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用于材料設(shè)計和制造的下一代智能實驗室介紹

瀏覽次數(shù):1120 發(fā)布日期:2023-12-15  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責任自負
編者按

   跟蹤智慧實驗室的理論研究發(fā)展狀況、產(chǎn)業(yè)發(fā)展動態(tài)、主要設(shè)備供應(yīng)商產(chǎn)品研發(fā)動態(tài)、國內(nèi)外智慧實驗室建設(shè)成果現(xiàn)狀等信息內(nèi)容。本文由中科院上海生命科學信息中心與曼森生物合作供稿。

本期“前沿技術(shù)”欄目,編譯了 Xiting Peng 等發(fā)表在 MRS Bull.期刊上的綜述論文《用于材料設(shè)計和制造的下一代智能實驗室》(Next-generation intelligent laboratories for materials design and manufacturing),作者介紹了這一新研究范式的基本概念和基礎(chǔ),通過案例研究展示了其典型的應(yīng)用場景,并展望了未來的協(xié)同人機元實驗室。

 

目錄

01/前言
02/智能實驗室基礎(chǔ)
   2.1具有實驗計劃的高通量實驗
   2.2理論計算
   2.3人工智能實驗室
   2.4自動化實驗硬件
03/智能實驗室的應(yīng)用場景
   3.1材料配方和合成條件的探索
   3.2有機合成智能實驗室
   3.3完全自主的催化劑設(shè)計實驗室
04/智能實驗室的未來發(fā)展方向

 

01 前言

從清潔能源到人類福利甚至國家安全,先進材料對社會發(fā)展至關(guān)重要。然而, 事實是,材料的開發(fā)過程非常漫長。一種新材料從發(fā)現(xiàn)到部署需要經(jīng)歷許多步驟, 通常需要幾十年的時間。另一方面,隨著改進材料的不斷探索,材料的復雜性也在增加。僅僅幾個參數(shù)的組合就可以產(chǎn)生巨大的搜索空間, 這是傳統(tǒng)手工實驗無法充分探索的。 
各種技術(shù)已被應(yīng)用于加速材料開發(fā),其中包括四種科學研究范式(圖 1)。高通量實驗技術(shù)使實驗的規(guī)模和效率不斷提高。通過數(shù)據(jù)庫存儲計算結(jié)果的理論計算方法,可以在計算機上快速進行篩選。數(shù)據(jù)科學相關(guān)技術(shù),特別是機器學習, 在材料科學中產(chǎn)生了數(shù)據(jù)驅(qū)動的發(fā)現(xiàn)。在這種情況下,提出了自動駕駛實驗室或自主實驗系統(tǒng)的概念。

 

圖 1 展示與下一代智能實驗室相關(guān)的四種研究范式。智能實驗室不是一項新技術(shù),而是一個涉及材料研究各個方面的系統(tǒng)。


02  智能實驗室基礎(chǔ)

2009 年,一位名叫 Adam 的機器人科學家在釀酒酵母中發(fā)現(xiàn)功能基因。它使用自動化硬件和軟件系統(tǒng),在沒有人類干預(yù)的情況下反復制定假設(shè)、設(shè)計實驗和解釋結(jié)果。2020 年開發(fā)的一款移動機器人化學家采用了一種更先進的方法, 使用貝葉斯優(yōu)化來引導靈巧的漫游機器人通過實驗室,自主尋找改進的水制氫光催化劑。這兩種情況都遵循圖 2 所示的工作流程。
 

圖 2 智能實驗室的一般工作流程。系統(tǒng)的定義是手動完成的,而實驗計劃和進行的過程是完全自主的。

 

2.1具有實驗計劃的高通量實驗

實驗統(tǒng)計設(shè)計(DOE)是一種早期應(yīng)用于實驗規(guī)劃的方法,通過系統(tǒng)抽樣和 測試來分析多個自變量之間的相互關(guān)系及其對因變量的影響。當自變量數(shù)量較少且它們之間的關(guān)系相對簡單時,這是一種強大的方法。隨后,早期的人工智能(AI)方法和先進的優(yōu)化算法開始應(yīng)用于材料科學,以解決更復雜的問題。例如,全局單目標優(yōu)化算法 SNOBFIT 可以在沒有理論模型的情況下進行優(yōu)化,并已用于化學反應(yīng)的優(yōu)化。一些多目標優(yōu)化方法,如 TSEMO 和 MOAL,也已被開發(fā)用于沖突目標之間的權(quán)衡。隨著人工智能的發(fā)展,主動學習和強化學習技術(shù)已開始用于材料研究。


