來源:干就有未來
干細(xì)胞是一類具有自我更新和多向分化能力的細(xì)胞,在適宜條件下能夠分化成特定譜系細(xì)胞群,進(jìn)而形成不同的組織和器官。因此,干細(xì)胞療法在再生醫(yī)學(xué)領(lǐng)域具有極大的應(yīng)用前景。干細(xì)胞按照來源主要分為胚胎干細(xì)胞(embryonic stem cell,ESC)和成體干細(xì)胞(adult stem cell,ASC)。ESC能夠分化成人體幾乎所有組織和細(xì)胞。而ASC是組織特異性干細(xì)胞,只能分化為所在組織的多種細(xì)胞類型。誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(induced pluripotent stem cell,iPSC)是從成體細(xì)胞重新編程為類似ESC的細(xì)胞。干細(xì)胞能促進(jìn)發(fā)育并維持機(jī)體穩(wěn)態(tài),而異常的自我更新和分化則可導(dǎo)致人體疾病發(fā)生,例如惡性腫瘤。干細(xì)胞的分化過程是由多種信號(hào)傳導(dǎo)通路精細(xì)調(diào)控的動(dòng)態(tài)事件,包括干細(xì)胞的內(nèi)源性信號(hào)調(diào)控通路,干細(xì)胞與微環(huán)境之間的相互作用,以及表觀遺傳調(diào)控網(wǎng)絡(luò)等。這些通路在維持干細(xì)胞多能性、自我更新及響應(yīng)環(huán)境變化等方面發(fā)揮著至關(guān)重要的作用,共同決定了干細(xì)胞的命運(yùn)抉擇。
一、影響干細(xì)胞分化的內(nèi)源性信號(hào)通路
干細(xì)胞分化是一個(gè)復(fù)雜的過程, Wnt、Notch、TGF-β和JAK/STAT等信號(hào)通路共同參與調(diào)控,這些通路相互影響,高度協(xié)作,精確調(diào)節(jié)干細(xì)胞的命運(yùn)。
1. Wnt信號(hào)通路
Wnt蛋白與細(xì)胞表面的Frizzled家族受體和低密度脂蛋白受體相關(guān)蛋白(LRP)5或6結(jié)合,激活下游多蛋白復(fù)合體的解聚,進(jìn)而抑制GSK-3β對(duì)β-catenin的磷酸化,促使β-catenin在胞漿內(nèi)積聚并入核與TCF/LEF家族轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合,最終激活下游靶基因表達(dá),從而影響細(xì)胞增殖、分化和凋亡。這一信號(hào)通路對(duì)維持干細(xì)胞功能也十分重要。在MSC中, 低水平的Wnt信號(hào)能夠維持其自我更新和多能性,而高水平Wnt信號(hào)則促進(jìn)成骨分化。Wnt信號(hào)對(duì)ESC向中內(nèi)胚層分化起關(guān)鍵作用。Wnt信號(hào)的激活還可以促進(jìn)小鼠肺泡Ⅱ型(AT2)干細(xì)胞的增殖,這對(duì)肺上皮損傷修復(fù)具有潛在的治療意義。此外,Wnt/β-catenin信號(hào)通路的異常激活與腫瘤發(fā)生密切相關(guān),如在三陰性乳腺癌中,Wnt信號(hào)與腫瘤干細(xì)胞(cancer stem cell,CSC)的激活和多藥耐藥性密切相關(guān)。
2. Notch信號(hào)通路
