Origins高分辨率潛水電泳儀助力病原微生物流行病學(xué)研究
瀏覽次數(shù):602 發(fā)布日期:2024-6-5
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文獻速遞|Origins高分辨率潛水電泳儀助力病原微生物流行病學(xué)研究
【Microorganisms】Spatial and Temporal Variability in Prevalence Rates of Members of the Borrelia burgdorferi Species Complex in Ixodes ricinus Ticks in Urban, Agricultural and Sylvatic Habitats in Slovakia
在斯洛伐克城市、農(nóng)業(yè)和洞穴棲息地中,蓖麻硬蜱對伯氏疏螺旋體復(fù)合體感染率的時空特異性
萊姆病(Lyme borreliosis ,LB)是歐洲最常見的蜱傳人類感染性疾病,近幾十年來發(fā)病率不斷上升。該病以蜱為媒介,由伯氏疏螺旋體(Bbsl)所致的自然疫源性疾病。在歐洲全域,特別是斯洛伐克,已觀察到大量的蓖麻硬蜱種群,成為病原體伯氏疏螺旋體(Bbsl)復(fù)合體的主要媒介。了解感染性疾病的傳播途徑對實施有效的控制措施至關(guān)重要。
本研究聚焦于斯洛伐克,從代表城市/郊區(qū)、自然和農(nóng)業(yè)棲息地的三個地點尋找感染伯氏疏螺旋體(Bbsl)的蓖麻硬蜱種群,調(diào)查Bbsl的感染率及其物種多樣性的時空特異性。在布拉迪斯拉發(fā)鎮(zhèn)(城市/郊區(qū)棲息地)、小喀爾巴阡山脈(自然棲息地)和斯洛伐克東部農(nóng)業(yè)棲息地,通過拖拽植被采集蓖麻硬蜱若蟲和成蟲。用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)檢測蜱體內(nèi)是否存在疏螺旋體,并用限制性片段長度多態(tài)性(RFLP)鑒定Bbsl種群。用反向線性印跡法(Reverse Line Blotting ,RLB)鑒定共感染蜱中的伯氏疏螺旋體類型,從而獲得不同環(huán)境中蓖麻硬蜱攜帶伯氏疏螺旋體的真實情況。
- 期刊:Microorganisms
- 發(fā)表年份:2023年
- 樣本:蓖麻硬蜱(Ixodes ricinus Ticks)
- 應(yīng)用:限制性片段長度多態(tài)性(restriction fragment length polymorphism ,RFLP)
文中使用限制性片段長度多態(tài)性(RFLP)分析鑒定Bbsl種群類型,具體通過Origins高分辨率潛水電泳儀結(jié)合Spreadex gel EL300 mini預(yù)制膠,以核酸片段分布圖譜確定Bbsl種群及亞種。
不同環(huán)境類型中,蓖麻硬蜱若蟲和成蟲對伯氏疏螺旋體的感染率
在探索的棲息地中,蜱蟲感染伯氏疏螺旋體在空間和時間上存在顯著差異。總感染率最低的是城市/郊區(qū)棲息地,而自然和農(nóng)業(yè)棲息地的感染率較高。RFLP在每個環(huán)境類型中檢測到6種Bbsl,包括B. burgdorferi sensu stricto (s.s.), B. afzelii, B. garinii, B. valaisiana,B. lusitaniae 和 B. spielmanii。其中,共感染占總感染數(shù)量的3%。通過RLB和測序鑒定出B. kurtenbachii與B. burgdorferi s.s,B. garinii 和B. valaisiana存在共感染的情況。這是首次在斯洛伐克和歐洲的蓖麻硬蜱調(diào)研中發(fā)現(xiàn)B.kurtenbachii。同時在若蟲和成蟲之間、不同年份之間以及不同生物環(huán)境類型之間,發(fā)現(xiàn)了Bbsl物種比例的變化。在城市棲息地相對距離較短的地點之間,Bbsl物種的流行模式和比例也存在空間差異。伯氏疏螺旋體感染率和分布的時空特異性可能與當(dāng)?shù)丨h(huán)境條件和脊椎動物宿主譜有關(guān)。由于存在對人類致病的伯氏疏螺旋體類型,所有探索的地點都可以被列為具有高流行病學(xué)風(fēng)險的地區(qū)。
Kazimírová, Mária, et al. "Spatial and Temporal Variability in Prevalence Rates of Members of the Borrelia burgdorferi Species Complex in Ixodes ricinus Ticks in Urban, Agricultural and Sylvatic Habitats in Slovakia." Microorganisms 11.7 (2023): 1666.
Origins高分辨率潛水電泳來自奧地利AL-Labortechnik公司,集成了整體的溫度控制系統(tǒng),即通過半導(dǎo)體元件和自動溫度控制系統(tǒng),精準(zhǔn)控制電泳過程中的溫度。同時整合循環(huán)泵系統(tǒng),確保整個電泳區(qū)域溫度和pH值恒定,形成均勻的、線性電場,這使得該設(shè)備具有高分辨率和高重復(fù)性,可廣泛用于植物、微生物物種的分群和鑒定,以及疾病相關(guān)基因的研究等。
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