600nm波長處的光密度(OD600)可反映細菌和酵母等微生物的生長信息。更具體地說,反映種群中微生物數(shù)量隨時間的變化情況。
微生物生生長曲線
監(jiān)測微生物種群隨時間的變化,可繪制出一條生長曲線(圖1),分為四個生長階段:
遲緩期
Lag phase
少量微生物被置入培養(yǎng)基(接種)開始培養(yǎng)后,需要一段時間適應新環(huán)境。在此期間不會發(fā)生分裂,種群密度保持不變。
對數(shù)期
Log phase
當微生物適應了新的環(huán)境,就會開始增殖。細胞數(shù)量在一段時間內(nèi)以幾何級數(shù)增加。對數(shù)期是微生物分裂最活躍的時期,可用于進一步計算倍增時間和生長速率等參數(shù)。
穩(wěn)定期
Stationary phase
微生物的増殖受到培養(yǎng)基中營養(yǎng)物質(zhì)的限制。一旦碳源或其他必需成分消耗殆盡,就會停止分裂。微生物生長曲線在這一階段的特點表現(xiàn)為微生物種群密度穩(wěn)定保持在較高水平。
衰亡期
Death phase
隨著營養(yǎng)物質(zhì)、鹽、氨基酸的耗盡,以及酸或乙醇等有害廢物的積累,微生物培養(yǎng)環(huán)境條件惡化,微生物種群開始衰亡。這表現(xiàn)為微生物密度整體呈下降趨勢。
圖1:微生物生長曲線。分批培養(yǎng)中微生物數(shù)量的典型變化過程。
利用OD600測量微生物生長的原理
OD600基于吸收光檢測,測量的是穿過樣品,即微生物懸液的光。透射光與微生物的生長有什么關系?由于溶液中的微粒會產(chǎn)生散射光,微粒(微生物)越多,散射的光就越多。因此,隨著細菌或酵母數(shù)量成倍增長,光散射程度和測量的吸光度值會變大。同時,這意味著只是通過吸收光模式測定光散射的程度,而不是衡量分子對光的選擇性吸收。這一點至關重要:OD600實際上測量的是散射引起的透射光損失,而不是吸光度!
多種生物和醫(yī)學研究領域都要用到有關微生物生長的信息:
抗生素耐藥性
感染多重耐藥病原體的人數(shù)和因感染而死亡的人數(shù)不斷增加。亟需開發(fā)新型藥物或方法,來控制這些病原體。在新抗菌藥物的研發(fā)過程中,要用到OD600評估其對微生物生長的抑制作用,以確定藥物的有效性。
微生物生產(chǎn)
微生物本身可以成為工業(yè)產(chǎn)品,可用于生產(chǎn)烘焙食品或奶酪等,還可用于生產(chǎn)酶、抗生素、維生素等產(chǎn)品。對于這兩種用途,都需要在過程初始對生長特性等方面進行菌種優(yōu)化。生產(chǎn)過程一經(jīng)建立,就需要進行微生物監(jiān)測。同樣,要用到OD600監(jiān)測過程中的微生物生長情況。
合成生物學
使用基因工程經(jīng)典方法來構建具有預定特性的生物系統(tǒng)。這意味著要對生物 “機器”進行合理設計,包括對基因進行高度改造,甚至是改造成完全人工基因組。其目的是生產(chǎn)出石化產(chǎn)品替代品,如生物燃料或塑料,以及能感知污染物或降解塑料的微生物產(chǎn)品。常用的微生物有大腸桿菌(E. coli)和釀酒酵母菌(S. Cerevisiae)等,需要通過OD600監(jiān)測其生長情況。
用OD600檢測微生物生長的注意事項
如前所述,OD600測量的是散射光,而非吸收光。理論上,描述吸光度與吸收分子濃度線性關系的朗伯-比爾定律不適用于OD600測量。但實踐證明,盡管不使用吸光度,比爾-朗伯定律仍適用于低密度培養(yǎng)物。換句話說,OD600值可以直接與極低密度懸液中的微生物數(shù)量相關。對于密度較高的培養(yǎng)物,OD600的測量結果呈拋物線狀。只有將OD600值與一系列微生物數(shù)量進行校準后,才能計算出這種培養(yǎng)物中的微生物數(shù)量。
選擇比色皿還是微孔板?