Notch信號(hào)通路是在進(jìn)化上高度保守的細(xì)胞間通信機(jī)制。相鄰細(xì)胞表面的Notch配體與受體結(jié)合后觸發(fā)Notch信號(hào)的活化,引發(fā)蛋白水解反應(yīng),生成有活性的Notch細(xì)胞內(nèi)域(Notch-ICD),并進(jìn)一步轉(zhuǎn)移到細(xì)胞核,結(jié)合效應(yīng)蛋白和轉(zhuǎn)錄激活蛋白,從而調(diào)控靶基因表達(dá)。Notch信號(hào)通路對(duì)于維持干細(xì)胞的自我更新及多能性狀態(tài)具有重要意義。例如,在造血干細(xì)胞和神經(jīng)干細(xì)胞中,Notch信號(hào)是維持干細(xì)胞特性的關(guān)鍵因素。在癌癥發(fā)生中,Notch信號(hào)通路的失調(diào)會(huì)促進(jìn)腫瘤細(xì)胞的增殖、轉(zhuǎn)移和血管生成,并對(duì)CSC的自我更新和藥物抗性也起著決定性作用。
3. TGF-β信號(hào)通路
轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子β(TGF-β)超家族主要通過其成員骨形態(tài)發(fā)生蛋白(BMPs)和TGF-β等調(diào)控胚胎發(fā)育、組織發(fā)展及干細(xì)胞命運(yùn)。當(dāng)TGF-β配體結(jié)合到其Ⅱ型受體上,并促使其磷酸化Ⅰ型受體,進(jìn)而激活下游的轉(zhuǎn)錄因子Smad蛋白形成轉(zhuǎn)錄因子復(fù)合物入核,與其他輔助因子相互作用,激活或抑制靶基因轉(zhuǎn)錄。TGF-β信號(hào)通路在干細(xì)胞中的作用較為復(fù)雜。TGF-β/activin信號(hào)通路在人胚胎干細(xì)胞(hESC)的多能性維持中扮演著重要角色,但是對(duì)小鼠胚胎干細(xì)胞(mESC)的多能性卻沒有影響。此外,筆者所在課題組曾報(bào)道p53家族因子可以協(xié)同調(diào)控TGF-β和Wnt信號(hào)通路共同促進(jìn)mESC向中內(nèi)胚層分化。并且,筆者所在課題組最近又發(fā)現(xiàn)TGF-β信號(hào)通路可以在不依賴Smad4的情況下,通過活化的Smad2/3促進(jìn)DNA甲基轉(zhuǎn)移酶3b(Dnmt3b)的表達(dá),并與其互作,共同促進(jìn)多能性mESC向始發(fā)態(tài)上胚層進(jìn)行轉(zhuǎn)變。在ASC中,TGF-β家族信號(hào)通過自分泌或微環(huán)境中的蛋白因子維持干細(xì)胞特性。例如, 靜止期的毛囊干細(xì)胞通過TGF-β信號(hào)被激活以進(jìn)行再生。此外,TGF-β誘導(dǎo)的上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化在乳腺癌和正常乳腺干細(xì)胞的干性獲得中起著關(guān)鍵作用。
4. JAK/STAT信號(hào)通路
JAK/STAT通路由多種細(xì)胞因子和生長(zhǎng)因子激活,通過JAK蛋白的磷酸化激活STAT蛋白,進(jìn)而促進(jìn)STAT蛋白二聚體的形成和核內(nèi)轉(zhuǎn)移,調(diào)控特定基因表達(dá)。在果蠅中,JAK/STAT信號(hào)通過Upd1、Upd2和Upd3等配體激活,影響干細(xì)胞的增殖和維持。在哺乳動(dòng)物中,該通路的激活對(duì)干細(xì)胞的自我更新和多能性至關(guān)重要。JAK/STAT通路在調(diào)控干細(xì)胞行為中的作用不僅限于單一通路,而是與其他信號(hào)通路如Notch、Hippo、Insulin和TOR等存在互作,共同調(diào)節(jié)干細(xì)胞分化和組織再生等行為。此外,JAK/STAT通路的異常激活與多種疾病有關(guān),包括免疫介導(dǎo)的疾病和癌癥。在CSC中,JAK/STAT通路的激活促進(jìn)ZEB1/2表達(dá),后者通過抑制miRNAs表達(dá),上調(diào)干細(xì)胞因子表達(dá),促進(jìn)了CSC的上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化和轉(zhuǎn)移。
