雖然條紋斑竹鯊的基因組測序尚未完成,但最近提出的葉吻銀鮫(callorhinchus milii)基因組是一個軟骨魚類基因組理想模型。因此,研究人員使用葉吻銀鮫基因組預測pre-miRNA的發(fā)夾結構。通過小RNA測序,共有91個已知的miRNA和166個假定候選的miRNAs首次在條紋斑竹鯊中得到鑒定(小RNA測序服務由聯(lián)川生物完成)。通過目標預測和GO分析, 在91個已知的miRNA中,篩選出46個miRNAs,特別是細胞增殖和生長相關的miRNAs。
研究人員進一步通過RT-PCR分析條紋斑竹鯊的miRNAs簇以及miRNAs的表達。在正常和再生肝組織中篩選出差異表達的基因,通過鑒定得到十個序列。
本研究是關于軟骨魚miRNA的首次全面報道, 為條紋斑竹鯊現(xiàn)有的數(shù)據(jù)庫添加了大量新的miRNA序列信息,并為進一步研究miRNAs在條紋斑竹鯊肝臟發(fā)育中的功能奠定了基礎。不僅為魚類也為其它物種的肝臟miRNA研究做出了貢獻。
*Conger Lu, et al. (2013) Study of MicroRNAs Related to the Liver Regeneration of the Whitespotted Bamboo Shark, Chiloscyllium plagiosum. BioMed Research International . [article]