2.2理論計算

理論計算可以被認為是實驗吞吐量的進一步擴展,并在一些國家級材料加速計劃中得到了強調(diào),如材料基因組計劃(MGI)。通過高通量計算,研究人員可以在不進行實驗的情況下探索更大范圍的化學空間,并直接在計算機上進行虛擬篩選。與數(shù)據(jù)驅(qū)動的機器學習模型給出的預(yù)測不同,理論計算的結(jié)果直接來自基本物理原理,被認為更可靠、更具物理解釋性,而且計算時間更長。因此,創(chuàng)建了大型計算材料數(shù)據(jù)庫,以存儲理論計算的結(jié)果并減少重復計算。機器學習方法通過引入動態(tài)訓練的代理模型來加快理論計算的搜索過程。在之前的工作中,理論計算也可以直接添加到主動學習循環(huán)中,以實現(xiàn)自我改進的材料發(fā)現(xiàn)。


2.3人工智能實驗室
人工智能對智能實驗室的最大貢獻在于人工智能規(guī)劃,它作為系統(tǒng)的“計算大腦”存在,以指導下一個實驗?紤]到深度學習(DL)方法是人工智能的另一個重要組成部分,它通常涉及構(gòu)建和訓練數(shù)據(jù)密集型模型,這些模型似乎與“更高效的實驗”的目標不匹配,因此很難將其直接應(yīng)用于智能實驗室。但它仍然可以在各個方面發(fā)揮作用。

2.4自動化實驗硬件
自動化技術(shù)是物理儀器和計算核心之間的橋梁,它決定了可以應(yīng)用閉環(huán)自主 研究范式的任務(wù)范圍。可以強調(diào)的是,自動化和數(shù)字化意義重大:標準化操作和全面的數(shù)據(jù)記錄。材料很復雜,合成條件的微小變化或手動實驗過程中可能忽略的一些因素(如實驗室溫度和濕度、樣品純度)可能會對實驗產(chǎn)生很大影響。另 一方面,盡管出版物中只報道了最成功的實驗結(jié)果,但失敗的實驗往往包含化學直覺,這些信息的收集和使用也有助于材料的發(fā)現(xiàn)。因此,未來的實驗室需要數(shù)字化記錄和整合實驗中的所有信息。

 

3.智能實驗室的應(yīng)用場景
 

3.1 材料配方和合成條件的探索

智能實驗室的經(jīng)典應(yīng)用場景可以歸結(jié)為通過優(yōu)化材料的配方或合成條件來 實現(xiàn)最佳性能,無論這些材料是碳納米管、金納米顆粒、量子點、薄膜材料,或亞穩(wěn)態(tài)材料。材料的合成表征周期通常是固定的,可以在單個機器人平臺甚至單個儀器上完成。困難在于大量可用的處理參數(shù)對它們的關(guān)系知之甚少,使用人工智能驅(qū)動的自動化實驗平臺可以更有效地探索這些參數(shù)。

 

3.2 有機合成智能實驗室

智能實驗室的研究范式也可以應(yīng)用于有機合成。對于每個反應(yīng),都需要大量的重復實驗來找到最佳的反應(yīng)條件,以獲得最大的產(chǎn)率并使副產(chǎn)物最小化。Angello 等人為雜芳基 Suzuki Miyaura 偶聯(lián)反應(yīng)的一般反應(yīng)條件設(shè)計了一個閉環(huán)優(yōu)化過程。首先通過數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)選擇襯底,然后將不確定性最小化 ML 和機器人實驗相結(jié)合,進行迭代測試,以優(yōu)化反應(yīng)條件。發(fā)現(xiàn)了使目前廣泛使用的條件的平均產(chǎn)率加倍的反應(yīng)條件,并且與先前報道的條件相比,通用性也顯示出統(tǒng)計學上顯著的增加。該工作流程提高了反應(yīng)優(yōu)化的效率,而有機合成過程通常涉及不同類型的反應(yīng),并且不同反應(yīng)的優(yōu)化需要系統(tǒng)的可重構(gòu)性。Bédard 等人開發(fā)了 一種即插即用、連續(xù)流動的化學合成系統(tǒng)。該系統(tǒng)高度集成,可以根據(jù)需要以簡單的方式選擇和配置不同的模塊化單元操作和分析方法。反應(yīng)條件的優(yōu)化是自動進行的,并且提供了用戶友好的界面以達到高可用性。該系統(tǒng)的能力已經(jīng)在幾個廣泛使用的單步和兩步反應(yīng)中得到了證明。

