來解析“身份證”之前，我們先來了解一下什么是基因工程小鼠。
基因工程小鼠，是指通過基因編輯技術(shù)手段，對(duì)小鼠基因組進(jìn)行一定的人為修飾，由此產(chǎn)生具有特定表型或特征的小鼠�；�因工程小鼠通�？煞譃榛�因定點(diǎn)修飾小鼠（如：敲除、敲入、點(diǎn)突變等）和轉(zhuǎn)基因小鼠兩類。

基因定點(diǎn)修飾小鼠
這一類小鼠的名稱基本長這樣，下面我們將逐一解析這些組成部分。

1.品系背景
在單一的小鼠背景上完成的基因修飾，且在繁育過程中未引入其它品系，那么就可用品系全稱或者簡寫來表示。
 

表1 部分品系全名及其簡寫

這里特別提一下定點(diǎn)過表達(dá)的這類情況，目前Rosa26位點(diǎn)和H11位點(diǎn)是最常用的兩個(gè)定點(diǎn)過表達(dá)整合位點(diǎn)。
Rosa26是一個(gè)基因，可以直接用它的Official Symbol：Gt(ROSA)26Sor。

H11并不是某個(gè)基因，而是存在于兩個(gè)基因之間的一個(gè)特定染色體位置，所以沒有Official Symbol。目前公認(rèn)的命名是Igs2，表示intergenic site 2的縮寫。

3.修飾方式
tm：對(duì)于ES細(xì)胞打靶途徑獲得的品系，用tm表示targeted mutation。
em：對(duì)于CRISPR/Cas9或Talen等核酸酶系統(tǒng)介導(dǎo)的基因修飾品系，用em表示endonuclease-mediated mutation。

4.編號(hào)
這里的編號(hào)是指在該實(shí)驗(yàn)室中，對(duì)該基因修飾的序列號(hào)。
如：C57BL/6Smoc-Trp53^em5Smoc表示在Smoc實(shí)驗(yàn)室對(duì)Trp53基因進(jìn)行的第5次突變。

有時(shí)候會(huì)看到 tm1.1、tm1.2的情況，這又是什么意思呢？
這是指條件性基因敲除小鼠在與生殖系重組酶工具鼠交配后獲得的子代小鼠品系，為了與親代CKO小鼠（編號(hào)為tm1）區(qū)分。

5.插入結(jié)構(gòu)
敲入的基因，在括號(hào)內(nèi)寫明插入的外源基因，如：C57BL/6Smoc-Pvalb^{em1(T2A-iCre)Smoc}。

基因敲除和條件性基因敲除，在命名中一般不加入插入結(jié)構(gòu)的部分，即編號(hào)后緊跟實(shí)驗(yàn)室代號(hào)，如：B6.129-Trp53^tm1Smoc。

6.實(shí)驗(yàn)室代號(hào)
一般實(shí)驗(yàn)室代號(hào)是機(jī)構(gòu)名稱的首字母縮寫。如：Smoc代表Shanghai Model Organisms Center。你們的實(shí)驗(yàn)室有沒有代號(hào)呢，可以取一個(gè)哦~

轉(zhuǎn)基因小鼠的命名

這一類小鼠的名稱和上面介紹的略有不同，現(xiàn)在我們就針對(duì)其中不一樣的部分進(jìn)行解讀。

1.轉(zhuǎn)基因
Tg（Transgene）代表轉(zhuǎn)基因，如果使用轉(zhuǎn)座子系統(tǒng)來制備轉(zhuǎn)基因小鼠的話，那么命名時(shí)需在Tg后面加Tn（transposable element）。如：C57BL/6Smoc-Tgtn(pWap-ERBB2)1Smoc

2.轉(zhuǎn)入結(jié)構(gòu)
在括號(hào)中寫明轉(zhuǎn)入的基因啟動(dòng)子信息以及Official Symbol。

知道了基因工程小鼠的命名規(guī)則，你可能又要問了，名字這么長總不能每次都寫全名吧？確實(shí)，通常在文章中對(duì)所用的基因工程小鼠進(jìn)行表述時(shí)，我們可以采用簡寫的方式。但關(guān)于簡寫的標(biāo)準(zhǔn)尚無明確規(guī)定，文獻(xiàn)里面也是多種多樣。小編查詢了一些文獻(xiàn)，總結(jié)了以下的幾種書寫方式，希望對(duì)大家有所幫助。

