PacBio RS II測序系統(tǒng)一經(jīng)推出，其長讀長、單分子堿基分辨率及無GC偏好性的特征即受到廣大研究者的推崇，尤其是在HLA檢測分型領(lǐng)域，國際上權(quán)威HLA檢測分型機(jī)構(gòu)相繼引進(jìn)PacBio RS II測序技術(shù)進(jìn)行相關(guān)服務(wù)或試劑盒的研發(fā)，推起了PacBio在HLA研究應(yīng)用領(lǐng)域的高潮。

HistoGenetics公司和Pacific Bioscience公司于2014年4月29日共同宣布，鑒于PacBio測序平臺能夠測通HLA基因全長，從而提供更加精確的HLA分型的優(yōu)勢，購進(jìn)兩臺PacBio RS II系統(tǒng)取代之前Sanger一代測序用于HLA分型。HLA是具有高度多態(tài)性的同種異體抗原，含有上萬種等位基因以編碼抗原蛋白識別外來抗原。準(zhǔn)確的HLA分型對于器官移植、自身免疫疾病相關(guān)研究、藥物超敏性研究等非常重要。之前采用Sanger及NGS短序列測序方法對HLA分型不夠精確，為獲得精確的分型結(jié)果，還需要額外的成本，PacBio長序列測序儀的出現(xiàn)為HLA精確分型提供了更好的解決方案。

Nezih Cereb博士，作為HistoGenetics公司CEO及創(chuàng)建者，接受采訪時說：“作為HLA分型市場的領(lǐng)導(dǎo)者，我們一直致力于尋求可以精確地對基因組復(fù)雜區(qū)域的分析技術(shù)。而PacBio技術(shù)平臺，借助于其業(yè)內(nèi)領(lǐng)導(dǎo)地位的讀長、精確度及快速測序時間優(yōu)勢，正是這個市場所需要的，我們迫切地想用PacBio RS II測序儀去發(fā)現(xiàn)HLA區(qū)域更多的信息�！�

Anthony Nolan研究中心和美國太平洋生物科技公司（PacBio）于5月13日共同宣布，Anthony Nolan研究中心延續(xù)在技術(shù)方面革命性地創(chuàng)新的記錄，通過購入兩套PacBio RSII系統(tǒng)，實現(xiàn)對HLA基因全長進(jìn)行單分子、實時的測序。

據(jù)Anthony Nolan研究中心介紹，之所以引進(jìn)PacBio系統(tǒng)，正是看重了PacBio RSII系統(tǒng)在行業(yè)內(nèi)最長的讀長與最高的一致性精確度。借助于PacBio RSII系統(tǒng)，Anthony Nolan研究中心將可以在組織分型服務(wù)方面提供無與倫比的細(xì)節(jié)信息與精確度。

Anthony Nolan研究中心生物信息部主管Steven Marsh教授：“從我們機(jī)構(gòu)的角度，Anthony Nolan研究中心一直是在技術(shù)上領(lǐng)先的機(jī)構(gòu)。引進(jìn)PacBio單分子實時測序技術(shù)，將幫助我們實現(xiàn)在等位基因水平上的分型。利用在分型方面最高的分辨率信息，我們可以在組織移植及其他應(yīng)用方面進(jìn)行精確的HLA分型，實現(xiàn)在骨髓及血液腫瘤細(xì)胞移植上更高的成功率。”

GenDx和Pacific Bioscience公司于2014年6月19日宣布，GenDx作為基于二代測序HLA分型的先驅(qū)將和Pacific Bioscience公司合作開發(fā)并提供全長HLA基因測序相關(guān)產(chǎn)品。

高分辨率的HLA分型及HLA全長基因測序使得能夠準(zhǔn)確區(qū)分HLA等位基因之間的異同，甚至是極小的差別。特異的HLA分型對免疫相關(guān)疾病的研究、藥物超敏性研究及其他應(yīng)用非常關(guān)鍵。因此，越來越多的人們對明晰整個HLA基因全長的特征感興趣。GenDx目前提供HLA I類全長擴(kuò)增試劑，未來將會在其NGSgo產(chǎn)品線提供基于PacBio RS II DNA測序系統(tǒng)開發(fā)的Barcode引物。這些試劑盒將會幫助研究者將不同來源的全長HLA I基因混合樣品在同一個SMRT測序孔中完成。

Wietse Mulder博士，GenDx公司總經(jīng)理，評價說：“全長HLA基因測序分型方法，最初是在GenDx公司基于Sanger測序方法開發(fā)的，這種方法也已經(jīng)在上萬種樣品中進(jìn)行測序并證明HLA兩個等位基因都可以被擴(kuò)增。我們非常興奮現(xiàn)在PacBio的SMRT測序技術(shù)現(xiàn)在可以完全的完成基因分型并獲得非常精確的分型結(jié)果，我們相信這種創(chuàng)新的技術(shù)將會在HLA領(lǐng)域提供很多組織分型方案�！�

Mats Bengtsson博士，移植免疫實驗室主任，評價說：“我們相信PacBio長度長配合其快速的測序時間將會在HLA分型應(yīng)用領(lǐng)域掀起波瀾。并且，這種基于全長的分型、精確的分型結(jié)果及鑒定發(fā)現(xiàn)新的等位基因的能力是史無前例的�！�

HistoGenetics公司是世界范圍內(nèi)HLA基因分型領(lǐng)域的領(lǐng)導(dǎo)者。HistoGenetics公司作為這個領(lǐng)域的開拓者，已經(jīng)為供體注冊機(jī)構(gòu)、供體中心、臍血庫、移植中心、HLA分型實驗室及藥物基因組學(xué)應(yīng)用提供了很多服務(wù)。

Anthony Nolan研究中心是英國慈善機(jī)構(gòu)，致力于白血病及血液腫瘤病人研究領(lǐng)域。該機(jī)構(gòu)成立于1974年，致力于為需要骨髓及干細(xì)胞移植的病人提供服務(wù)。對于一個成功的移植實驗，需要供體與病人受體的HLA基因型完全匹配。HLA基因型鑒定首先需要對感興趣區(qū)域做PCR擴(kuò)增，克隆出大量拷貝，然后可通過SSOP（Sequence specific oligonucleotides）、SSP（Sequence specific primers）、SBT（Sequence based typing）三種方法進(jìn)行HLA基因分型。

GenDx公司是荷蘭一家分子診斷公司，開發(fā)并向市場提供體外診斷測試及服務(wù)、分析軟件銷售和技術(shù)培訓(xùn)同時是基于測序分型器官移植領(lǐng)域的開拓者。GenDx公司提供世界范圍內(nèi)移植實驗室Sanger測序配套分析軟件及試劑，后來增加基于二代測序平臺測序整個測序流程的各種軟件及試劑配套產(chǎn)品。

天津生物芯片利用PacBio平臺，針對分離自土壤的GC含量的高達(dá)70%的細(xì)菌進(jìn)行了基因組完成圖測序，僅進(jìn)行用了2個cell的測序，獲得超過900Mb的測序數(shù)據(jù)，實現(xiàn)該菌基因組100X以上測序覆蓋。通過PacBio數(shù)據(jù)De novo拼接獲得該菌的基因組完成圖序列；隨后我們利用Illumina平臺進(jìn)行了位點校正，最終獲得高準(zhǔn)確性的基因組完成圖。