m5C RNA甲基化簡介
通過分析近幾年的國自然立項(xiàng),可以發(fā)現(xiàn)RNA甲基化這兩年的基金項(xiàng)目呈指數(shù)級(jí)增長的趨勢(shì):特別是從2015年的5項(xiàng)到2017年的25項(xiàng),項(xiàng)目增長尤為顯著。僅2018年1月的RNA甲基化文獻(xiàn)就達(dá)到25篇,可以說RNA甲基化的發(fā)展已經(jīng)到了井噴階段,多篇文章榮登CNS級(jí)別期刊。
圖: RNA甲基化歷年發(fā)文章數(shù)據(jù)
RNA甲基化是一類新認(rèn)知的表觀遺傳修飾,主要包括6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A), 5-甲基胞嘧啶(C5-methylcytidine,m5C),1-甲基腺嘌呤(N1-methyladenosine,m1A)等。RNA甲基化在調(diào)控基因表達(dá)、穩(wěn)定、降解等方面具有重要作用。其中,m5C RNA甲基化是一類新型的表觀轉(zhuǎn)錄組學(xué)修飾,也是最新的國際科研熱點(diǎn),在非編碼RNA及部分mRNA上廣泛存在。為了系統(tǒng)性揭示RNA甲基化修飾,云序生物獨(dú)家首發(fā)m5C RNA甲基化測序服務(wù),可在全轉(zhuǎn)錄組范圍內(nèi)單堿基分辨率地檢測基因m5C甲基化修飾分布。
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m5C RNA甲基化文獻(xiàn)解析(影響因子:11.9)
這里給大家分享一篇2017年《Genome Biology》上的m5C甲基化譜文章:作者通過m5C RNA甲基化測序,發(fā)現(xiàn)小鼠胚胎干細(xì)胞中m5C修飾位點(diǎn)優(yōu)先分布于mRNA起始密碼子附近,在小鼠腦組織中則傾向于分布在3'UTR區(qū)。通過生信分析對(duì)m5C修飾的RNA對(duì)應(yīng)基因功能GO注釋。此外與CLIPdb的數(shù)據(jù)聯(lián)合分析發(fā)現(xiàn),小鼠胚胎干細(xì)胞中大約29%的m5C RNA修飾位點(diǎn)與對(duì)應(yīng)RBP(RNA結(jié)合蛋白)結(jié)合位點(diǎn)重合,顯示出與RBP結(jié)合并在特定轉(zhuǎn)錄本中發(fā)揮生物學(xué)功能的潛力。
思路圖
結(jié)果展示
圖: 胚胎干細(xì)胞和大腦組織中m5C RNA甲基化富集區(qū)域注釋
云序生物m5C RNA甲基化數(shù)據(jù)展示
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