劑、實驗室耗材銷售、技術(shù)服務(wù)與合約開發(fā)為一體的專業(yè)化高科技公司,為用戶提供最前沿的專業(yè)資訊、完備的產(chǎn)品、整合的解決方案,及優(yōu)質(zhì)的物流服務(wù)。為了更好的服務(wù)客戶,公司組建了一支經(jīng)驗豐富的研發(fā)團隊-艾美捷生物技術(shù)中心,進入研發(fā)生產(chǎn)階段,將更優(yōu)質(zhì)的產(chǎn)品推薦給國內(nèi)生物領(lǐng)域的同仁們!
 
來源:艾美捷科技有限公司
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