二、細(xì)胞外環(huán)境對(duì)干細(xì)胞分化的影響
體內(nèi)干細(xì)胞周圍的特定動(dòng)態(tài)微環(huán)境稱為干細(xì)胞微環(huán)境,它對(duì)于維持干細(xì)胞的自我更新和多向分化潛能起著重要作用。干細(xì)胞和微環(huán)境可以在發(fā)育過程中相互誘導(dǎo),并在成年后相互發(fā)出信號(hào)以維持彼此。在胚胎發(fā)育過程中,微環(huán)境作用于ESC,改變其基因表達(dá),誘導(dǎo)其增殖或分化,從而促進(jìn)胎兒的發(fā)育。在人體內(nèi),干細(xì)胞微環(huán)境能使ASC保持靜止?fàn)顟B(tài),但在組織損傷后,微環(huán)境會(huì)主動(dòng)向ASC發(fā)出信號(hào),促進(jìn)自我更新或分化形成新組織。
在微環(huán)境中,多種因素直接參與了干細(xì)胞的功能調(diào)控,包括干細(xì)胞間的相互作用、干細(xì)胞與鄰近分化細(xì)胞或黏附細(xì)胞間的相互作用、細(xì)胞外基質(zhì)成分(extracellular matrix,ECM)、生長(zhǎng)因子、細(xì)胞因子、氧張力、剪切力和環(huán)境的理化性質(zhì)(包括pH值、離子強(qiáng)度和代謝物)等(圖1)。例如,ECM通過調(diào)節(jié)其組成成分的產(chǎn)生、降解和重塑,對(duì)特定器官發(fā)育和功能修復(fù)發(fā)揮作用。微環(huán)境內(nèi)的信號(hào)傳遞對(duì)維持干細(xì)胞功能和自我更新至關(guān)重要。分泌因子不僅可以在局部1~2個(gè)細(xì)胞間發(fā)揮作用,也可以在整個(gè)微環(huán)境中擴(kuò)散以指導(dǎo)干細(xì)胞命運(yùn)。此外,細(xì)胞黏附分子可以將干細(xì)胞保留在微環(huán)境中,而且干細(xì)胞與微環(huán)境的細(xì)胞或ECM成分直接相互作用產(chǎn)生的機(jī)械力,也可以對(duì)干細(xì)胞的功能產(chǎn)生深遠(yuǎn)影響。
三、干細(xì)胞分化的表觀遺傳調(diào)控
表觀遺傳調(diào)控包括DNA甲基化、組蛋白修飾、非編碼RNA和染色質(zhì)重塑等調(diào)控機(jī)制能夠從多維度影響干細(xì)胞的命運(yùn)和功能(圖2)。
1. DNA甲基化
DNA甲基化主要發(fā)生在CpG位點(diǎn)上,通過在DNA分子胞嘧啶的5'位置添加甲基基團(tuán)來調(diào)控基因表達(dá)。這一修飾將直接抑制轉(zhuǎn)錄因子與甲基化DNA結(jié)合,或者需要招募改變甲基化區(qū)域染色質(zhì)構(gòu)象的染色質(zhì)修飾酶來調(diào)控基因表達(dá)。此外,DNA甲基化參與異染色質(zhì)的形成和維持,這對(duì)于沉默重復(fù)元素和維持干細(xì)胞中的基因組穩(wěn)定性至關(guān)重要。這種修飾在調(diào)控基因表達(dá)、細(xì)胞命運(yùn)決定、X染色體失活、基因印記及轉(zhuǎn)座子沉默等方面發(fā)揮著重要作用。DNA甲基化模式是動(dòng)態(tài)調(diào)控的,可以通過TET家族酶的活性被逆轉(zhuǎn),這些酶將5-mC氧化為5-hmC,啟動(dòng)主動(dòng)去甲基化過程。