郁金香碎色病毒探針?lè)晒舛縍T-PCR試劑盒
Tu lip b reaki ng Pot y vi rus P ro be RT - q P C R K it
產(chǎn)品及特點(diǎn)
本試劑盒可用于檢測(cè)郁金香碎色病毒。郁金香碎色病毒(Tulip breaking Potyvirus , TBV)屬馬鈴薯 Y 病毒科馬鈴薯 Y 病毒屬,只侵染郁金香屬(
Tulipa spp.)和百合屬(
Lilium spp.)植物,導(dǎo)致郁金香和百合的花瓣和葉片出現(xiàn)斑駁的雜色條紋,感染 TBV 的郁金香不 僅表現(xiàn)出花色雜色,而且植株也會(huì)退化。本產(chǎn)品是根據(jù)探針?lè)晒舛?nbsp;RT-PCR 原理開(kāi)發(fā) 的郁金香碎色病毒檢測(cè)試劑盒,它具有下列特點(diǎn):
1. 即開(kāi)即用,用戶(hù)只需要提供樣品 RNA 模板。
2. 引物等組分經(jīng)過(guò)優(yōu)化,靈敏度高。
3. 提供陽(yáng)性對(duì)照,便于區(qū)分假陰性樣品。
4. 特異性高,引物是根據(jù)郁金香碎色病毒 RNA 序列高度保守區(qū)設(shè)計(jì),不會(huì)跟其他 病毒的 RNA 發(fā)生交叉反應(yīng)。
5. 既可用于定性檢測(cè),又可用于定量檢測(cè)。用于定量檢測(cè)時(shí)線(xiàn)性范圍至少為 5 個(gè) 數(shù)量級(jí)。
6. 本產(chǎn)品足夠 50 次 20μL 體系的探針?lè)晒舛?nbsp;RT-PCR 反應(yīng)。
7. 本產(chǎn)品只能用于科研。
成分規(guī)格
產(chǎn)品組成 |
編號(hào) |
規(guī)格 |
2 × OneStep Probe Mix |
021101a |
550 μl |
OneStep Probe Enzyme Mix |
021102b |
55 μl |
DEPC-H2O |
070401 |
1 ml |
熒光模板稀釋液 |
070407 |
1 ml |
郁金香碎色病毒
RT-qPCR 引物-探針混合液 |
1525190yp |
210 μl |
郁金香碎色病毒 RT-qPCR 陽(yáng)性對(duì)照
(1×10E8 拷貝/μL) |
1525190pc |
50 μl |
保存條件
低溫運(yùn)輸,-20℃保存,保存期限為一年。陽(yáng)性對(duì)照需要單獨(dú)放置,不要污染其他試 劑。
使用方法
一、RNA 提取(樣本制備區(qū))
用自選方法提取純化樣品 RNA,本試劑盒跟市場(chǎng)上大多數(shù)核酸提取試劑盒兼容。建 議使用病毒基因組 DNA/RNA 提取試劑盒(Cat:GZ010702-50)提取 RNA。
二、稀釋標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)樣品(樣本制備區(qū))
(由于陽(yáng)性對(duì)照濃度高,因此下列稀釋操作一定要在獨(dú)立的區(qū)域進(jìn)行,避免污染樣 品或本試劑盒的其他成分)。
1. 標(biāo)記 6 個(gè)離心管,分別為 7 ,6 ,5 ,4 ,3 ,2。
2. 用帶芯槍頭分別加入 45 μL 熒光模板稀釋液,(最好用帶芯槍頭,下同)。
3. 在 7 號(hào)管中加入 5 μL 1×10E8 拷貝/μL 的陽(yáng)性對(duì)照(試劑盒提供),充分震蕩 1 分鐘, 得 1×10E7 拷貝/μL 的標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)樣品。放冰上待用。
4. 換槍頭,在 6 號(hào)管中加入 5 μL 1×10E7 拷貝/μL 的陽(yáng)性對(duì)照(上步稀釋所得),充分震 蕩 1 分鐘,得 1×10E6 拷貝/μL 的標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)樣品。放冰上待用。
5. 換槍頭,在 5 號(hào)管中加入 5 μL 1×10E6 拷貝/μL 的陽(yáng)性對(duì)照(上步稀釋所得),充分震 蕩 1 分鐘,得 1×10E5 拷貝/μL 的標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)樣品。放冰上待用。