如果要對大容量的樣品進行過程監(jiān)測,推薦使用比色皿。每隔一定時間(如1小時)取樣一次,測定微生物的種群密度。每次檢測需要約1.5ml微生物懸液,并且需要留出一定時間進行樣品抽。▓D2)。
圖2:從酵母發(fā)酵罐中取樣。
微孔板則用于微生物生長的持續(xù)監(jiān)測。只需200µl懸液,以設定的時間間隔自動檢測生長過程。通常使用的是96孔板 ,非常適合多種樣品的重復測量,以及比較不同的培養(yǎng)基條件或菌株。對于中高通量應用,可實現(xiàn)流程自動化。
如何選擇檢測儀器?
以吸收光模式測定顆粒的光散射時,使用不同的儀器得出的結果可能會有所差異。原因在于光束的類型不同,探測器與樣品的距離也不同?梢韵胂,當通過微生物的光束發(fā)生散射,距離較近的探測器更容易捕捉到光線,而距離較遠的探測器則有可能捕捉不到(圖3)。因此,建議使用可用OD600來檢測微生物生長過程的一系列專用儀器。
圖3:不同的檢測儀器會產(chǎn)生不同的結果。該圖展示探測器位置的影響:在尺寸相同的情況下,距離樣品較近的探測器可檢測到散射光,而距離樣品較遠的探測器則檢測不到光信號。
顯然,比色皿或微孔板的使用限制了選擇范圍,二者分別對應分光光度計和酶標儀。但像SPECTROstar® Nano這種兼具比色皿和微孔板檢測能力的儀器,可以滿足您當下和未來的所有需求(圖4)。
圖4:BMG LABTECH的SPECTROstar® Nano是一款帶有比色皿端口的酶標儀。
什么情況下需要校準?
如果需要用OD600值來確定溶液中的微生物數(shù)量/濃度(如每毫升的微生物數(shù)量),或者需要對OD600散射測量的非線性性質(zhì)進行校正,需要進行校準。為了進行測量,需要制備已知微生物濃度的微生物懸浮液,并使用與后續(xù)實驗相同的樣品量在所選儀器上測量OD600。用測量值生成校準曲線,隨后可將未知樣品的OD600值與該曲線相關聯(lián),并反算出濃度。由于光散射會隨著顆粒大小和形狀的變化而變化,因此對每種微生物都要進行校準。同樣,在更換分析儀器或樣品量時也需要進行校準。
OD600測量的前景
利用微孔板測量OD600的方法越來越多地與發(fā)光或熒光等檢測模式相結合。微生物生長測量值可用于其他檢測法的歸一化處理。例如在《核酸研究》(Nucleic Acids Research)期刊發(fā)表的一篇文章中,一項研究使用 CLARIOstar® 多功能酶標儀測量金/黃/色/葡/萄/球/菌(Staphylococcus aureus)的翻譯。使用熒光模式測量了β-半乳糖苷酶報告基因,并將表示酶活性的信號歸一化為OD600。另一個例子是使用化學發(fā)光法檢測單核細胞增生李斯特氏菌(L. monocytogenes)基因表達,并將其歸一化為OD600值。
檢測微生物生長的其他方法
散射比濁法
利用散射比濁法檢測微生物生長也是基于光散射原理。與測量散射導致的透射損失的OD600值不同,散射比濁法直接檢測散射光。這是BMG LABTECH的NEPHELOstar® Plus(圖5)的強項。與基于吸光度模式的方法相比,散射比濁法的靈敏度更高,可檢測顆粒數(shù)量較低的樣品,因此適用于檢測微生物數(shù)量極少的懸液。
圖5:BMG LABTECH的NEPHELOstar® Plus是微孔板散射濁度儀,適用于檢測微生物數(shù)量極少的懸液。
穩(wěn)定熒光團表達
由相關微生物穩(wěn)定表達的熒光團(如GFP或RFP)也能夠反映微生物的生長情況。熒光強度與熒光團濃度呈線性關系。可通過VANTAstar® 等熒光酶標儀對熒光信號的變化進行檢測(圖6)。
圖6:BMG LABTECH的VANTAstar®屬于多功能酶標儀,可用于熒光檢測。
使用BMG LABTECH酶標儀進行微生物研究
酶標儀為微生物生長檢測提供了更多可能性。如果您想進一步了解BMG LABTECH為微生物研究制定的解決方案,請通過文末的“閱讀原文”閱讀或下載我們的微生物檢測手冊。
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