ESC具有獨(dú)特的甲基化景觀,它在早期胚胎發(fā)育期間發(fā)生全局性去甲基化,隨后與細(xì)胞分化同步建立新的甲基化標(biāo)記,從而沉默多能性因子并促進(jìn)分化因子的表達(dá)。在mESC向上胚層樣細(xì)胞(EpiLC)轉(zhuǎn)變的過程中,Dnmt3b的表達(dá)顯著上調(diào)。一方面,Dnmt3b通過抑制多能性因子例如Sox2的表達(dá)來促進(jìn)mESC多能性的逐步退出;另一方面,Dnmt3b結(jié)合上胚層基因包括Fgf5的順式作用元件周圍,促進(jìn)Smad2/3與低甲基化中心結(jié)合,激活上胚層特異性基因的表達(dá)。此外,DNA去甲基化是體細(xì)胞重編程為iPSC的關(guān)鍵事件,使用DNA去甲基化劑,如5-氮雜胞嘧啶,可以提高重編程效率,為理解細(xì)胞命運(yùn)的可逆性開辟了新途徑。
2. 組蛋白修飾
組蛋白修飾指在組蛋白的氨基酸殘基上進(jìn)行的諸如甲基化、乙;⒎核鼗鞍投辊;纫幌盗行揎棧煌揎椊M合對(duì)于靶基因的表達(dá)及功能的影響各不相同,進(jìn)而影響干細(xì)胞的命運(yùn)。在ESC和iPSC的譜系基因的啟動(dòng)子區(qū)域,組蛋白H3第4位(H3K4)和第27位(H3K27)的賴氨酸能在組蛋白甲基化轉(zhuǎn)移酶的催化下發(fā)生三甲基化修飾。它們所形成的二價(jià)標(biāo)記能維持基因在轉(zhuǎn)錄激活和抑制之間的平衡,保持蓄勢(shì)待發(fā)的狀態(tài)(poised)。在神經(jīng)干細(xì)胞和iPSC中,去除H3K27me3能促進(jìn)神經(jīng)分化,而去除H3K9me3則能維持神經(jīng)干細(xì)胞的自我更新和增殖。在精原干細(xì)胞中,H3K4的去甲基化修飾影響其分化過程。在人骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞中,H3K9的乙酰化和二甲基化修飾與基因啟動(dòng)子區(qū)域的活性密切相關(guān),參與維持MSC的自我更新和多能性。多梳復(fù)合物介導(dǎo)的H2A泛素化(H2Aub)在神經(jīng)發(fā)生潛能受阻時(shí)顯著增加。這表明組蛋白修飾在調(diào)控神經(jīng)前體細(xì)胞命運(yùn)中也發(fā)揮了重要作用。此外,在CSC中,使用DNA甲基轉(zhuǎn)移酶抑制劑或組蛋白去乙酰化酶抑制劑,可以抑制CSC活性。
3. 非編碼RNA
非編碼RNA(non-coding RNA,ncRNA)是一組在細(xì)胞內(nèi)執(zhí)行調(diào)控功能但不參與蛋白質(zhì)編碼的RNA分子,根據(jù)長(zhǎng)度和結(jié)構(gòu)特征主要分為微小RNA(miRNA)、長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)和環(huán)狀RNA(circRNA)三類。不同類型的ncRNA通過參與染色質(zhì)結(jié)構(gòu)改變、細(xì)胞信號(hào)傳導(dǎo)等過程,在多種干細(xì)胞內(nèi)發(fā)揮調(diào)控作用。miR-302家族通過靶向細(xì)胞周期抑制因子,促進(jìn)細(xì)胞周期進(jìn)展,維持ESC及iPSC多能性。let-7家族miRNA在多種腫瘤細(xì)胞中下調(diào),與CSC的成瘤能力密切相關(guān)。而lncRNA,如ROSE1和lincRNA-ROR,在iPSC的生成與維持中扮演關(guān)鍵角色。lncRNA還可以調(diào)控ASC的分化和組織再生能力。例如,lncRNA通過影響特定miRNA的表達(dá)來調(diào)控神經(jīng)干細(xì)胞的分化和功能。此外,心臟干細(xì)胞中特定的circRNA可以通過海綿化miRNA,參與心臟修復(fù)和再生過程。