 

3.3 完全自主的催化劑設(shè)計實驗室

盡管為特定任務(wù)構(gòu)建自主實驗平臺并不具有挑戰(zhàn)性,但應(yīng)用范圍有限。幾項努力旨在建立一個能夠執(zhí)行多項研究任務(wù)的完全自主的實驗室。建造這樣一個平臺當然很耗時,但一旦這樣一個實驗室全面投入使用,其好處仍然很大。Burger 等人提出了一項具有里程碑意義的工作,命名為移動機器人化學家。一個帶有機械臂的移動機器人平臺被用來模仿人類行為。借助激光掃描與觸摸反饋相結(jié)合的精細定位,該平臺可以像人一樣在實驗室中自由移動,抓取和轉(zhuǎn)移樣品瓶,并在不修改物理硬件的情況下操作商業(yè)儀器。整個實驗過程由八個工作站完成。通過使用分批貝葉斯算法來優(yōu)化催化劑配方,在 688 次實驗后確定了具有比初始配方高六倍活性的光催化劑混合物。

 

4.智能實驗室的未來發(fā)展方向
 

科學研究總是關(guān)心從實驗中獲得的數(shù)據(jù),而不是物理樣本本身。因此,研究人員可以在物理上與他們的實驗儀器和樣本分離。新冠肺炎大流行影響了全球的科學研究,在社交距離時代,實驗室操作數(shù)字化的需求變得更加迫切。智能實驗室的概念為我們提供了一個前景,即我們可以使用云計算、物聯(lián)網(wǎng)和區(qū)塊鏈等數(shù)字技術(shù)重新定義科學研究,構(gòu)建完全映射物理實驗室的“元實驗室”。未來的實驗研究可以在資源充足的大型“虛擬研究所”中進行,任何人都可以足不出戶。實驗資源和數(shù)據(jù)的共享將擴大實驗儀器和化學物質(zhì)的使用,使科學更加民主化, 就像天文學和高能物理界一樣。作 為 初 步 階 段 , 已 經(jīng) 建 立 了 一 些 商 業(yè) 云 實 驗 室 , 如 Strateos(https://strateos.com/),致力于藥物發(fā)現(xiàn)和合成生物學,以及翡翠云實驗室 (https://www.emeraldcloudlab.com/),可以進行各種體外生物學或化學實驗。研究人員可以通過軟件界面或網(wǎng)絡(luò)瀏覽器控制多臺設(shè)備,而無需購買自己的儀器。它使生物和化學實驗更像是計算實驗,實驗操作的每一步都被翻譯成明確而詳細的代碼,并在不變的環(huán)境中進行,這提供了可重復性。與在生物醫(yī)學領(lǐng)域提供研究外包的合同研究組織不同,在這種研究模式下如何進行實驗仍然是用戶定義的。盡管翡翠云實驗室的創(chuàng)始人承認,使用其設(shè)備并不便宜,但他認為,與購買設(shè)備的成本相比,這是一個省錢的選擇。然而,機器人僅用于取代某些操作過程的研究模式并不是最終目標。人類擅長因果分析和推理,而機器人擅長認知和執(zhí)行。在未來的實驗室中,人類和機器人應(yīng)該合作,最大限度地發(fā)揮彼此的作用。這樣一種有前景的研究范式將在未來的材料開發(fā)中更頻繁地應(yīng)用,為當前的棘手問題提供解決方案。
 

曼森生物合成生物學自動化實驗室


來源:上海曼森生物科技有限公司
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