6. 重復(fù)上面的操作直到得到 6 個(gè)稀釋度的標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)樣品。放冰上待用。 若無(wú)需制作標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn),將陽(yáng)性對(duì)照稀釋到 1×10E5 拷貝/μL 即可。
三、試劑配制(試劑準(zhǔn)備區(qū))
若有 N 個(gè)待檢樣品,準(zhǔn)備 N+2 個(gè) qPCR 管(N 個(gè)待檢樣品+1個(gè)陰性對(duì)照+6 個(gè)陽(yáng)性對(duì) 照) ,向各 qPCR 管中分別加入下列成分。
成分 |
樣品管 N+2 個(gè) |
qPCR 陰性對(duì)照 |
qPCR 陽(yáng)性對(duì)照 |
2 × OneStep Probe Mix |
各 10 μL |
10 μL |
10 μL |
OneStep Probe Enzyme Mix |
各 1 μL |
1 μL |
1 μL |
郁金香碎色病毒 RT-qPCR 引物-探針 混合液 |
各 4 μL |
4 μL |
4 μL |
轉(zhuǎn)移至樣本準(zhǔn)備區(qū)。
四、添加模板(模板添加區(qū))
向 qPCR 管中分別加入 5 μl 模板,順序?yàn)殛幮詫?duì)照(DEPC-H2O)、待測(cè)樣品模板、 郁金香碎色病毒 RT-qPCR 陽(yáng)性對(duì)照,離心 30 秒,立即進(jìn)行擴(kuò)增反應(yīng)。
五、擴(kuò)增反應(yīng)(擴(kuò)增及產(chǎn)物分析區(qū))
將 qPCR 管放置在 qPCR 擴(kuò)增儀器樣品槽相應(yīng)位置,進(jìn)行擴(kuò)增,擴(kuò)增程序如下:
過(guò)程 |
溫度 |
時(shí)間 |
逆轉(zhuǎn)錄 |
50℃ |
20 min |
預(yù)變性 |
95℃ |
3 min |
qPCR 反應(yīng) (45 個(gè)循環(huán)) |
95℃ |
15 sec |
60℃ |
20 sec |
信號(hào)通道 |
FAM 通道采集熒光信號(hào) |
六、結(jié)果分析
1. 如果制作標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn),則以陽(yáng)性對(duì)照濃度的 log 值為橫軸,以 Ct 值為縱軸,繪制 標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)。再以待測(cè)樣品的 Ct 值從標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)上推算出樣品 RNA 濃度的 log 值,推算出 其濃度。
2. 如果未制作標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn),按照如下標(biāo)準(zhǔn)判定結(jié)果:
陽(yáng)性對(duì)照(1×10E5 拷貝/μL)結(jié)果:Ct 值<30 ,有明顯指數(shù)增長(zhǎng),呈典型的 S 型曲 線(xiàn)。
陰性對(duì)照結(jié)果:Ct 值>40 或無(wú) Ct 值,無(wú)明顯指數(shù)增長(zhǎng)期和平臺(tái)期。
樣本檢測(cè)結(jié)果:Ct 值<38 ,有明顯指數(shù)增長(zhǎng),表明樣本中檢測(cè)出該病毒,結(jié)果為陽(yáng) 性;Ct 值>40 或無(wú) Ct 值,表明樣本中未檢測(cè)出該病毒,結(jié)果為陰性;Ct 值在38-40 范 圍,應(yīng)對(duì)樣本進(jìn)行復(fù)檢,如重復(fù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果 Ct 值仍在 38-40 范圍,有明顯指數(shù)增長(zhǎng),則判 定為陽(yáng)性,否則為陰性。
關(guān)聯(lián)產(chǎn)品
產(chǎn)品編號(hào) |
產(chǎn)品名稱(chēng) |
010702-50 |
病毒基因組 DNA/RNA 提取試劑盒(離心柱型) |
020701-1 |
2 ×Probe qPCR Mix |
020801-1 |
2×SYBR qPCR Mix |