4. 染色質(zhì)重塑
染色質(zhì)重塑是一種細(xì)胞內(nèi)部的動(dòng)態(tài)調(diào)控過程,涉及特定蛋白質(zhì)復(fù)合物對(duì)染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的調(diào)整,以實(shí)現(xiàn)對(duì)基因表達(dá)的宏觀調(diào)控。該過程主要包括核小體的重新定位、組蛋白尾部共價(jià)修飾及DNA重塑,這些活動(dòng)共同作用于改變?nèi)旧|(zhì)的緊密程度,從而影響轉(zhuǎn)錄因子及其他染色質(zhì)結(jié)合蛋白對(duì)DNA的訪問。此外,染色質(zhì)重塑還參與細(xì)胞對(duì)環(huán)境信號(hào)的響應(yīng),通過改變?nèi)旧|(zhì)結(jié)構(gòu),使細(xì)胞能夠快速調(diào)整其基因表達(dá)模式,適應(yīng)不同的分化需求。染色質(zhì)重塑對(duì)干細(xì)胞的多能性、自我更新及分化過程具有深遠(yuǎn)影響。例如,染色質(zhì)解螺旋酶DNA結(jié)合蛋白(CHD4)是核小體重塑和脫乙酰酶(NuRD)復(fù)合體的亞基,能維持ESC的多能性并抑制分化轉(zhuǎn)錄因子的表達(dá)。在肝細(xì)胞癌中,CSC的成瘤能力和化療抗性也與CHD4的表達(dá)水平相關(guān)。在造血干細(xì)胞中,染色體異常如Trisomy 8通過改變?nèi)旧|(zhì)結(jié)構(gòu)和RUNX1轉(zhuǎn)錄因子的功能,影響干細(xì)胞的自我更新和分化能力。染色質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)也在干細(xì)胞分化中起著關(guān)鍵作用,例如拓?fù)潢P(guān)聯(lián)域和增強(qiáng)子與啟動(dòng)子之間的環(huán)狀連接都可以調(diào)控基因的表達(dá)。這些研究揭示了染色質(zhì)重塑在干細(xì)胞命運(yùn)決定中的多樣化作用機(jī)制,為理解干細(xì)胞功能、開發(fā)新的治療策略提供了新視角。
四、結(jié)語
干細(xì)胞分化是一個(gè)復(fù)雜且多層面的過程,受到細(xì)胞外環(huán)境、信號(hào)通路、表觀遺傳修飾等多種因素的影響。盡管面臨挑戰(zhàn),隨著科學(xué)家對(duì)干細(xì)胞分化調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的深入理解,其在臨床治療中的應(yīng)用前景廣闊,未來有望開發(fā)出更有效的治療方法,維護(hù)人類健康。例如,對(duì)干細(xì)胞及其生態(tài)位的深入理解能促使科研人員開發(fā)出各種生態(tài)位工程技術(shù),建立人工生態(tài)位來調(diào)控干細(xì)胞命運(yùn)。通過結(jié)合信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、表觀遺傳調(diào)控及新興的多組學(xué)技術(shù),可以從多維度理解干細(xì)胞的發(fā)育軌跡和命運(yùn)調(diào)控機(jī)制,以及它們?cè)诓煌砗筒±頎顟B(tài)下的功能,從而充分發(fā)揮干細(xì)胞治療的潛力。此外如何預(yù)防干細(xì)胞衰老也是一個(gè)極具前景的方向,這對(duì)于維持組織穩(wěn)態(tài)和研究器官再生至關(guān)重要。