基因工程小鼠的一般簡寫方式

1.基因敲除
用加、減號(hào)上標(biāo)來表示（上標(biāo)中“+”代表wild type）。
純合子：Sec16a^-/-。
雜合子：Sec16a^+/-。
野生型：Sec16a^+/+或WT (wild type)。

2.基因敲入
將敲入的元件寫在上標(biāo)里或者直接用「-」連接。（上標(biāo)中“+”代表wild type）
Shh基因E177A點(diǎn)突變雜合子：Shh^E177A/+。
Shh敲入Cre重組酶基因，可寫成Shh^Cre/+，或者也可直接寫成Shh-Cre。
Shh敲入報(bào)告基因EGFP，可寫成Shh^EGFP/+，或者也可直接寫成Shh-EGFP。
對(duì)于在安全位點(diǎn)后敲入的，可按下面的例子進(jìn)行書寫。
Rosa26后敲入CAG-LSL-zsGreen，可寫成R26^{CAG-LSL-zsGreen/+}，或者直接寫成R26-CAG-LSL-zsGreen。當(dāng)該小鼠與Cre小鼠交配后，Cre介導(dǎo)的重組驅(qū)動(dòng)CAG啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄，表達(dá)強(qiáng)的zsGreen熒光，則可寫成R26^{CAG-LSL-zsGreen/+};Dppa3^Cre/+，或者直接寫成R26-CAG-LSL-zsGreen;Dppa3-Cre。

3.條件性基因敲除
Flox小鼠，將flox作為上標(biāo)來表示。（上標(biāo)中“+”代表wild type）
純合子：Tlr5^flox/flox或Tlr5^f/f。
雜合子：Tlr5^flox/+或Tlr5^f/+。
與廣泛表達(dá)Cre或生殖系表達(dá)Cre工具鼠交配所獲得的全身敲除小鼠，可按基因敲除小鼠的規(guī)則來簡寫。

與組織特異性Cre小鼠交配所獲得的條件性敲除小鼠，則需要分別表示。如：
Tlr5^flox/flox小鼠分別與小腸上皮細(xì)胞（IEC）特異性Cre（Vil1-Cre）、DC細(xì)胞特異性Cre（Cd11c-Cre）交配，所獲得的基因敲除純合子小鼠可以分別表示為Tlr5^flox/flox; Vil1-Cre和Tlr5^flox/flox;Cd11c-Cre。如果覺得這樣寫太麻煩，也可表示為Tlr5^ΔIEC和Tlr5^ΔDC。

小編也在一些文獻(xiàn)中看見過其他寫法，如最近的一篇《Nature》中寫的是Lyz2-cre⁺Aars2^fl/fl，Lyz2-cre^–Aars2^fl/fl，此處的“+”、“-”代表的是Cre陽性和Cre陰性，大家閱讀文獻(xiàn)的時(shí)候一定要根據(jù)文章進(jìn)行判斷，注意不要混淆哦~

原文鏈接：https://www.nature.com/articles/s41586-024-07992-y#Sec11

4.轉(zhuǎn)基因
一般直接寫出表達(dá)的基因結(jié)構(gòu)。
Villin promoter驅(qū)動(dòng)EGFP報(bào)告基因的轉(zhuǎn)基因小鼠就可以表示為Vil-EGFP。

關(guān)于基因工程小鼠的命名原則大致先介紹到這里，你掌握了多少呢？收藏本文，需要的時(shí)候再拿出來看看吧！

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上海南方模式生物科技股份有限公司（Shanghai Model Organisms Center, Inc.，簡稱"南模生物"），成立于2000年9月，是一家上交所科創(chuàng)板上市高科技生物公司（股票代碼：688265），始終以編輯基因、解碼生命為己任，專注于模式生物領(lǐng)域，打造了以基因修飾動(dòng)物模型研發(fā)為核心，涵蓋多物種模型構(gòu)建、飼養(yǎng)繁育、表型分析、藥物臨床前評(píng)價(jià)等多個(gè)技術(shù)平臺(tái)，致力于為全球高校、科研院所、制藥企業(yè)等客戶提供全方位、一體化的基因修飾動(dòng)物模型產(chǎn)品解決方案。