2. hDPSCs和hPDLSCs的聚類和基因表達分析
這是從聚類和基因表達分析中推斷出來的。因此，通過整合細(xì)胞周期基因，消除了細(xì)胞周期效應(yīng)（圖2A、B、F、G）。然后，我們進行了細(xì)胞聚類分析。鑒定出三個hDPSCs和hPDLSCs亞群（圖2C和H）。牙髓簇0無明顯變化趨勢。髓狀簇1為成骨和成牙性簇，表達DCN、COL1A1、COL1A2、 FN1和VCAN。簇2表達S100A4、NEFM、NEFL、COL4A1和神經(jīng)絲組裝束相關(guān)基因集。NEFL、NEFM和S100A4基因參與了神經(jīng)細(xì)胞的延長或延伸（圖2D和E）。肌成纖維細(xì)胞相關(guān)基因在PDL簇1中表達。成骨和成骨細(xì)胞發(fā)育基因（COL8A1、COL11A1和COL4A1）也在PDL聚類1中表達。DCN、POSTN、RUNX2和SOX4在PDL簇2中表達。COL3A1、COL1A1、COL1A2、COL12A1、COL5A2、COL6A3、COL6A1、COL14A1、COL3A1、COL11A11在PDL簇2中表達（圖2I和J）。
 

3. hDPSCs與hPDLSCs特征基因表達的評價
hDPSCs和hPDLSCs都被降維定位，每個細(xì)胞形成單獨的簇（圖3A）。GO分析采用DEG分析，hDPSCs與hPDLSCs之間的差異表達基因如圖3B所示。hDPSCs的GO項如圖3C所示。hPDLSCs的GO分析結(jié)果顯示了生物過程、分子功能和細(xì)胞成分類別中的細(xì)胞外基質(zhì)和膠原相關(guān)（圖3D）。與GO數(shù)據(jù)一致的是，大多數(shù)類型的膠原在hPDLSCs中高表達，而COL4和COL5在hDPSCs中高表達（圖3E）。
 

hDPSCs表現(xiàn)出相對較高的神經(jīng)源性和內(nèi)源性評分，而hPDLSCs表現(xiàn)出較高的成骨、軟骨源性和血管內(nèi)皮生長因子家族表達評分（圖4A）。此外，我們在單細(xì)胞水平上評估了細(xì)胞類型注釋；hDPSCs（圖4B）占各種干細(xì)胞的64.9%和0.1%的神經(jīng)元。hPDLSCs（圖4C)包括44.3%成纖維細(xì)胞，10.6%軟骨細(xì)胞，成骨細(xì)胞0.1%。
 

參考文獻：
[1] Lee S , Dds D C , Munsu Park M S ,et al.Single cell RNA sequencing analysis of human dental pulp stem cells and human periodontal ligament stem cells[J].  2021.